Job Description P0A6B7 Confidence 99.84% Date Wed Jan 25 15:20:14 GMT 2012 Rank 226 Aligned Residues 341 % Identity 16% Template c3f6tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of aspartate aminotransferase (e.c. 2.6.1.1)2 (yp_194538.1) from lactobacillus acidophilus ncfm at 2.15 a3 resolution Resolution 2.15 Å

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		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.										.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	P	V	D	P	R	V	A	E	K	M	M	Q	F	M	T	M	D	G	T	F	G	N	P	A	S	R	S	H	R	F	G	W	Q	A	E	E	A	V	D	I	A	R	N	Q	I	A	D	L	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	P	R	E	I	V	F	T	S	G	A	T	E	S	D	N	L	A	I
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	N	R	D	K	V	V	A	E	W	V	N	G	A	V	A	N	.	N	Y	P	V	P	D	R	C	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	T	E	K	I	I	N	Y	F	L	Q	E	L	S	Y	K	D	A	N	L	A	E	Q	T	D	L	F	P	T	E	G	G	T	A	A	I	V	Y	A	F
Template Known Secondary structure																		T		.	S			S	S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	T	T				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.												140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		84	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.		.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure					.																																						.
Query SS confidence					.																																						.
Query Sequence		K	G	A	.	A	N	F	Y	Q	K	K	G	K	H	I	I	T	S	K	T	E	H	K	A	V	L	D	T	C	R	Q	L	E	R	E	G	F	E	V	T	Y	.	L	A	P	Q	R	N	G	I	I	D	L	K	E	L	E	A	A	M	R	D	D	T	I	L	V	S	I	M	H	V	N	N	E	I	G	V	V	Q
Query Conservation					.																																						.
Alig confidence					.																																						.
Template Conservation
Template Sequence		H	S	L	A	E	N	H	L	L	K	K	G	D	K	I	A	I	N	E	P	I	F	T	P	Y	L	R	I	P	E	L	K	D	Y	E	L	V	E	V	D	L	H	S	Y	E	K	N	D	W	E	I	E	P	N	E	I	E	K	L	K	D	P	S	I	K	A	L	I	V	V	N	P	T	N	P	T	S	K	E	F
Template Known Secondary structure							T	T	S	S		T	T							S	S							T	S	G	G	G	G	G	S											T	T	T	T	S											S		T	T								S	S		T	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
					162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.				.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.			.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure		.	.	.													.												.	.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.													.												.	.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	D	I	A	A	I	G	E	M	C	R	A	R	.	G	I	I	Y	H	V	D	A	T	Q	S	.	.	.	V	G	K	L	P	I	D	L	S	Q	L	K	V	D	L	M	S	F	S	G	H	K	I	Y	G	P	K	G	.	.	I	G	A	L	Y	V	R	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.													.												.	.	.																													.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.													.												.	.	.																							.						.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.
Template Sequence		D	T	N	A	L	N	A	I	K	Q	A	V	E	K	N	P	K	L	X	I	I	S	D	E	V	Y	G	A	F	V	P	N	F	K	S	I	Y	S	V	V	P	Y	N	T	X	L	V	Y	S	Y	S	L	.	F	G	C	T	G	W	R	L	G	V	I	A	L	N	E	K	N	V	F	D	D	N	I	A	H	L	D
Template Known Secondary structure																	T	T								T	T	G	G	G	S	T	T								S	G	G	G										.		S		G	G	G									S	S									T	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.		.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																								222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	V	R	I	E	A	Q	M	H	G	G	G	H	E	R	G	M	R	S	G	T	L	P	V	H	Q	I	V	G	M	G	E	A	Y	R	I	.	.	.	A	K	E	E	M	A	T	E	M	E	R	L	R	G	L	R	N	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	E	L	R	Q	L	H	K	R	Y	S	S	V	V	L	D	P	D	K	X	K	F	I	D	R	L	C	A	D	S	R	S	I	G	L	Y	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	I	X	E	A	L	F	S	X	T	H	L	L	T	S	T	N	G	G	S	D	D	P	Y	I	D	I	A	R	K	L	V	S	E
Template Known Secondary structure														T	T		S		G	G	G												T	T	T	T	T	G	G	G		S																		T	T		B	G	G	G	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.				.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Query Sequence		L	W	N	G	I	K	D	I	E	E	V	Y	L	N	G	D	L	E	H	G	A	P	N	I	L	N	V	S	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	E	G	E	S	L	I	M	A	L	.	.	.	K	D	L	A	V	S	S	G	S	A	C	T	S	A	S	L	E	P	S	Y
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	D	Q	L	H	D	A	X	Q	A	P	K	D	E	T	D	T	N	T	H	Y	Y	S	L	I	D	I	Y	R	L	A	E	K	I	Y	G	K	E	F	R	D	Y	L	T	N	N	F	E	Q	V	D	F	L	L	K	L	A	E	K	N	G	V	V	L	V	D	G	V	G	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T						S	T	T	B			S																																							T	T	S	S	S		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	R	A	L	G	L	N	D	E	L	A	H	S	S	I	R	F	S	L	G	R	F	T	T	E	E	E	I	D	Y	T	I	E	L	V	R	K	S	I	G	R	L	R	D	L	S	P	L	W	E	M	Y	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	P	G	E	L	R	V	S	Q	A	.	N	L	P	T	E	D	Y	A	L	I	G	K	Q	V	L	E	L	L	K	E	Y	.	.	.	.	.	.	Y	E	E	F	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T						S	S	.	S	S																				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.		.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.							.	.	.	.	.