Job Description P17443 Confidence 99.91% Date Thu Jan 5 11:36:10 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 347 % Identity 14% Template d2acva1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDPGT-like Resolution 2.00

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		1	.	.			.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40											.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	G	.	.	Q	G	K	R	L	M	V	M	A	G	G	T	G	G	H	V	F	P	G	L	A	V	A	H	H	L	M	A	Q	G	W	Q	V	R	W	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	D	R	M	E	A	D	L	V	P	K	H	G	I	E	I	D	F	I	R	I	S	G	L	R	G	K
Query Conservation					.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	S	D	I	N	K	N	S	E	L	I	F	I	P	A	P	G	I	G	H	L	A	S	A	L	E	F	A	K	L	L	T	N	H	D	K	N	L	Y	I	T	V	F	C	I	K	F	P	G	M	P	F	A	D	S	Y	I	K	S	V	L	A	S	Q	P	Q	I	Q	L	I	D	L	P	E	V	E	P	P	P	Q
Template Known Secondary structure																	S	S	T	T	T														T		T	T											T	T														S		T	T														G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.						.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	K	A	L	I	A	A	P	L	R	I	F	N	A	.	.	.	.	.	W	R	Q	A	R	A	I	M	K	A	Y	K	P	D	V	V	L	G	M	G	G	Y	V	S	G	P	G	G	L	A	A	W	S	L	G	I	P	V	V	L	H	E	Q	N	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.																				.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.
Template Sequence		E	L	L	K	S	P	E	F	Y	I	L	T	F	L	E	S	L	I	P	H	V	K	A	T	I	K	T	I	L	S	N	K	V	V	G	L	V	L	D	.	.	F	F	C	V	S	M	I	D	V	G	N	E	F	G	I	P	S	Y	L	F	L	T	S	N	V	G	F	L	S	L	M	L	S	L	K	N	R	Q	I
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S												T														T	T								.	.	G	G	G	G	G	G							T	T								S	S											G	G	G	S		T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																																																																		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	T	N	K	W	L	A	K	I	A	T	K	V	M	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	E	V	F	D	D	S	D	R	D	H	Q	L	L	N	I	P	G	I	S	N	Q	V	P	S	N	V	L	P	D	A	C	F	N	K	D	G	G	Y	I	A	Y	Y	K	L	A	E	R	F	R	D	T	K	G	I	I	V	N	T	F	S	D	L	E	Q	S	S	I	D	A	L	Y	D	H	D	E	K	I	P	P
Template Known Secondary structure		T						S	S	G	G	G						T	T		S	S				G	G	G	S							T	T	T													T	T	S	S					S																		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	P	G	A	F	P	N	A	E	V	V	G	N	P	V	R	T	D	V	L	A	L	P	L	P	Q	Q	R	L	A	G	R	E	G	P	V	R	V	L	V	V	G	G	S	Q	G	A	R	I	L	N	Q	T	M	P	Q	V	A	A	K	L	G	D	S	V	T	I	W	H	Q	S	G	K	G	S	Q	Q	S	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	A	V	G	P	L	L	D	L	K	G	Q	P	N	P	K	L	D	Q	A	Q	H	D	L	I	L	K	W	L	D	E	Q	P	D	K	S	V	V	F	L	C	F	G	S	M	G	V	S	F	G	P	S	Q	I	R	E	I	A	L	G	L	K	H	S	G	V	R	F	L	W	S	N	S	A	E	K	K	V	F
Template Known Secondary structure											S	S				B	T	T	B														T	S		T	T									S	S																				T											G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		227	.			.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure				.	.																								.																																													.
Query SS confidence				.	.																								.																																													.
Query Sequence		E	Q	.	.	A	Y	A	E	A	G	Q	P	Q	H	K	V	T	E	F	I	D	D	M	A	A	A	Y	.	A	W	A	D	V	V	V	C	R	S	G	A	L	T	V	S	E	I	A	A	A	G	L	P	A	L	F	V	P	F	Q	H	K	D	R	Q	Q	Y	W	N	A	L	P	L	.	E	K	A	G	A	A	K
Query Conservation				.	.																								.																																													.
Alig confidence				.	.																								.																													.	.	.														.
Template Conservation																																																										.	.	.
Template Sequence		P	E	G	F	L	E	W	M	E	L	E	G	K	G	M	I	C	G	W	A	P	Q	V	E	V	L	A	H	K	A	I	G	G	F	V	S	H	C	G	W	N	S	I	L	E	S	M	W	F	G	V	P	I	L	T	W	.	.	.	P	I	Y	A	E	Q	Q	L	N	A	F	R	L	V	K	E	W	G	V	G	L
Template Known Secondary structure			T	T										S					S	S									S	T	T																			T	T							.	.	.			S	T	T											T	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		303	.	.	.	.	.							.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.							.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																			.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																			.	.
Query Sequence		I	I	E	Q	P	Q	.	.	.	.	.	.	L	S	V	D	A	V	A	N	T	L	A	G	W	S	R	.	.	.	.	.	.	E	T	L	L	T	M	A	E	R	A	R	A	A	S	I	P	D	A	.	.	T	E	R	V	A	N	E	V	S	R	V
Query Conservation								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																			.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	R	V	D	Y	R	K	G	S	D	V	V	A	A	E	E	I	E	K	G	L	K	D	L	M	D	K	D	S	I	V	H	K	K	V	Q	E	M	K	E	M	S	R	N	A	V	V	D	G	G	S	S	L	I	S	V	G	K	L	I	D	D	I
Template Known Secondary structure			S		S	S			T	T																	T		T	T		T																T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.