Job Description Q5H778 Confidence 4.91% Date Thu Jan 5 12:37:23 GMT 2012 Rank 76 Aligned Residues 414 % Identity 9% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.										.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	P	L	N	I	A	A	Q	P	G	K	T	R	L	R	K	S	L	K	L	W	Q	V	V	M	M	G	L	A	Y	L	T	P	M	T	V	F	D	T	F	G	I	V	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	D	G	H	V	P	A	S	Y	L	L	A	L	A	G	V	L	F	T	A	I	S	Y	G	K
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	P	A	P	H	K	A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S
Template Known Secondary structure													S																													T	S								T	T	S	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	R	Q	F	P	E	A	G	S	A	Y	T	Y	A	Q	K	S	I	N	P	H	V	G	F	M	V	G	W	S	S	L	L	D	Y	L	F	L	P	M	I	N	V	L	L	A	K	I	Y	L	S	A	L	F	P	E	V	P	P	W	V	W	V	V	T	F	V	A	I	L	T	A	A	N	L	K	S	V	N	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																												S	S	S	S																T										T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.															90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	N	F	N	T	L	F	V	L	V	Q	I	S	I	M	V	V	F	I	F	L	V	V	Q	G	L	H	K	G	E	G	V	G	T	V	W	S	L	Q	P	F	I	S	E	N	A	H	L	I	P	I	I	T	G	A	T	I	V	C	F	S	F	L	G	F	D	A	V	T	T	L	S	E	E	T	P	D	A	A
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E
Template Known Secondary structure		T																		T	S												T			S	T	T		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					S	S	T	T	T				S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190										.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	I	P	K	A	I	F	L	T	A	V	Y	G	G	V	I	F	I	A	A	S	F	F	M	Q	L	F	F	P	D	I	S	R	F	K	D	P	D	A	A	L	P	E	I	A	L	Y	V	G	G	K	L	F	Q	S	I	F	L	C	T	T	F	V	N	T	L	A	S	G	L	A	S	H	A	S	V	S	R	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																													.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T						T							T	S	S																													B	T	T	B	S																											.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.						.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Y	V	M	G	R	D	N	V	F	P	E	R	V	F	G	Y	V	H	P	K	W	R	T	P	A	L	N	V	I	M	V	G	I	V	A	L	S	A	L	F	F	.	.	.	.	.	D	L	V	T	A	T	A	L	I	N	F	G	A	L	V	A	F	T	F	V	N	L	S	V	F	N	H	F	W	R	R	K	G
Query Conservation																																												.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	S	T	T																				T	T	S			T	T																	T													T	S		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.						.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	K	S	W	K	D	H	F	H	Y	L	L	M	P	L	V	G	A	L	T	V	G	V	L	W	V	N	L	.	.	.	.	.	E	S	T	S	L	T	L	G	L	V	W	A	S	L	G	G	A	Y	L	W	Y	L	I	R	R	Y	R	K	V	P	L	Y	D	G	D	R	T	P	V
Query Conservation																															.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L	V	P
Template Known Secondary structure		T																															S	S		S																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.