Job Description P15723 Confidence 99.89% Date Thu Jan 5 11:34:52 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 211 % Identity 22% Template c2o6iA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:hd domain protein; PDBTitle: structure of an enterococcus faecalis hd domain phosphohydrolase Resolution 2.55 Å

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		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.							.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	I	N	S	P	A	I	R	R	L	Q	Q	K	T	Q	.	.	.	.	.	.	V	F	P	L	E	R	N	A	A	V	R	T	R	L	T	H	S	M	E	V	Q	Q	V	G	R	Y	I	A	K	E	I	L	S	R	L	K	E	L	K	L	L	E	A	Y	G	L	D	E	L	T	G	P	F	E	S	I	V	E
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Sequence		D	L	I	N	S	A	E	V	Q	R	L	R	R	I	K	Q	L	G	T	S	S	F	T	F	H	G	A	E	.	.	.	.	H	S	R	F	S	H	S	L	G	V	Y	E	I	T	R	R	I	C	E	I	F	Q	R	N	Y	S	V	E	R	L	G	E	N	G	W	N	D	.	.	.	.	D	E	R	L	I	T	L
Template Known Secondary structure					T	S					G	G	G	G	S	B	S	S	S	G	G	G	G	T	S	T	T			.	.	.	.		B																							S	B					G	G	G	S	B		G	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.					.	.	100	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	C	L	M	H	D	I	G	N	P	P	F	G	H	F	G	E	A	A	I	N	D	W	F	R	Q	R	L	H	P	E	D	A	E	S	Q	P	L	T	D	D	R	C	S	V	A	A	L	R	L	R	D	G	E	E	P	L	N	E	L	R	R	K	I	R	Q	D	L	C	H	F	E	G	N	A	Q	G	I	R
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	A	A	L	L	H	D	V	G	H	G	P	Y	S	H	T	F	E	H	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	N	H	E	A	I	T	V	Q
Template Known Secondary structure							T	T	T	T			T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.											.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	V	H	T	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	M	N	L	T	W	A	Q	V	G	G	I	L	K	Y	T	R	P	A	W	W	R	G	E	T	P	E	T	H	H	Y	L	M	K	K	P	G	Y	Y	L	S	E	E	A	Y	I	A	R	L	R	K	E	L	N	L	A	L	Y	S	R	F	P	L	T
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	T	S	P	E	T	E	V	Y	Q	I	L	N	R	V	S	A	D	F	P	E	K	V	A	S	V	I	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	P	N	P	Q	V	V
Template Known Secondary structure						T	T	S								T	T		T	T										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	170	.	.	.
		262	.	.	.	.				.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.															.
Query SS confidence							.	.	.															.
Query Sequence		W	I	M	E	A	.	.	.	A	D	D	I	S	Y	C	V	A	D	L	E	D	A	.	V	E	K	R	I	F	T	V	E	Q	L	Y	H	H	L	H	E	A	W	G	Q	H	E	K	G	S	L	F	S	L	V	V	E	N	A	W	E	K	S	R	S	N	S	L	S	R	S	T	E	D	Q	F	F	M	Y	L	R
Query Conservation							.	.	.															.
Alig confidence							.	.	.															.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	M	I	S	S	Q	I	D	A	D	R	M	D	Y	L	L	R	D	A	Y	F	T	G	T	E	Y	G	T	F	D	L	T	R	I	L	R	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S	S	S																T		G	G	G												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.				.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.
Query Sequence		V	N	T	L	N	K	L	V	P	Y	A	A	Q	R	F	I	D	N	L	P	A	I	F	A	G	T	F	N	H	A	L	L	E	D	A	S	E	C	S	D	L	L	K	L	Y	.	.	.	K	N	V	A	V	K	H	V	F	S	H	P	D	V	E	R	L	E	L	Q	G	Y	R	V	I	S	G	L	L	E	I	Y
Query Conservation																																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	Y	K	G	G	I	A	F	A	M	N	G	M	H	A	V	E	D	Y	I	V	S	R	Y	Q	M	Y	V	Q	V	Y	F	H	P	V	S	R	G	M	E	V	I	L	D	H	L	L	H	R	A	K	E	L	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T						G	G	G																		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																											212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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