Job Description P39370 Confidence 95.73% Date Thu Jan 5 12:00:04 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 192 % Identity 17% Template c3milA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:isoamyl acetate-hydrolyzing esterase; PDBTitle: crystal structure of isoamyl acetate-hydrolyzing esterase from2 saccharomyces cerevisiae Resolution 1.60 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	Y	V	L	T	V	A	G	Q	S	N	A	M	A	Y	G	E	G	L	P	L	P	D	R	E	D	A	P	H	P	R	I	K	Q	L	A	R	F	A	H	T	H	P	G	G	P	P	C	H	F	N	D	I	I	P	L	T	H	C	P	H	D	V	Q	D	M	Q	G	Y	H	H	P	L	A	T	N	H	Q	T
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	E	K	F	L	L	F	G	D	S	I	T	E	F	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	R
Template Known Secondary structure											S					T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.																																																													.	20	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	G	T	V	G	Q	A	L	H	I	A	R	K	L	L	P	F	I	P	D	N	A	G	I	L	I	V	P	C	C	R	G	G	S	A	F	T	A	G	S	E	G	T	Y	S	E	R	H	G	A	S	H	D	A	C	R	W	G	T	D	T	P	L	Y	Q	D	L	V	S	R	T	R	A	A	L	A	K	N	P
Query Conservation
Alig confidence																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		P	I	E	D	G	K	D	Q	Y	A	L	G	A	A	L	V	N	E	Y	.	.	T	R	K	M	D	I	L	Q	R	G	F	K	G	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	W	A	L	K	I	L	P	E	I	L	K	H	.	.
Template Known Secondary structure			S	T	T															T	.	.	T	T	T									T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40			.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.						190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.											.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	N	K	F	L	G	A	C	W	M	Q	G	E	F	D	L	M	T	S	D	Y	.	.	.	.	.	A	S	H	P	Q	H	F	N	H	M	V	E	A	F	R	R	D	L	K	Q	Y	H	S	Q	L	N	N	I	T	D	A	P	W	F	C	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	W	Y	W	K	E
Query Conservation																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	N	I	V	M	A	T	I	F	L	G	A	N	D	A	C	S	A	G	P	Q	S	V	P	L	P	E	F	I	D	N	I	R	Q	M	V	S	L	M	K	S	Y	H	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	I	I	G	P	G	L	V	D	R	E	K	W	E	K	E	K	S	E	E	I	A
Template Known Secondary structure														T	T	T	T	S	S	S	S	T	T																					T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.												.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.						250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.
Query Sequence		N	F	P	H	S	Y	E	A	I	Y	G	N	Y	Q	N	N	.	.	.	.	.	V	L	A	N	I	I	F	V	D	F	Q	Q	Q	G	E	R	G	L	T	N	A	P	D	E	D	P	D	D	L	S	T	G	Y	Y	G	S	A	Y	R	S	P	E	N	W	T	T	A	L	R	S	S	H	F	S	T	A	A	R	R
Query Conservation																		.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	Y	F	R	T	N	E	N	F	A	I	Y	S	D	A	L	A	K	L	A	N	E	E	K	V	P	F	V	A	L	N	K	A	F	Q	Q	E	G	G	D	A	W	Q	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	D	G	L	H	F	S	G	K	G	Y	K
Template Known Secondary structure		T	T																						T	T															G	G	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S	S	S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	I	S	D	R	F	V	E	A	I	L	Q	F	W	R	E
Query Conservation
Alig confidence		.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	I	F	H	D	E	L	L	K	V	I	E	T	F	Y	P	Q
Template Known Secondary structure		.															G	G
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions