Job Description P27127 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:43:14 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 352 % Identity 14% Template d1uqta_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Trehalose-6-phosphate synthase, OtsA Resolution 2.0

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.				.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	A	F	I	G	E	A	V	S	G	.	.	.	F	G	G	M	E	T	V	I	R	D	V	I	T	T	F	R	Q	Q	H	I	Q	S	E	M	F	F	F	C	R	N	D	K	M	D	K	G	W	L	E	G	I	K	Y	S	C	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	V	V	V	S	N	R	I	A	P	P	D	S	A	G	G	L	A	V	G	I	L	G	A	L	K	A	A	G	G	L	W	F	G	W	S	G	E	T	G	N	E	D	Q	P	L	K	K	V	K	K	G	N	I	T	W	A	S	F	N	L	S	E	Q	D	L	D	E	Y	Y	N	Q	F	S	N	A	V	L	W
Template Known Secondary structure																																										S			S	S								T	T																	T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
												60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.			.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.										.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	I	R	L	G	F	L	R	R	A	K	H	I	H	A	L	S	K	W	L	Q	E	Y	.	.	Q	P	D	I	V	I	C	I	D	V	I	S	C	L	F	A	A	K	A	R	K	K	S	G	I	D	M	P	V	F	S	W	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	F	H	Y	R	L	D	L	V	Q	F	Q	R	P	A	W	D	G	Y	L	R	V	N	A	L	L	A	D	K	L	L	P	L	L	Q	D	D	D	I	I	W	I	H	D	Y	H	L	L	P	F	A	H	E	L	R	K	R	G	V	N	N	R	I	G	F	F	L	H	I	P	F	P	T	P	E	I	F	N	A
Template Known Secondary structure					T	T		G	G	G																							G	G	G			T	T							S	G	G	G	T	T								T	T			S								S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query Sequence		S	L	D	H	K	K	H	A	E	Y	I	T	C	A	D	Y	H	L	A	I	S	S	G	I	K	Q	Q	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	G	V	A	E	S	T	I	N	V	I	F	N	P	V	E	T	K	D	S	V	I	P	A	P	E	E	G	E	T	A	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	T	Y	D	T	L	L	E	Q	L	C	D	Y	D	L	L	G	F	Q	T	E	N	D	R	L	A	F	L	D	C	L	S	N	L	T	R	V	T	T	R	S	A	K	S	H	T	A	W	G	K	A	F	R	T	E	V	Y	P	I	G	I	E	P	K	E	I	A	K	Q	A	A	G	P	L	P	P	K	L	A
Template Known Secondary structure		S	T	T									T	T	S	S					S	S															S						T	T	T					T	T																							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
										180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.								.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	I	Y	V	G	R	M	K	F	E	G	Q	K	R	V	K	D	L	L	D	G	L	S	Q	A	K	G	N	.	.	.	.	.	.	.	W	K	L	H	V	L	G	D	G	S	D	F	E	K	C	Q	A	Y	G	R	E	L	N	I	D	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	K	A	E	L	K	N	V	Q	N	I	F	S	V	E	R	L	D	Y	S	K	G	L	P	E	R	F	L	A	Y	E	A	L	L	E	K	Y	P	Q	H	H	G	K	I	R	Y	T	Q	I	A	P	T	S	R	G	D	V	Q	A	Y	Q	D	I	R	H	Q	L	E	N	E	A	G	R	I	N	G	K	Y	G
Template Known Secondary structure							T	T	T										B		G	G	G																	G	G	G	T	T	T									B		S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
							236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.						.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	I	V	W	Y	G	W	Q	Q	Y	P	W	E	L	V	Q	Q	D	I	E	K	V	S	A	L	L	L	T	S	S	F	E	G	F	P	M	T	L	L	E	A	L	S	W	G	I	P	.	.	.	.	.	C	I	S	A	D	C	V	S	G	P	A	D	I	I	Q	P	D	V	N	G	H	L	Y	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.						.											.	.	.
Template Conservation																																																															.											.	.	.
Template Sequence		Q	L	G	W	T	P	L	Y	Y	L	N	Q	H	F	D	R	K	L	L	M	K	I	F	R	Y	S	D	V	G	L	V	T	P	L	R	D	G	M	N	L	V	A	K	E	Y	V	A	A	Q	D	P	A	N	P	G	V	L	V	L	S	Q	.	F	A	G	A	A	N	E	L	T	S	.	.	.	A	L	I	V	N
Template Known Secondary structure		B	T	T	B		S						S															S							S	S	B	S												S		T	T	S								T	.	T	B	G	G	G	G	T		T	T	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.											.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.		.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.				.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.
Query Sequence		P	G	D	I	A	G	F	V	T	L	L	N	K	Y	I	A	G	E	I	H	I	E	H	.	.	.	E	K	I	P	A	S	I	D	E	F	Y	Q	S	K	Y	Y	D	R	L	H	K	V	I	I	S	A	I	S	R
Query Conservation																									.	.	.
Alig confidence																									.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	D	R	D	E	V	A	A	A	L	D	R	A	L	T	M	S	L	A	E	R	I	S	R	H	A	E	M	L	D	V	I	V	K	N	D	I	N	H	W	Q	E	C	F	I	S	D	L	K	Q	I	V	P	R
Template Known Secondary structure		T	T														T																				T																S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.