Job Description P05804 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:58:55 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 572 % Identity 48% Template c1bhgB_ PDB info PDB header:glycosidase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucuronidase; PDBTitle: human beta-glucuronidase at 2.6 a resolution Resolution 2.53 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.				.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.											.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.											.	.	.
Query Sequence		M	L	R	P	V	E	T	P	T	R	E	I	K	K	L	D	G	L	W	A	F	S	L	D	R	E	N	.	.	.	C	G	I	D	Q	R	W	W	E	S	.	.	.	A	L	Q	E	S	R	A	I	A	V	P	G	S	F	N	D	Q	F	A	D	A	D	I	R	N	Y	A	G	N	V	W	Y	Q	R	E	V	F
Query Conservation																													.	.	.											.	.	.
Alig confidence																													.	.	.											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	L	Y	P	Q	E	S	P	S	R	E	C	K	E	L	D	G	L	W	S	F	R	A	D	F	S	D	N	R	R	R	G	F	E	E	Q	W	Y	R	R	P	L	W	E	S	G	P	T	V	D	M	P	V	P	S	S	F	N	D	I	S	Q	D	W	R	L	R	H	F	V	G	W	V	W	Y	E	R	E	V	I
Template Known Secondary structure							S	S	S	S			B					S									S	S	S	S		T	G	G	G	G	T	T	T	S	S						S							S	S	B		G	G	G	T	S	S		S	T	T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		75	.	.	.	.	80				.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.				.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																																														.	.	.
Query SS confidence								.	.	.																																														.	.	.
Query Sequence		I	P	K	G	W	A	.	.	.	G	Q	R	I	V	L	R	F	D	A	V	T	H	Y	G	K	V	W	V	N	N	Q	E	V	M	E	H	Q	G	G	Y	T	P	F	E	A	D	V	T	P	Y	V	I	A	G	.	.	.	K	S	V	R	I	T	V	C	V	N	N	E	L	N	W	Q	T	I	P	P	G	M	V
Query Conservation								.	.	.																																														.	.	.
Alig confidence								.	.	.																																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	E	R	W	T	Q	D	L	R	T	R	V	V	L	R	I	G	S	A	H	S	Y	A	I	V	W	V	N	G	V	D	T	L	E	H	E	G	G	Y	L	P	F	E	A	D	I	S	N	L	V	Q	V	G	P	L	P	S	R	L	R	I	T	I	A	I	N	N	T	L	T	P	T	T	L	P	P	G	T	I
Template Known Secondary structure				G	G	G	S	S	S	T	T	S	B					B	S			S	S							T	T									S	S			B				S	S		T	T		S	S		T	T															T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
								149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																															.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																															.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	I	T	D	E	N	G	K	K	K	Q	S	Y	F	H	D	F	F	N	Y	A	G	I	H	R	S	V	M	L	Y	T	T	P	N	T	W	V	D	D	I	T	V	V	T	H	V	A	Q	D	C	N	H	A	S	V	D	W	Q	V	V	A	N	G	.	.	D	V	S	V	E	L	R	D	A	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																															.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																															.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	L	T	D	T	S	K	Y	P	K	G	Y	F	V	Q	N	T	Y	F	D	F	F	N	Y	A	G	L	Q	R	S	V	L	L	Y	T	T	P	T	T	Y	I	D	D	I	T	V	T	T	S	V	E	Q	D	S	G	L	V	N	Y	Q	I	S	V	K	G	S	N	L	F	K	L	E	V	R	L	L	D	A	E
