Job Description P00959 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:21 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 339 % Identity 23% Template d1ivsa4 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.90

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.					.	.	.	70	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	V	A	K	K	I	L	V	T	C	A	L	P	Y	A	N	G	S	I	H	L	G	H	M	L	E	H	I	Q	A	D	V	W	V	R	Y	Q	R	M	R	G	H	E	V	N	F	I	C	A	D	D	A	H	G	T	P	I	M	L	K	A	Q	Q	L	.	.	.	.	G	I	T	P	E	Q	M	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																		.	.	.	.								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	K	P	P	F	V	I	F	M	P	P	P	N	V	T	G	S	L	H	M	G	H	A	L	D	N	S	L	Q	D	A	L	I	R	Y	K	R	M	R	G	F	E	A	V	W	L	P	G	T	D	H	A	G	I	A	T	Q	V	V	V	E	R	L	L	L	K	E	G	K	T	R	H	D	L	G	R	E	K	F
Template Known Secondary structure				S											B	S	S	S																						T	T	T	S									B			T													T	T	T			G	G	G	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
									74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	I	G	E	M	S	Q	E	H	Q	T	D	F	A	G	F	N	I	S	Y	D	.	.	N	Y	H	S	T	H	S	E	E	N	R	Q	L	S	E	L	I	Y	S	R	L	K	E	N	G	F	I	K	N	R	T	I	S	Q	L	Y	D	P	E	K	G	M	F	L	P	D	R	F	V	K	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																					.	.																																																	.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		L	E	R	V	W	Q	W	K	E	E	S	G	G	T	I	L	K	Q	L	K	R	L	G	A	S	A	D	W	S	R	E	A	F	T	M	D	E	K	R	S	R	A	V	R	Y	A	F	S	R	Y	Y	H	E	G	L	A	Y	R	A	P	R	L	V	N	W	C	P	R	C	E	T	T	L	S	D	L	E	.	.	.
Template Known Secondary structure																							T	T					G	G	G				T	T	S																T	T	S	S												T	T	T	T					G	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Query SS confidence																																																																				.	.
Query Sequence		T	C	P	K	C	K	S	P	D	Q	Y	G	D	N	C	E	V	C	G	A	T	Y	S	P	T	E	L	I	E	P	K	S	V	V	S	G	A	T	P	V	M	R	D	S	E	H	F	F	F	D	L	P	S	F	S	E	M	L	Q	A	W	T	R	S	G	A	.	.	L	Q	E	Q	V	A	N	K	M	Q	E	W
Query Conservation																																																																				.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	T	C	S	R	C	G	T	P	I	E	Y	A	I	F	P	Q	W	W	L	R	M	R	P	L	A	E	E	V	L	K	G	L	R	R	G	D	I	A	F	V	P	E	R	W	K	K	V	N	M	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B			B	T	T	T		S																												T					S	S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																														188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	S	G	L	Q	Q	W	D	I	S	R	D	A	P	Y	F	G	F	E	I	P	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	K	Y	F	Y	V	W	L	D	A	P	I	G	Y	M	G	S	F	K	N	L	C
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		W	L	E	N	V	K	D	W	N	I	S	R	Q	L	W	.	W	G	H	Q	I	P	A	W	Y	C	E	D	C	Q	A	V	N	V	P	R	P	E	R	Y	L	E	D	P	T	S	C	E	A	C	G	S	P	R	L	K	R	D	E	D	V	F	D	T	W	F	S	S	A	L	W	P	L	S	T	L	G	W	P	E
Template Known Secondary structure					T											S	.	S	S									T	T	T								G	G	G	T	T					S		T	T	T			S																T	S		T	T	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.		.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.															.
Query SS confidence																																														.															.
Query Sequence		D	K	R	G	D	S	V	S	F	D	E	Y	W	K	K	D	S	T	A	E	L	Y	H	F	I	G	K	D	I	V	Y	F	H	S	L	F	W	P	A	M	L	E	G	S	.	N	F	R	K	P	S	N	L	F	V	H	G	Y	V	.	T	V	N	G	A	K	M	S	K	S	R	G	T	F	I	K	A	S	T	W
Query Conservation																																														.															.
Alig confidence			.	.	.	.												.	.	.	.	.																								.															.
Template Conservation			.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	T	E	D	L	K	A	F	Y	P	G	D	.	.	.	.	.	V	L	V	T	G	Y	D	I	L	F	L	W	V	S	R	M	E	V	S	G	Y	H	F	M	G	E	R	P	F	K	T	V	L	L	H	G	L	V	L	D	E	K	G	Q	K	M	S	K	S	K	G	N	V	I	D	P	L	E	M
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.		S					S		S	B	S	.	.	.	.	.						G	G	G	T	T	T	T												S	S	S		S	B	S											T	T	S	S	B		B	T	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472					.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.						.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	H	F	D	A	D	S	L	R	Y	Y	Y	T	A	K	L	S	S	R	I	D	D	I	D	L	N	L	E	D	F	V	Q	R	V	N
Query Conservation
Alig confidence																				.
Template Conservation																				.
Template Sequence		V	E	R	Y	G	A	D	A	L	R	F	A	L	I	Y	L	A	T	.	G	G	Q	D	I	R	L	D	L	R	W	L	E	M	A	R	N
Template Known Secondary structure																				.	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.
Template SS confidence
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560		.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.