Job Description P39401 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 12:00:36 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 254 % Identity 14% Template c2xr9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family PDBTitle: crystal structure of autotaxin (enpp2) Resolution 2.05 Å

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		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	P	S	K	T	I	P	D	P	K	L	N	L	V	Y	I	Y	G	E	S	L	E	R	T	Y	F	D	N	E	A	F	P	D	L	T	P	E	L	G	A	L	K	N	E	G	L	D	F	S	H	T	Q	Q	L	P	G	T	D	Y	T	I	A	G	M	V	A	S	Q	C	G	I	P	L	F	A	P	F	E	G
Query Conservation
Alig confidence																																.	.																					.
Template Conservation																																.	.																					.
Template Sequence		K	V	P	E	C	P	A	G	F	V	R	P	P	L	I	I	F	S	V	D	G	F	R	A	S	Y	M	K	K	G	.	.	S	K	V	M	P	N	I	E	K	L	R	S	C	G	T	H	A	P	Y	M	.	R	P	V	Y	P	T	K	T	F	P	N	L	Y	T	L	A	T	G	L	Y	P	E	S	H	G	I	V
Template Known Secondary structure			S					T	T		S	S										T			G	G	G	G	G	G		.	.	T	T	T											S				S			.				S	S		S											S							S
Template Predicted Secondary structure																																.	.																					.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.		.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		231	.																.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	S	V	S	S	F	F	P	Q	N	I	C	L	G	D	I	L	K	N	S	G	Y	Q	N	Y	F	V	Q	G	A	N	L	R	F	A	G	K	D	V	F	L	K	S	H	G	F	D	H	L	Y	G	S	E	E	L	K	S	V	V	A	D	P
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	S	M	Y	D	P	V	F	D	A	S	F	H	L	R	G	R	E	K	F	N	H	R	W	W	G	G	Q	P	L	W	I	T	A	T	K	Q	G	V	R	A	G	T	F	F	W	S	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S				T	T	T	T					S	S	S	S	G	G	G	S	G	G	G			S										T	T			B							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.							.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Y	R	N	D	W	G	F	Y	D	D	T	V	L	D	E	A	W	K	K	F	E	E	L	S	R	S	G	Q	R	F	S	L	F	T	L	T	V	D	T	.	.	.	.	.	.	H	H	P	D	G	F	I	S	R	T	C	N	R	K	K	Y	D	F	D	G	K	P	N	Q	S	F	S	A	V	S	C	S	Q	E
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																		.																.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	I	P	H	E	R	R	I	L	T	I	L	Q	W	L	S	L	P	.	D	N	E	R	P	S	V	Y	A	F	Y	S	E	Q	P	D	F	S	G	H	K	Y	G	P	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	M	T	N	P	L	R	E	I	D	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S														T	S		.	T	T	T			S																		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	I	A	T	F	I	N	K	I	K	A	S	P	W	F	K	D	T	V	I	V	V	S	S	D	H	L	A	M	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	G	Q	L	M	D	G	L	K	Q	L	R	L	H	R	C	V	N	V	I	F	V	G	D	H	G	M	E	D	V	T	C	D	R	T	E	F	L	S	N	Y	L	T	N	V	D	D	I	T	L	V	P	G	T	L	G	R	I	R	A	K	S	I	Y	D	P	K	T	I	I	A	A	L	T	C	K	K	P	D
Template Known Secondary structure													T	T		T	T	T								S								T	T	S				G	G	G	T		S		G	G	G						B	S							S												T	S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
																																														401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	W	K	Y	L	N	K	Q	D	R	N	N	L	F	F	V	I	R	G	D	K	P	Q	Q	E	T	L	A	V	K	R	N	T	M	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	H	F	K	P	Y	M	K	Q	H	L	P	K	R	L	H	Y	A	N	N	R	R	I	E	D	I	H	L	L	V	D	R	R	W	H	V	A	R	K	P	C	F	F	Q	G	D	H	G	F	D	N	K	V	N	S	M	Q	T	V	F	V	G	Y	G	P	T	F	K	Y	R	T	K	V	P	P	F	E	N	I	E
Template Known Secondary structure									G	G	G	S		G	G	G				S	S	T	T	S		S							T	T					S											S		T	T	S	G	G	G		B						S	T	T	B		S	S								G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.						.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	A	T	V	L	D	I	L	G	.	.	.	.	.	G	D	N	Y	L	G	L	G	R	S	S	L	S	G	Q	S
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	N	V	M	C	D	L	L	G	L	K	P	A	P	N	N	G	T	H	G	S	L	N	H	L	L	R	T	N	T
Template Known Secondary structure											T					S		S	S		T	T	T	T	G	G	G	B	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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