Job Description P07024 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:06 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 458 % Identity 21% Template c2wdfA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:sulfur oxidation protein soxb; PDBTitle: termus thermophilus sulfate thiohydrolase soxb Resolution 2.08 Å

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		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.																																																						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	T	Y	K	I	T	V	L	H	T	N	D	H	H	G	H	F	W	R	N	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	Y	G
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	Y	G	D	A	T	L	L	Y	F	S	D	L	H	G	Q	A	F	P	H	Y	F	M	E	P	P	N	L	I	A	P	K	P	L	M	G	R	P	G	Y	L	T	G	E	A	I	L	R	Y	Y	G	V	E	R	G	T	P	L	A	Y	L	L	S	Y	V	D	F	V	E	L	A	R	T	F	G	P	I	G	G
Template Known Secondary structure					S	S										T	T			S		B	B					S						G	G	G	T	T	S	T	T	S											T			T	T	S								S	T	T											B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	A	Q	K	T	L	V	D	G	I	R	K	E	V	A	A	E	G	G	S	V	L	L	L	S	G	G	D	I	N	T	G	V	P	E	S	D	L	Q	D	A	E	P	D	F	R	G	M	N	L	V	G	Y	D	A	M	A	I	G	N	H	E	F	D	N	P	L	T	V	L	R	Q	Q	E	K	W	A	K	F
Query Conservation
Alig confidence																																																												.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		M	G	A	L	T	A	L	I	R	D	Q	K	A	R	V	E	A	E	G	G	K	A	L	V	L	D	G	G	D	T	W	T	N	S	G	L	S	L	L	T	R	G	E	A	V	V	R	W	Q	N	L	V	G	V	D	H	M	V	.	S	H	W	E	W	T	L	G	R	E	R	V	E	E	L	L	G	L	F	R	G
Template Known Secondary structure																			T	T									S			S	S	S	S						T	T	T											T						.		S	G	G	G	G	G														S
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	L	S	A	N	I	Y	Q	K	S	T	G	E	R	L	F	K	P	W	A	L	F	K	R	Q	D	L	K	I	A	V	I	G	L	T	T	D	D	T	A	K	I	G	N	P	E	Y	F	T	D	I	E	F	R	K	P	A	D	E	A	K	L	V	I	Q	E	L	Q	Q	T	E	K	P	D	I	I	I	A	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		E	F	L	S	Y	N	I	V	D	D	L	F	G	D	P	L	F	P	A	Y	R	I	H	R	V	G	P	Y	A	L	A	V	V	G	A	S	Y	P	Y	V	K	V	S	H	P	E	S	F	T	E	G	L	S	F	A	L	D	E	R	R	L	Q	E	A	V	D	K	A	R	A	.	E	G	A	N	A	V	V	L	L
Template Known Secondary structure						S	S				T	T	T			B	S	S		S							T	T											T	T					S		G	G	G	S	T	T																				.	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.		.	.	.	.	.	.	270	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	H	M	G	H	Y	D	N	G	E	H	G	S	N	A	P	G	D	V	E	M	A	R	A	L	P	A	G	S	L	A	M	I	V	G	G	H	S	Q	D	P	V	C	M	A	A	E	N	K	K	Q	V	D	Y	V	P	G	T	P	C	K	P	D	Q	Q	N	G	I	W	I	V	Q	A	H	E	W	G	K	Y	V
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	N	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	D	A	A	L	A	E	R	I	R	G	I	D	L	I	L	S	G	H	T	H	D	L	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	W	R	V	G	K	T	W	I	V	A	G	S	A	A	G	K	A	L
Template Known Secondary structure				S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	S	S	S								S	S					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S					T	T								S	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.													.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	R	A	D	F	E	F	R	N	G	E	M	K	M	V	N	Y	Q	L	I	P	V	N	L	K	K	K	V	T	W	E	D	G	K	S	E	R	V	L	Y	T	P	E	I	A	E	N	Q	Q	M	I	S	L	L	S	P	F	Q	N	K	G	K	A	Q	L	E	V	K	I	G	E	T	N	G	R	L	E	G	D	R
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	R	V	D	L	K	L	W	K	G	G	I	A	N	L	R	V	R	V	L	P	V	L	A	E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	K	A	E	D	V	E	A	F	L	K	A	Q	L	A	P	H	Q	D	H	L	F	T	P	L	A	V	S	E	T	L	L	Y	K	R	D
Template Known Secondary structure										T	T													B	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S															G	G	G						S						S	S		B
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.		.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410		.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.		.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure																									.													.																						.
Query SS confidence																									.													.																						.
Query Sequence		D	K	V	R	F	V	Q	T	N	M	G	R	L	I	L	A	A	Q	M	D	R	T	G	.	A	D	F	A	V	M	S	G	G	G	I	R	.	D	S	I	E	A	G	D	I	S	Y	K	N	V	L	K	V	Q	P	F	G	N	.	V	V	V	Y	A	D	M	T	G	K	E	V	I	D	Y	L	T	A	V	A	Q
Query Conservation																									.													.																						.
Alig confidence				.	.	.	.																		.													.																						.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		T	L	.	.	.	.	Y	S	T	W	D	Q	L	V	G	E	A	V	K	A	I	Y	P	E	V	E	V	V	F	S	P	A	V	R	W	G	T	T	I	L	P	G	Q	A	I	T	W	D	H	L	Y	A	Y	T	G	F	T	Y	P	E	L	Y	L	F	Y	L	R	G	A	Q	I	K	A	V	L	E	D	I	A	S
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.																	T	T										S				B	B		T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.					.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		453								.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.						.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Query Sequence		M	.	.	.	.	.	.	.	K	P	D	S	G	A	Y	P	Q	F	A	N	V	S	F	V	A	K	.	.	.	.	.	D	G	K	L	N	D	L	K	I	K	G	E	P	V	D	P	A	K	T	Y	R	M	A	T	L	N	F	N	A	T	G	G	D	G	Y	P	R	L	D	N	K	P	G	Y	V	N	T	G	F
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		N	V	F	T	S	D	P	F	Y	Q	Q	G	G	D	V	S	R	V	F	G	L	R	Y	V	L	D	P	D	A	P	T	G	E	R	V	R	E	V	E	V	G	G	R	P	L	D	P	N	R	R	Y	L	A	A	A	Y	.	.	.	.	.	G	G	R	L	Q	R	V	G	E	A	K	P	G	.	.	Y	E	P	R
Template Known Secondary structure				T		S		T	T	T											T							T	T	S		T	T	S	S							T	T					T	T	S								.	.	.	.	.	S	S	S	G	G	G	G	S				T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.						.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.			.	.	.	.
		521	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	E	V	L	K	A	Y	I	Q	K	S	S	P	L	D	V	S	V	Y	E	P	K	G	E	V	S	W	Q
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	Y	E	V	L	A	E	Y	L	R	S	V	G	R	V	R	.	.	.	.	.	V	R	P	E	P	N	V	K
Template Known Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.						.	.	.	.	.	.	.	560