Job Description P15723 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:52 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 380 % Identity 36% Template c2pgsA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase; PDBTitle: crystal structure of a putative deoxyguanosinetriphosphate2 triphosphohydrolase from pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448a Resolution 2.35 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	D	F	R	K	K	I	N	W	H	R	R	Y	R	S	P	Q	G	V	K	T	E	H	E	I	L	R	I	F	E	S	D	R	G	R	I	I	N	S	P	A	I	R	R	L	Q	Q	K	T	Q	V	F	P	L	E	R	N	A	A	V	R	T	R	L	T	H	S	M	E	V	Q	Q	V	G	R	Y	I	A	K
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	D	W	Q	T	L	L	N	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	P	F	H	K	D	H	D	R	I	I	F	S	G	A	F	R	R	L	G	R	K	T	Q	V	H	P	.	.	.	.	.	.	.	H	T	R	L	T	H	S	L	E	V	S	C	V	G	R	S	L	G	X
Template Known Secondary structure					T	T	T	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B													S					G	G	G	G							.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.																.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40								.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	L	S	R	L	K	E	L	K	L	L	E	A	Y	G	L	D	E	L	T	G	P	F	E	S	I	V	E	M	S	C	L	M	H	D	I	G	N	P	P	F	G	H	F	G	E	A	A	I	N	D	W	F	R	Q	R	L	H	P	E	D	A	E	S	Q	P	L	T	D	D	R	C	S	V	A	A	L	R	L
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	G	E	T	L	R	A	A	L	P	D	W	C	D	P	S	D	L	.	.	.	.	.	G	X	V	V	Q	S	A	C	L	A	H	D	I	G	N	P	P	F	G	H	S	G	E	D	A	I	R	N	W	F	N	Q	A	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	G	G	G	S		T	T							.	.	.	.	.											T	T	T	T			T	T																	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.						.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.							.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	G	E	E	P	L	N	E	L	R	R	K	I	R	Q	D	L	C	H	F	E	G	N	A	Q	G	I	R	L	V	H	T	L	M	.	.	.	.	.	.	R	M	N	L	T	W	A	Q	V	G	G	I	L	K	Y	T	R	P	A	W	W	R	G	E	T	P	E	T	H	H	Y	L	M	K	K	P	G	Y	Y
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	R	G	W	L	D	A	X	S	E	T	E	R	N	D	F	L	N	F	E	G	N	A	Q	G	F	R	V	L	T	Q	L	E	Y	H	Q	F	D	G	G	T	R	L	T	Y	A	T	L	G	T	Y	L	K	Y	P	W	T	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	K	F	G	C	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T	T	T	T	T	S										T													T	T	S	S	B	T	T	T	T	B	T			B									S	S		B	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.													.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.						.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	E	E	A	Y	I	A	R	L	R	K	E	L	N	L	A	L	.	.	.	.	.	Y	S	R	F	P	L	T	W	I	M	E	A	A	D	D	I	S	Y	C	V	A	D	L	E	D	A	V	E	K	R	I	F	T	V	E	Q	L	Y	H	H	L	H	E	A	W	G	Q	H	E	K	G	S	L	F	S	L	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	E	L	P	I	L	E	Q	I	A	G	K	L	G	L	P	Q	L	E	E	Q	R	W	A	R	H	P	L	V	Y	L	X	E	A	A	D	D	I	C	Y	A	L	I	D	L	E	D	G	L	E	X	D	L	L	D	Y	A	E	V	E	S	L	L	L	G	L	V	G	R	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T												T					B	T	T	B					T	T																						T	T	T	S	S											T	T						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																																																														.
Query SS confidence																																																														.
Query Sequence		V	E	N	A	W	E	K	S	R	S	N	S	L	S	R	S	T	E	D	Q	F	F	M	Y	L	R	V	N	T	L	N	K	L	V	P	Y	A	A	Q	R	F	I	D	N	L	P	A	I	F	A	G	T	F	N	H	A	L	L	E	D	.	A	S	E	C	S	D	L	L	K	L	Y	K	N	V	A	V	K	H	V
Query Conservation																																																														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	I	L	R	G	K	A	I	E	H	L	T	N	A	A	A	R	A	F	V	E	Q	Q	D	A	L	L	A	G	T	L	P	G	D	L	V	E	H	X	H	G	P	A	K	R	C	V	L	N	A	K	D	X	A	R	K	K	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	T	T	S					S	S			S	S		G	G	G	G	S																			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	H	P	D	V	E	R	L	E	L	Q	G	Y	R	V	I	S	G	L	L	E	I	Y	R	P	L	L	S	L	S	L	S	D	F	T	E	L	V	E	K	E	R	V	K	R	F	P	I	E	S	R	L	F	H	K	L	S	T	R	H	R	L	A	Y	V	E	A	V	S	K	L	P	S	D	S	P	E	F	P
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	D	K	R	K	T	L	H	E	I	G	A	Y	T	T	L	E	I	L	L	N	A	F	C	G	A	A	V	E	Q	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	P	S	F	K	H	R	R	I	L	D	L	L	G	N	S	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P
Template Known Secondary structure		T	T																													T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T							T	T	T	T	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.										.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.																	.	.
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	W	E	Y	Y	Y	R	C	R	L	L	Q	D	Y	I	S	G	M	T	D	L	Y	A	W	D	E	Y	R	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	A	P	L	H	A	S	F	L	R	X	I	D	F	I	A	G	X	T	D	S	Y	A	S	E	X	A	R	E
Template Known Secondary structure		T	S															T	S											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.