Job Description P00959 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:21 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 344 % Identity 24% Template d1h3na3 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.0

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Q	V	A	K	K	I	L	V	T	C	A	L	P	Y	A	N	G	S	I	H	L	G	H	M	L	E	H	I	Q	A	D	V	W	V	R	Y	Q	R	M	R	G	H	E	V	N	F	I	C	A	D	D	A	H	G	T	P	I	M	L	K	A	Q	Q	L	G	I	T	P	E	Q	M	I	G	E	M	S	Q	E	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	G	G	R	G	K	Q	Y	V	L	V	M	F	P	Y	P	S	G	D	L	H	M	G	H	L	K	N	Y	T	M	G	D	V	L	A	R	F	R	R	M	Q	G	Y	E	V	L	H	P	M	G	W	D	A	F	G	L	P	A	E	N	A	A	L	K	F	G	V	H	P	K	D	W	T	Y	A	N	I	R	Q	A
Template Known Secondary structure				T	T												S	S	S			B																				T	T									B			S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		Q	T	D	F	A	G	F	N	I	S	Y	D	.	.	N	Y	H	S	T	H	S	E	E	N	R	Q	L	S	E	L	I	Y	S	R	L	K	E	N	G	F	I	K	N	R	T	I	S	Q	L	Y	D	P	E	K	G	M	F	L	P	D	R	F	V	K	G	T	C	P	K	C	K	S	P	D	Q	Y	G	D	N	C
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	S	L	R	L	M	G	I	L	Y	D	W	D	R	E	V	T	T	C	E	P	E	Y	Y	R	W	N	Q	W	I	F	L	K	M	W	E	K	G	L	A	Y	R	A	K	G	L	V	N	W	C	P	K	C	Q	T	V	L	A	N	E	Q	V	V	E	G	R	C	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T					G	G	G			B	T	T	S																	T	T													T	T	T	T					G	G	G			T	T			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	C	G	A	T	Y	S	P	T	E	L	I	E	P	K	S	V	V	S	G	A	T	P	V	M	R	D	S	E	H	F	F	F	D	L	P	S	F	S	E	M	L	Q	A	W	T	R	S	G	A	L	Q	E	Q	V	A	N	K	M	Q	E	W	F	E	S	G	L	Q	Q	W	D	I	S	R	D	A	P	Y	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	D	T	P	V	E	K	R	E	L	E	Q	W	Y	L	R	I	T	A	Y	A	E	R	L	L	K	D	L	E	G	L	N	W	P	E	K	V	K	A	M	Q	R	A	W	I	G	R	.	L	R	D	W	L	I	S	R	Q	R	.	Y	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	B													G	G	G	G							T	T	T	T		B	S															.									S		.	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.											.
Template SS confidence
																				179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.
		240	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	E	I	P	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	K	Y	F	Y	V	W	L	D	A	P	I	G	Y	M	G
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	P	I	P	M	V	H	C	E	A	C	G	V	V	P	V	P	E	E	E	L	P	V	L	L	P	D	L	K	D	V	E	D	I	R	P	K	G	K	S	P	L	E	A	H	P	E	F	Y	E	T	T	C	P	K	C	G	G	P	A	K	R	D	T	D	T	M	D	T	F	F	D	S	S	W	Y	Y	L	R
Template Known Secondary structure		S									T	T	T							G	G	G															S		S	S	S		G	G	G	G										T	T	T		S															T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
		264	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.				.	.	.	.	310	.	.	.	.	.					.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																																		.	.	.											.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																																		.	.	.											.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	F	K	N	L	C	D	K	R	.	G	D	S	V	S	F	D	E	Y	W	K	K	D	S	T	A	E	L	Y	H	F	I	G	K	D	I	V	Y	F	H	S	L	F	.	.	.	W	P	A	M	L	E	G	S	N	F	.	.	.	.	R	K	P	S	N	L	F	V	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.																																		.	.	.											.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.														.	.	.	.	.																.	.	.											.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	D	P	H	N	D	R	L	P	F	D	P	E	K	A	N	A	W	M	P	V	D	.	.	.	.	.	Q	Y	I	G	G	V	E	H	A	V	L	H	L	L	Y	S	R	F	F	T	K	F	L	H	D	L	G	M	V	K	V	E	E	P	F	Q	G	L	F	T	Q	G	M	V	L	A	W	T	D	F	G	P
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T		S	S	S	S	S										S	B	S	.	.	.	.	.						G	G	G	T	T	T															T	T	S		S		S		S	B	S	B
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.						.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
																																														326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	T	V	N	G	A	K	M	S	K	S	R	G	T	F	I	K	A	S	T	W	L	N	H	F	D	A	D	S	L	R	Y	Y	Y	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	V	E	G	S	V	V	R	L	P	E	P	T	R	I	R	L	E	I	P	E	S	A	L	S	L	E	D	V	R	K	M	G	A	E	L	R	P	H	E	D	G	T	L	H	L	W	K	P	A	V	M	S	K	S	K	G	N	G	V	M	V	G	P	F	V	K	E	Q	G	A	D	I	A	R	I	T	I	L
Template Known Secondary structure						T	T													T		S		S										T	T							T	T	S	S											T	T	T	T				B								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	L	S	S	R	I	D	D	I	D	L	N	L	E	D	F	V	Q	R
Query Conservation
Alig confidence								.
Template Conservation								.
Template Sequence		F	A	A	P	P	E	.	N	E	M	V	W	T	E	E	G	V	Q	G	A
Template Known Secondary structure				S		T	T	.	S
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		666	.	.	.	670	.		.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.