Job Description P0A8T7 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:19 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 685 % Identity 31% Template c2pmzQ_ PDB info PDB header:translation, transferase Chain: Q: PDB Molecule:dna-directed rna polymerase subunit a; PDBTitle: archaeal rna polymerase from sulfolobus solfataricus Resolution 3.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	E	F	D	A	I	K	I	A	L	A	S	P	D	M	I	R	S	W	S	F	G	E	V	K	K	P	E	T	I	N	Y	R	T	F	K	P	E	R	D	G	L	F	C	A	R	I	F	G	P	V	K	D	Y	E	C	L	C	G	K	Y	K	R	L	K	H	R	G	V	I	C	E	K	C	G	V	E	V	T	Q
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	I	K	G	I	K	F	G	I	L	S	P	D	E	I	R	K	M	S	V	T	A	I	I	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	P	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	I	E	P	G	Q	K	C	P	T	C	G	N	T	L	G	N
Template Known Secondary structure																						S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S		S		S	S	S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30																.	.	.	.	.																.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	V	R	R	E	R	M	G	H	I	E	L	A	S	P	T	A	H	I	W	F	L	K	S	L	P	S	R	I	G	L	L	L	D	M	P	L	R	D	I	E	R	V	L	Y	F	E	S	Y	V	V	I	E	G	G	M	T	N	L	E	R	Q	Q	I	L	T	E	E	Q	Y	L	D	A	L	E	E	F	G	D
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	P	.	.	.	G	H	F	G	H	I	E	L	V	R	P	V	I	H	V	G	L	V	K	H	I	Y	E	F	L	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.									S	S					T	T	T								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		68	.				70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	D	A	K	M	G	A	E	A	I	Q	A	L	L	K	S	M	D	L	E	Q	E	C	E	Q	L	R	E	E	L	N	E	T	N	S	E	T	K	R	K	K	L	T	K	R	I	K	L	L	E	A	F	V	Q	S	G	N	K	P	E	W	M	I	L	T	V	L	P	V	L	P	P	D	L	R	P	L	V	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	T	P	S	D	I	R	E	R	L	E	K	I	P	D	S	D	V	E	I	L	G	Y	D	P	T	T	S	R	P	E	W	M	I	L	T	V	L	P	V	P	P	I	T	I	R	P	S	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S												T	T	T			T	T	T	S	S		S	S						S	T	T	S			.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.
Template SS confidence
																															174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		L	D	G	G	R	F	A	T	S	D	L	N	D	L	Y	R	R	V	I	N	R	N	N	R	L	K	R	L	L	D	L	A	A	P	D	I	I	V	R	N	E	K	R	M	L	Q	E	A	V	D	A	L	L	D	N	G	R	R	G	R	A	.	I	T	G	S	N	K	R	P	L	K	S	L	A	D	M	I	K	G
Query Conservation																																																															.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																							.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	D	D	L	T	H	K	L	V	D	I	V	R	I	N	E	R	L	K	E	S	I	D	A	G	A	P	Q	L	I	I	E	D	L	W	D	L	L	Q	Y	H	V	A	T	Y	F	D	N	E	I	P	G	L	P	P	S	K	H	R	S	G	R	P	L	R	T	L	A	Q	R	L	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																							S	S	S			T	T	T																		S			S	S	S						T	T	S	S					G	G	G	T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	G	R	F	R	Q	N	L	L	G	K	R	V	D	Y	S	G	R	S	V	I	T	V	G	P	Y	L	R	L	H	Q	C	G	L	P	K	K	M	A	L	E	L	F	K	P	F	I	Y	G	K	L	E	L	R	G	L	A	T	T	I	K	A	A	K	K	M	V	E	R	E	E	A	V	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	E	G	R	F	R	G	N	L	S	G	K	R	V	D	F	S	S	R	T	V	I	S	P	D	P	N	I	S	I	D	E	V	G	V	P	E	I	I	A	K	T	L	T	V	P	E	R	I	T	P	W	N	I	E	K	L	R	Q	F	V	I	N	G	P	D	K	W	P	G	A	N	Y	V	I	R	P	D	G	R
Template Known Secondary structure		T	T	S	S					T	S					T	T										S	S	S		S	S												S								T	T	T											T	T	T	S	S	S			S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
																					408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	W	D	I	L	D	E	V	I	R	E	H	P	V	L	L	N	R	A	P	T	L	H	R	L	G	I	Q	A	F	E	P	V	L	I	E	G	K	A	I	Q	L	H	P	L	V	C	A	A	Y	N	A	D	F	D	G	D	Q	M	A	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	D	L	R	Y	V	K	D	R	K	E	L	A	S	T	L	A	P	G	Y	I	I	E	R	H	L	I	D	G	D	I	V	L	F	N	R	Q	P	S	L	H	R	I	S	M	M	A	H	R	V	R	V	L	K	G	L	T	F	R	L	N	L	L	V	C	P	P	Y	N	A	D	F	D	G	D	E	M	N	L
Template Known Secondary structure						S	S		S		T	T	T							T	T									T	T								S	S			S	G	G	G										S	S	S	S					G	G	G					T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.		.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		H	V	P	L	T	L	E	A	Q	L	E	A	R	A	L	M	M	S	T	N	N	I	L	S	P	A	N	G	E	P	I	I	V	P	S	Q	D	V	V	L	G	L	Y	Y	M	T	.	R	D	C	V	N	A	K	G	E	G	M	V	L	T	G	P	K	E	A	E	R	L	Y	R	S	G	L	A	S	L	H	A	R
Query Conservation																																																.
