Job Description P15723 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:52 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 320 % Identity 31% Template c2dqbB_ PDB info PDB header:hydrolase, dna binding protein Chain: B: PDB Molecule:deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase, putative; PDBTitle: crystal structure of dntp triphosphohydrolase from thermus2 thermophilus hb8, which is homologous to dgtp triphosphohydrolase Resolution 2.20 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	W	H	R	R	Y	R	S	P	Q	G	V	K	T	E	H	E	I	L	R	I	F	E	S	D	R	G	R	I	I	N	S	P	A	I	R	R	L	Q	Q	K	T	Q	V	F	P	L	E	R	N	A	A	V	R	T	R	L	T	H	S	M	E	V	Q	Q	V	G	R	Y	I	A	K	E	I	L	S	R	L	K	E
Query Conservation
Alig confidence												.	.																																			.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Conservation												.	.																																			.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		A	R	D	T	R	G	R	A	H	P	.	.	E	P	E	S	L	Y	R	T	P	Y	Q	K	D	R	D	R	I	L	H	T	T	A	F	R	R	L	E	Y	K	T	Q	V	L	P	.	.	.	.	.	.	Y	R	T	R	L	T	H	T	L	E	V	A	Q	V	S	R	S	I	A	R	A	L	G	L	N	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G					S	S		.	.					T	T													T	S							T	T	S	B	S	S			.	.	.	.	.	.			B																		T	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.																																			.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.							.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	L	L	E	A	Y	G	L	D	E	L	T	G	P	F	E	S	I	V	E	M	S	C	L	M	H	D	I	G	N	P	P	F	G	H	F	G	E	A	A	I	N	D	W	F	R	Q	R	L	H	P	E	D	A	E	S	Q	P	L	T	D	D	R	C	S	V	A	A	L	R	L	R	D	G	E	E	P	L	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	L	T	E	A	I	A	L	S	H	D	L	G	H	P	P	F	G	H	T	G	E	H	V	L	N	A	L	X	Q	D	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	T	T			S	S	T	T										T	T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.								.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	R	R	K	I	R	Q	D	L	C	H	F	E	G	N	A	Q	G	I	R	L	V	H	T	L	M	.	.	.	.	.	.	.	R	M	N	L	T	W	A	Q	V	G	G	I	L	K	Y	T	R	P	A	W	W	R	G	E	T	P	E	T	H	H	Y	L	M	K	K	P	G	Y	Y	L	S	E	E	A	Y	I
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	H	N	A	Q	A	L	R	I	L	T	H	L	E	V	R	Y	P	G	F	R	G	L	N	L	T	Y	E	V	L	E	G	I	T	H	E	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T				S	T	T	T	T	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	L	R	K	E	L	N	L	A	L	Y	S	R	F	P	L	T	W	I	M	E	A	A	D	D	I	S	Y	C	V	A	D	L	E	D	A	V	E	K	R	I	F	T	V	E	Q	L	Y	H	H	L	H	E	A	W	G	Q	H	E	K	G	S	L	F	S	L	V	V	E	N	A	W	E	K	S	R	S	N	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	T	L	E	A	Q	V	V	D	L	S	D	A	I	A	Y	A	A	H	D	L	D	D	G	F	R	A	G	L	L	H	P	E	E	L	K	E	V	E	L	L	Q	A	L	A	L	E	E	E	L	D	R	R	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																											T	T		S		T	T	G	G	G	G	S									T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	R	S	T	E	D	Q	F	F	M	Y	L	R	V	N	T	L	N	K	L	V	P	Y	A	A	Q	R	F	I	D	N	L	P	A	I	F	A	G	T	F	N	H	A	L	L	E	D	A	S	E	C	S	D	L	L	K	L	Y	K	N	V	A	V	K	H	V	F	S	H	P	D	V	E	R	L	E	L	Q	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																											.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	V	R	Q	L	L	G	Y	F	I	T	A	A	I	E	A	T	H	R	R	V	E	E	A	G	V	Q	S	A	E	A	V	R	R	H	P	S	R	L	A	A	L	G	.	.	E	E	A	E	K	A	L	K	A	L	K	A	F	L	X	E	R	F	Y	R	H	P	E	V	L	R	E	R	R	K	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																							S				S								S	S							.	.																		T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																											.	.
Template SS confidence
							248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	R	V	I	S	G	L	L	E	I	Y	R	P	L	L	S	L	S	L	S	D	F	T	E	L	V	E	K	E	R	V	K	R	F	P	I	E	S	R	L	F	H	K	L	S	T	R	H	R	L	A	Y	V	E	A	V	S	K	L	P	S	D	S	P	E	F	P	L	W	E	Y	Y	Y	R	C	R	L	L	Q	D
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	V	L	E	G	L	F	A	A	Y	T	R	Y	P	E	L	L	P	R	E	V	Q	A	K	I	P	E	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	R	A	V	C	D
Template Known Secondary structure																G	G	G	S						T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																																												.	.	.	.	.	.	.
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	S	G	M	T	D	L	Y	A	W	D	E	Y	R	R	L	M
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	A	G	X	T	D	R	F	A	L	E	A	Y	R	R	L	S
Template Known Secondary structure					T												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.