Job Description P05804 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 117 Aligned Residues 265 % Identity 22% Template c2dgaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of hexameric beta-glucosidase in wheat Resolution 1.80 Å

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		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.					.	.														.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	.	.	.	.	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation																										.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		H	L	Y	E	E	D	V	K	A	L	K	D	M	G	M	K	V	Y	R	F	S	I	S	W	S	R	I	L	P	D	G	T	G	K	V	N	Q	A	G	I	D	Y	Y	N	K	L	I	N	S	L	I	D	N	D	I	V	P	Y	V	T	I	W	H	W	D	T	P	Q	A	L	E	D	K	Y	G	G	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S													T	T	S	S	S	S																			T	T									S	S			B									G	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																									.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	L	N	R	Q	I	V	D	D	Y	K	Q	F	A	E	V	C	F	K	N	F	G	D	R	.	.	V	K	N	W	F	T	F	N	E	P	H	T	Y	C	C	F	S	Y	G	E	G	I	H	A	P	G	R	C	S	P	G	M	D	C	A	V	P	E	G	D	S	L	R	E	P	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T																		T	T	T	.	.																			T	S			S	T	T		B			T	T	S	S	S	S	B			S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template SS confidence
									159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A	H	T	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	H	H	I	L	L	A	H	A	E	A	V	Q	L	F	K	A	R	Y	N	M	H	G	D	S	K	I	G	M	A	F	D	V	M	G	Y	E	P	Y	Q	D	S	F	L	D	D	Q	A	R	E	R	S	I	D	Y	N	M	G	W	F	L	E	P	V	V	R	G	D	Y	P	F	S	M	R	S	L	I	G	D
Template Known Secondary structure																					S		T	T	S																S	S	S	S															T										S	S										G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	K	V	L	E	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	P	M	F	T	K	E	E	Q	E	K	L	A	S	S	C	D	I	M	G	L	N	Y	Y	T	S	R	F	S	K	H	V	D	M	S	P	D	F	T	P	T	L	N	T	D	D	A	Y	A	S	S	E	T	T	G	S	D	G	N	D	I	G	P	I	T	G	T	Y	W	I	Y	M	Y	P	K	G	L	T	D
Template Known Secondary structure		G	S												T	T			S																		S	T	T					S	G	G	G	G	G						S	B		T	T	S		B	S	S		B		S	S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.				.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																																.	.	.
Query SS confidence											.																																.	.	.
Query Sequence		E	L	L	A	W	Q	E	K	L	.	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	.	.	.	A	W	L	D	M	Y	H	R	V	F	D	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V
Query Conservation											.																																.	.	.
Alig confidence											.																																.	.	.																											.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.
Template Sequence		L	L	L	I	M	K	E	K	Y	G	N	P	P	V	F	I	T	E	N	G	I	A	D	V	E	G	D	E	S	M	P	D	P	L	D	D	W	K	R	L	D	Y	L	Q	R	H	I	S	A	V	K	D	A	I	D	Q	G	A	D	V	R	G	H	F	T	W	G	L	I	D	.	.	.	N	F	E	W	S	L	G
Template Known Secondary structure									T	S																T	T		T	T			S	T	T																						T	T											S	B		.	.	.				G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.				460	.	.	.	.	.	.
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.							.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	.	.	.	.	.	.	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T
Query Conservation													.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	S	R	F	G	L	V	Y	I	D	K	N	D	G	N	K	R	K	L	K	K	S	A	K	W	F	S	K	F	N	S
Template Known Secondary structure		G	G					S					T	T	T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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