Job Description P17443 Confidence 98.79% Date Thu Jan 5 11:36:10 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 330 % Identity 15% Template c3pe3D_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:udp-n-acetylglucosamine--peptide n- PDBTitle: structure of human o-glcnac transferase and its complex with a peptide2 substrate Resolution 2.78 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.			.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.				.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.																								.	.	.
Query SS confidence																								.	.																								.	.	.
Query Sequence		S	G	Q	G	K	R	L	M	V	M	A	G	G	T	G	G	H	V	F	P	G	L	.	.	A	V	A	H	H	L	M	A	Q	G	W	Q	V	R	W	L	G	T	A	D	R	M	E	.	.	.	A	D	L	V	P	K	H	G	I	E	I	D	F	I	R	I	S	G	L	R	G	K	G	I	K	A	L	I	A	A
Query Conservation																								.	.																								.	.	.
Alig confidence																								.	.																								.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	G	R	L	R	V	G	Y	V	S	S	D	F	G	N	H	P	T	S	H	L	M	Q	S	I	P	G	M	H	N	P	D	K	F	E	V	F	C	Y	A	L	S	P	D	D	G	T	N	F	R	V	K	V	M	A	E	A	N	H	F	I	D	L	S	Q	I	P	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T									S		S	S	S	S							T	T	S	G	G	G	S		T	T	T								S	S				S											S	S					G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.		.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		P	L	R	I	F	N	A	W	R	Q	A	R	A	I	M	K	A	Y	K	P	D	V	V	L	G	M	G	G	Y	V	S	G	P	G	G	L	A	A	W	S	L	G	I	P	V	V	L	H	E	Q	N	.	G	I	A	G	L	T	N	K	W	L	A	K	I	A	T	K	V	M	Q	A	F	P	G	A	F	P	N	A
Query Conservation																																																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	G	K	A	A	D	R	I	H	Q	D	G	I	H	I	L	V	N	M	N	G	Y	T	K	G	A	R	N	E	L	F	A	L	R	P	A	P	I	Q	A	M	W	L	G	Y	P	G	T	S	G	A	L	F	M	D	Y	I	I	T	D	Q	E	T	S	P	A	E	V	A	E	Q	Y	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.												T		S					S		S	S	S	T	T			T					T			S	S						S	S		S	S					T	T								T	T	T	S		G	G	G	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	V	V	G	N	P	V	R	T	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	L	A	Y	M	P	H	T	F	F	I	G	D	H	A	N	M	F	P	H	L	K	K	K	A	V	I	D	F	K	I	Y	D	N	R	I	V	L	N	G	I	D	L	K	A	F	L	D	S	L	P	D	V	K	I	V	K	M	K	C	A	L	N	M	P	V	I	P	M	N	T	I	A	E	A	V	I	E	M
Template Known Secondary structure		S						S	S		S										G	G	G	S	S										S	S	S						T	T							T	S	S																		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		684	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.
																																						167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.		.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	L	P	L	P	Q	Q	R	L	A	G	R	E	G	P	V	R	V	L	V	V	G	G	S	.	Q	G	A	R	I	L	N	Q	T	M	P	Q	V	A	A	K	L	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	R	G	Q	I	Q	I	T	I	N	G	F	S	I	S	N	G	L	A	T	T	Q	I	N	N	K	A	A	T	G	E	E	V	P	R	T	I	I	V	T	T	R	S	Q	Y	G	L	P	E	D	A	I	V	Y	C	N	F	N	Q	L	Y	K	I	D	P	S	T	L	Q	M	W	A	N	I	L	K	R	V	P
Template Known Secondary structure				T	T		S					T	T						G	G	G											T	S	S				S						S	T	T	T	T			T	T	S							S		G	G	G																S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.			.	.	.	.	240	.	.	.	.	.			.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.											.	.														.	.	.
Query SS confidence																												.	.											.	.														.	.	.
Query Sequence		D	S	V	T	I	W	H	Q	S	G	K	G	S	Q	Q	S	V	E	Q	A	Y	A	E	A	G	Q	.	.	P	Q	H	K	V	T	E	F	I	D	.	.	D	M	A	A	A	Y	A	W	A	D	V	V	V	.	.	.	C	R	S	G	A	L	T	V	S	E	I	A	A	A	G	L	P	A	L	F	V	P	F	Q
Query Conservation																												.	.											.	.														.	.	.
Alig confidence																												.	.											.	.														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	S	V	L	W	L	L	R	F	P	A	V	G	E	P	N	I	Q	Q	Y	A	Q	N	M	G	L	P	Q	N	R	I	I	F	S	P	V	A	P	K	E	E	H	V	R	R	G	Q	L	A	D	V	C	L	D	T	P	L	C	N	G	H	T	T	G	M	D	V	L	W	A	G	T	P	M	V	T	M	P	G	E
Template Known Secondary structure		S								T	T	T	T												T	T			G	G	G															G	G	G	G		S						S	S	S			S									T	T					B				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.			.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.																			.	.	.
Query SS confidence																																									.	.																			.	.	.
Query Sequence		H	K	D	R	Q	Q	Y	W	N	A	L	P	L	E	K	A	G	A	A	K	I	I	E	Q	P	Q	L	S	V	D	A	V	A	N	T	L	A	G	W	.	.	S	R	E	T	L	L	T	M	A	E	R	A	R	A	A	S	I	P	.	.	.	D	A	T	E	R	V	A	N	E	V	S	R	V	A	R
Query Conservation																																									.	.																			.	.	.
Alig confidence										.	.																.	.	.												.	.																			.	.	.
Template Conservation										.	.																.	.	.
Template Sequence		T	L	A	S	R	V	A	A	.	.	S	Q	L	T	C	L	G	C	L	E	L	I	A	K	N	.	.	.	R	Q	E	Y	E	D	I	A	V	K	L	G	T	D	L	E	Y	L	K	K	V	R	G	K	V	W	K	Q	R	I	S	S	P	L	F	N	T	K	Q	Y	T	M	E	L	E	R	L	Y	L
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	T				.	.							T		G	G	G	B		S	S	.	.	.																																S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure										.	.																.	.	.
Template SS confidence
		940	.	.	.	.	.	.	.			.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.				.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.