Job Description P17443 Confidence 99.90% Date Thu Jan 5 11:36:10 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 346 % Identity 14% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.																.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.										.	.	.	.	.	.	60	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	R	L	M	V	M	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	G	G	H	V	F	P	G	L	A	V	A	H	H	L	M	A	Q	G	W	Q	V	R	W	L	G	T	A	D	R	M	E	A	D	L	V	P	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	E	I	D	F	I	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	R	I	V	R	I	P
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	S	G	L	R	G	K	G	I	K	A	L	I	A	A	P	L	R	I	F	N	A	W	R	Q	A	R	A	I	M	K	A	Y	K	P	D	V	V	L	G	M	G	G	Y	V	S	G	P	G	G	L	A	A	W	S	L	G	I	P	V	V	L	H	E	Q	N	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	.	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F	T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M	E	K	L	N	V	N	T	S
Template Known Secondary structure			S		S	S				G	G	G		G	G	G																.	T				S																													S	S								T	T				S	T
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
																131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	T	N	K	W	L	A	K	I	A	T	K	V	M	Q	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	A	F	P	N	A	E	V	V	G	N	P	V	R	T	D	V	L	A	L	P	L	P	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D	K	F	S	V	I	P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A	K
Template Known Secondary structure		T	S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G	G								B		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
								173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.			210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.																	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	Q	Q	R	L	A	G	R	E	G	P	V	R	V	L	V	V	G	G	S	Q	G	A	R	I	L	N	Q	T	M	P	Q	V	A	A	K	L	G	.	.	D	S	V	T	I	W	H	Q	S	G	K	G	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	V	E	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R	G	I	E	N	P	F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K	I	I	E
Template Known Secondary structure										S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T															S	S		S	B	T	T	T	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.					.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	A	E	A	G	Q	P	Q	H	K	V	T	E	F	I	D	D	M	A	A	A	Y	A	W	.	.	.	.	A	D	V	V	V	C	R	S	G	A	L	T	V	S	E	I	A	A	A	G	L	P	A	L	F	V	P	F	Q	H	K	D	R	Q	Q	Y	W	N	A	L	P	L	E	K	A	G	A	A	K	I	I
Query Conservation																											.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A	S	G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G	V	L	V
Template Known Secondary structure						T	T		B	T	T								S														T	T								S		B				S								T	T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.			.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																	.
Query SS confidence																			.	.																	.
Query Sequence		E	Q	P	Q	L	S	V	D	A	V	A	N	T	L	A	G	W	.	.	S	R	E	T	L	L	T	M	A	E	R	A	R	A	A	S	.	I	P	D	A	T	E	R	V	A	N	E	V	S	R	V	A	R
Query Conservation																			.	.																	.
Alig confidence					.	.													.	.																	.
Template Conservation					.	.
Template Sequence		D	P	E	.	.	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	S	E	E	T	W	S	A	Y	Q	E	K	G	K	Q	R	V	E	E	R	Y	T	W	Q	E	T	A	R	G	Y	L	E	V	I	Q
Template Known Secondary structure			T	T	.	.														S																				S	B
Template Predicted Secondary structure					.	.
Template SS confidence
		407	.	.			410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.