Alig confidence																																																.																.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		H	V	P	Q	S	E	E	A	I	A	E	A	K	E	I	M	L	V	H	K	N	I	I	T	P	R	Y	G	G	P	I	I	G	A	A	Q	D	Y	I	S	G	A	Y	L	L	T	V	K	T	T	L	L	T	K	E	E	A	Q	Q	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	V	A	D	V	K	I	D	L	G	.	.
Template Known Secondary structure						S											S	B	S	G	G	G				T	T	T	T			S	S				S										S	S	T	T			B											.	.	.	.	.	.	.		S	S							.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.								.	.	.	530	.	.	.	.	.
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.																.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.						.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	V	R	I	T	E	Y	E	K	D	A	N	G	E	L	V	A	K	T	S	L	K	D	T	T	V	G	R	A	I	L	W	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	P	K	G	L	P	Y	S	I	V	N	Q	A	L	G	K	K	A	I	S	.	.	.	.	.	K	M	L	N	T
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	E	P	A	I	L	A	P	R	E	Y	Y	T	G	K	Q	V	I	S	A	F	L	P	K	D	F	N	F	H	G	Q	A	N	V	S	S	G	P	R	L	C	K	N	E	D	C	P	H	D	S	Y	V	V	I	K	N	G	I	L	L	E	G	V	F	D	K	K	A	I	G	N	Q	Q	P	E	S	I	L	H	W
Template Known Secondary structure		.			S	B		S	S	S		B	B							T	T	T	S		T	T								S	S			S	T	T				S	S			S	S	S		S				S	S	S				S				S					S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.					650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.
Query Sequence		C	Y	R	I	L	G	L	K	P	T	V	I	F	A	D	Q	I	M	Y	T	G	F	A	Y	A	A	R	S	G	A	S	V	G	I	D	D	M	V	I	P	E	K	.	.	.	.	K	H	E	I	I	S	E	A	E	A	E	V	A	E	I	Q	E	Q	F	Q	S	G	L	V	T	A	G	E	R	Y	N	K	V	I
Query Conservation																																												.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.																																		.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		L	I	K	E	Y	S	D	E	Y	G	K	W	L	M	D	N	L	F	R	V	F	I	R	F	V	E	L	Q	G	F	T	M	R	L	E	D	V	S	L	G	D	D	V	K	K	E	I	Y	N	E	I	D	R	A	K	V	E	V	D	N	L	I	Q	K	Y	K	N	G	E	L	E	P	I	P	G	R	T	L	E	.
Template Known Secondary structure					T	S		T	T									S									T	T	T						S	T	T	T				T	T							T	T																	T	T					B	T	T	B				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	W	A	A	A	N	D	R	V	S	K	A	M	M	D	N	L	Q	T	E	T	V	I	N	R	D	G	Q	E	E	K	Q	V	S	F	N	S	I	Y	M	M	A	D	S	G	A	R	G	S	A	A	Q	I	R	Q	L	A	G	M	R	G	L	M	A	K	P	D	G	S	I	I	E	T	P	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	S	L	E	N	Y	I	L	D	T	L	D	K	L	R	S	T	A	G	D	I	A	S	K	Y	L	D	P	F	N	F	A	Y	V	M	A	R	T	G	A	R	G	S	V	L	N	I	T	Q	M	A	A	M	L	G	Q	Q	S	V	R	G	E	R	I	K	R	G	Y	M	T	R	T	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																							T	T	T	S		T	T	S						S	S	S	S	S	S											S							B	T	T	B					S	S	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									694	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.
																	759	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	A	N	F	R	E	G	L	N	V	L	Q	Y	F	I	S	T	H	G	A	R	K	G	L	A	D	T	A	L	K	T	A	N	S	G	Y	L	T	R	R	L	V	D	V	A	Q	D	L	V	V	T	E	D	D	C	G	T	H	E	G	I	M	M	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	F	K	P	Y	D	I	S	P	E	A	R	G	F	I	Y	S	S	F	R	T	G	L	K	P	T	E	L	F	F	H	A	A	G	G	R	E	G	L	V	D	T	A	V	R	T	S	Q	S	G	Y	M	Q	R	R	L	I	N	A	L	S	D	L	R	A	E	Y	D	G	T	V	R	S	L	Y	G	E	V	V
Template Known Secondary structure		T	T	S		S	S				T	T	S	S	S						T	T	T				T	T																			T													T	T	S		S					T	T	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		767	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.
		824	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	I	E	G	G	D	V	K	E	P	L	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	V	A	Y	G	D	D	G	V	F	P	M	Y
Template Known Secondary structure			S	S	G	G	G	S				G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		847	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.