Job Description P27127 Confidence 97.90% Date Thu Jan 5 11:43:14 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 349 % Identity 11% Template d2vcha1 SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDPGT-like Resolution 1.45

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.		.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.					.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																										.	.	.	.
Query SS confidence																											.																										.	.	.	.
Query Sequence		I	A	F	I	G	E	A	V	S	G	F	G	G	M	E	T	V	I	R	D	V	I	T	T	F	.	R	Q	Q	H	I	Q	S	E	M	F	F	F	C	R	N	D	K	M	D	K	G	W	L	E	G	.	.	.	.	I	K	Y	S	C	S	F	S	N	I	R	L	G	F	L	R	R	A	K	H	I	H	A	L	S
Query Conservation																											.																										.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.																	.																										.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.
Template Sequence		V	A	I	I	P	S	.	.	.	P	G	M	G	H	L	I	P	L	V	E	F	A	K	R	L	V	H	L	H	G	L	T	V	T	F	V	I	A	G	E	G	P	P	S	A	Q	R	T	V	L	D	L	P	S	S	I	S	S	V	F	L	P	P	V	D	L	T	D	L	S	S	S	T	R	I	E	S	R	I	S
Template Known Secondary structure								.	.	.	S																														S	S	S												T	T												T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.				.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	W	L	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	P	D	I	V	I	C	I	D	V	I	S	C	L	F	A	A	K	A	R	K	K	S	G	I	D	M	P	V	F	S	W	P	H	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	V	T	R	S	N	P	E	L	R	K	V	F	D	S	F	V	E	G	G	R	L	P	T	A	L	V	V	D	L	F	G	T	D	A	F	D	V	A	V	E	F	H	V	P	P	Y	I	F	Y	P	T	T	A	N	V	L	S	F	F	L	H	L	P	K	L	D	E	T	V	S	C	E	F	R	E	L	T	E
Template Known Secondary structure						T	T														T	T				S						T	T		G	G	G							T	T									S																				S		G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
																													120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	H	K	K	H	A	E	Y	I	T	C	A	D	Y	H	L	A	I	S	.	.	.	.	.	S	G	I	K	Q	Q	M	I	N	R	G	V	A	E	S	T	I	N	V	I	F	N	P	V	E	T	K	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	M	L	P	G	C	V	P	V	A	G	K	D	F	L	D	P	A	Q	D	R	K	D	D	A	Y	K	W	L	L	H	N	T	K	R	Y	K	E	A	E	G	I	L	V	N	T	F	F	E	L	E	P	N	A	I	K	A	L	Q	E	P	G	L	D	K	P	P	V	Y	P	V	G	P	L	V	N	I	G	K
Template Known Secondary structure			B			T	T				B		G	G	G	S		G	G	G	S		T	T	S													G	G	G		S					S			T	T	T	S									S			T	T														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.							.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	I	P	A	P	E	.	.	.	.	.	.	E	G	E	T	A	T	F	I	Y	V	G	R	M	K	F	E	G	Q	K	R	V	K	D	L	L	D	G	L	S	Q	A	K	G	N	W	K	L	H	V	L	G	D	G	S	D	F	E	K	C	Q	A	Y	G	R	E	L	N	I	D	D	R	I	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	A	S	E	C	L	K	W	L	D	N	Q	P	L	G	S	V	L	Y	V	S	F	G	S	G	G	T	L	T	C	E	Q	L	N	E	L	A	L	G	L	A	D	S	E	Q	R	F	L	W	V	I	R	S	P	S	G	I	A	N	S	S	Y	F	D	S	Q	T	D	P	L	T	F	L	P	P	G	F	L	E
Template Known Secondary structure		S											T	S		T	T								T	T	T																		T	T												S	S	T	T	T	T	T	T				S		G	G	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
							237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.					.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	V	W	Y	G	W	Q	Q	Y	P	W	E	L	V	Q	Q	D	I	E	K	V	S	A	L	L	L	T	S	S	F	E	G	F	P	M	T	L	L	E	A	L	S	W	G	I	P	C	I	S	A	D	C	V	S	G	P	A	D	.	.	.	.	I	I	Q	P	D	V	N	G	H	L	Y	Q	P	G
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																.											.	.	.	.																												.	.	.	.
Template Conservation																						.											.	.	.	.
Template Sequence		R	T	K	K	R	G	F	V	I	P	F	W	A	P	Q	A	Q	V	L	A	.	H	P	S	T	G	G	F	L	T	H	.	.	.	.	C	G	W	N	S	T	L	E	S	V	V	S	G	I	P	L	I	A	W	P	L	Y	A	E	Q	K	M	N	A	V	L	L	S	E	D	I	R	A	A	L	R	P	R	A	G
Template Known Secondary structure			T	T	T	T						S										.	S	T	T								.	.	.	.													T									S	T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																						.											.	.	.	.
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.					.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		308						.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.		.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.						340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		D	.	.	.	.	.	I	A	G	F	V	T	L	L	N	K	Y	I	A	G	E	I	.	H	I	E	H	E	K	I	P	A	S	I	D	E	F	Y	.	.	.	.	.	Q	S	K	Y	Y	D	R	L	H	K	V	I	I	S	A	I	S	R	R	K
Query Conservation			.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	G	L	V	R	R	E	E	V	A	R	V	V	K	G	L	M	E	G	E	E	G	K	G	V	R	N	K	M	K	E	L	K	E	A	A	C	R	V	L	K	D	D	G	T	S	T	K	A	L	S	L	V	A	L	K	W	K	A	H	K	K
Template Known Secondary structure		T	T	S																T	S	T																				T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.