Job Description P39370 Confidence 91.80% Date Thu Jan 5 12:00:04 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 188 % Identity 18% Template d2o14a2 SCOP info Flavodoxin-like SGNH hydrolase YxiM C-terminal domain-like Resolution 2.10

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		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	V	A	G	Q	S	N	A	M	A	Y	G	E	G	L	P	L	P	D	R	E	D	A	P	H	P	R	I	K	Q	L	A	R	F	A	H	T	H	P	G	G	P	P	C	H	F	N	D	I	I	P	L	T	H	C	P	H	D	V	Q	D	M	Q	G	Y	H	H	P	L	A	T	N	H	Q	T	Q	Y	G	T
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Y	V	G	G	D	S	T	V	C	N	Y	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N
Template Known Secondary structure								T	T	T	S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	180
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.			.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		V	G	Q	A	L	H	I	A	R	K	L	L	P	F	I	P	D	N	A	G	I	L	I	V	P	C	C	R	G	G	S	A	F	T	A	G	S	E	G	T	Y	S	E	R	H	G	A	S	H	D	A	C	R	W	G	T	D	T	P	L	Y	Q	D	L	V	S	.	.	R	T	R	A	A	L	A	K	N	P	Q	N
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	K	Q	A	G	W	G	Q	X	L	P	H	Y	I	D	.	K	H	T	F	Q	V	R	N	X	A	S	G	G	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	G	F	R	N	D	G	Q	L	E	A	I	L	K	Y	I	K	P	G
Template Known Secondary structure		T		S	B							G	G	G	T	S		.	T	T	T									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S							T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.		.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.				.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		K	F	L	G	A	C	W	M	Q	G	E	F	D	L	M	.	.	.	T	S	D	Y	A	S	H	P	Q	H	F	N	H	M	V	E	A	F	R	R	D	L	K	Q	Y	H	S	Q	L	N	N	I	T	D	A	P	W	F	C	G	D	T	T	W	Y	W	K	E	N	F	P	H	S	Y	E	A	I	Y	G	N	Y	Q
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence				.	.												.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	.	.	F	X	L	Q	L	G	I	N	D	T	N	P	K	H	K	E	S	E	A	E	F	K	E	V	X	R	D	X	I	R	Q	V	K	A	K	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	L	S	T	P	Q	G	R	A	T	D	F	T	S	E	G	I	H	S	S	V	N	R	W	Y	R
Template Known Secondary structure				.	.							T	G	G	G		G	G	G																				T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T		B		T	T	S		B			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		232	.			.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.												.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		248	.						250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.
Query Sequence		N	N	.	.	.	.	.	V	L	A	N	I	I	F	V	D	F	Q	Q	Q	G	E	R	G	L	T	N	A	P	D	E	D	P	D	D	L	S	T	G	Y	Y	G	S	A	Y	R	S	P	E	N	W	T	T	A	L	R	S	S	H	F	S	T	A	A	R	R	G	I	I	S	D	R	F	V	E	A	I	L	Q	F
Query Conservation				.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Sequence		A	S	I	L	A	L	A	E	E	E	K	T	Y	L	I	D	L	N	V	L	S	S	A	Y	F	T	S	I	G	P	E	R	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	Y	X	D	G	D	T	L	H	P	N	R	A	G	A	D	.	A	L	A	R	L	A	V	Q	E	L	K	R	Q
Template Known Secondary structure											T	T																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B		T	T		S	S	S	B	B						.													T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.																.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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