Job Description P39370 Confidence 95.47% Date Thu Jan 5 12:00:04 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 189 % Identity 14% Template d1yzfa1 SCOP info Flavodoxin-like SGNH hydrolase TAP-like Resolution 1.90

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		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	V	A	G	Q	S	N	A	M	A	Y	G	E	G	L	P	L	P	D	R	E	D	A	P	H	P	R	I	K	Q	L	A	R	F	A	H	T	H	P	G	G	P	P	C	H	F	N	D	I	I	P	L	T	H	C	P	H	D	V	Q	D	M	Q	G	Y	H	H	P	L	A	T	N	H	Q	T	Q	Y	G	T
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	L	F	G	D	S	I	T	A	G	Y	L	D	E	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Known Secondary structure							S						B	T	T	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20																																																															.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	Q	A	L	H	I	A	R	K	L	L	P	F	I	P	D	N	A	G	I	L	I	V	P	C	C	R	G	G	S	A	F	T	A	G	S	E	G	T	Y	S	E	R	H	G	A	S	H	D	A	C	R	W	G	T	D	T	P	L	Y	Q	D	L	V	S	R	T	R	A	A	L	A	K	N	P	Q	N	K	F
Query Conservation
Alig confidence																			.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation																			.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Sequence		P	V	L	V	D	L	V	K	R	D	I	A	A	M	G	L	E	.	.	E	V	A	V	I	N	A	G	M	P	G	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	D	G	L	K	R	L	N	K	E	V	L	I	.	.	.	E	K	P
Template Known Secondary structure		S													T	T	B		.	.										T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	G	G	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.			.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.				.	.	.
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	A	C	W	M	Q	G	E	F	D	L	M	T	S	D	Y	A	S	H	P	Q	H	F	N	H	M	V	E	A	F	R	R	D	L	K	Q	Y	H	S	Q	L	N	N	I	T	D	A	P	W	F	C	G	D	T	T	W	Y	W	K	E	N	F	P	H	S	Y	E	A	I	Y	G	N	Y	Q	N	N	V	L	A
Query Conservation
Alig confidence																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	V	V	I	F	F	G	A	N	D	A	S	L	D	R	N	I	.	T	V	A	T	F	R	E	N	L	E	T	M	I	H	E	I	G	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	I	L	I	T	P	P	Y	A	D	S	G	R	R	P	E	R	P	Q	T	R	I	K	E	L	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S								T	T	T	T		T	T	S			.																		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G											T	T	T		T	T	S									.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.											.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		N	I	I	F	V	D	F	Q	Q	Q	G	E	R	G	L	T	N	A	P	D	E	D	P	D	D	L	S	T	G	Y	Y	G	S	A	Y	R	S	P	E	N	W	T	.	T	A	L	R	S	S	H	F	S	T	A	A	R	R	G	I	I	S	D	R	F	V	E	A	I	L	Q	F	W	R	E	R
Query Conservation																																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	V	A	Q	E	V	G	A	A	H	N	L	P	V	I	D	L	Y	K	A	M	T	V	Y	P	G	T	D	E	F	L	Q	A	D	G	L	H	F	S	Q	V	G	Y	E	.	L	L	G	A	L	I	V	R	E	I	K	G	R	L	K	P	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T													S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S	S	S	B							.											G	G	G			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
														132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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