Template Known Secondary structure							S	S	S	S		T	T								S	S	S					S	B		S		B		B			B		S	S				B					B			S	S	S	S	B		B					B				S	S									B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.						.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.					.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	V	V	A	T	G	Q	G	T	S	G	T	L	Q	V	V	N	P	H	L	W	Q	P	.	.	.	.	.	G	E	G	Y	L	Y	E	L	C	V	T	A	K	S	.	.	.	.	Q	T	E	C	D	I	Y	P	L	R	V	G	I	R	S	V	A	V	K	G	E	Q	F	L	I	N	H	K	P	F	Y	F	T
Query Conservation																										.	.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	V	V	A	N	G	T	G	T	Q	G	Q	L	K	V	P	G	V	S	L	W	W	P	Y	L	M	H	E	R	P	A	Y	L	Y	S	L	E	V	Q	L	T	A	Q	T	S	L	G	P	V	S	D	F	Y	T	L	P	V	G	I	R	T	V	A	V	T	K	S	Q	F	L	I	N	G	K	P	F	Y	F	H
Template Known Secondary structure		S		B				B		S	S	S					B		S							T	T	S	S	S	S		S														S	S																				S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	G	R	H	E	D	A	D	L	R	G	K	G	F	D	N	V	L	M	V	H	D	H	A	L	M	D	W	I	G	A	N	S	Y	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	M	L	D	W	A	D	E	H	G	I	V	V	I	D	E	T	A	A	V	G	F	N	L	S	L	G	I	G	F	E	A	G	N	K	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	N	K	H	E	D	A	D	I	R	G	K	G	F	D	W	P	L	L	V	K	D	F	N	L	L	R	W	L	G	A	N	A	F	R	T	S	H	Y	P	Y	A	E	E	V	M	Q	M	C	D	R	Y	G	I	V	V	I	D	E	C	P	G	V	G	L	A	L	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T	T	T	T																		T							T	T	S			S	T							T	T	T									S						S	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	L	Y	S	E	E	A	V	N	G	E	T	Q	Q	A	H	L	Q	A	I	K	E	L	I	A	R	D	K	N	H	P	S	V	V	M	W	S	I	A	N	E	P	D	T	R	P	Q	G	A	R	E	Y	F	A	P	L	A	E	A	T	R	K	L	D	P	T	R	P	I	T	C	V	N	V	M	F	C	D	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	F	N	N	V	S	L	H	H	H	M	Q	V	M	E	E	V	V	R	R	D	K	N	H	P	A	V	V	M	W	S	V	A	N	E	P	A	S	H	L	E	S	A	G	Y	Y	L	K	M	V	I	A	H	T	K	S	L	D	P	S	R	P	V	T	F	V	S	.	.	N	S	N	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	G	G	S																			T	T		T	T									S			T	T	S	T	T													T	T	T		T	T	S							.	.		S		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.
Template SS confidence
									417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.			.	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	T	D	T	I	S	D	L	F	D	V	L	C	L	N	R	Y	Y	G	W	Y	V	Q	S	G	D	L	E	T	A	E	K	V	L	E	K	E	L	L	A	W	Q	E	K	L	H	Q	P	I	I	I	T	E	Y	G	V	D	T	L	A	G	L	H	S	M	Y	T	D	M	W	S	E	E	Y	Q	C	A	W	L	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	A	D	K	G	A	P	Y	V	D	V	I	C	L	N	S	Y	Y	S	W	Y	H	D	Y	G	H	L	E	L	I	Q	L	Q	L	A	T	Q	F	E	N	W	Y	K	K	Y	Q	K	P	I	I	Q	S	E	Y	G	A	E	T	I	A	G	F	H	Q	D	P	P	L	M	F	T	E	E	Y	Q	K	S	L	L	E
Template Known Secondary structure		T	T		S	S	T	T	T		S	S							B	T	T	T	B	S	T	T																						S													T	T				S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
		532	.	.	.	.	.	.			.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		M	Y	H	R	V	F	D	.	.	R	V	S	A	V	V	G	E	Q	V	W	N	F	A	D	F	A	T	S	Q	G	I	L	R	V	G	G	N	K	K	G	I	F	T	R	D	R	K	P	K	S	A	A	F	L	L	Q	K	R	W	T	G	M
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	H	L	G	L	D	Q	K	R	R	K	Y	V	V	G	E	L	I	W	N	F	A	D	F	M	T	E	Q	S	P	T	R	V	L	G	N	K	K	G	I	F	T	R	Q	R	Q	P	K	S	A	A	F	L	L	R	E	R	Y	W	K	I
Template Known Secondary structure											T	T	T	T									S	B		B					B	T	T	B	S	S	S	B				S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.