Job Description P00959 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:57:21 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 351 % Identity 17% Template c3c8zB_ PDB info PDB header:ligase Chain: B: PDB Molecule:cysteinyl-trna synthetase; PDBTitle: the 1.6 a crystal structure of mshc: the rate limiting2 enzyme in the mycothiol biosynthetic pathway Resolution 1.60 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	L	V	T	C	A	L	P	Y	A	N	G	S	I	H	L	G	H	M	L	E	H	I	Q	A	D	V	W	V	R	Y	Q	R	M	R	G	H	E	V	N	F	I	C	A	D	D	A	H	G	T	P	I	M	L	K	A	Q	Q	L	G	I	T	P	E	Q	M	I	G	E	M	S	Q	E	H	Q	T	D	F	A
Query Conservation
Alig confidence								.	.
Template Conservation								.	.
Template Sequence		T	M	Y	V	C	G	.	.	I	T	P	Y	D	A	T	H	L	G	H	A	A	T	Y	L	T	F	D	L	V	H	R	L	W	L	D	A	G	H	T	V	Q	Y	V	Q	N	V	T	D	V	D	D	P	L	F	E	R	A	E	R	D	G	I	D	W	R	T	L	G	D	R	E	T	Q	L	F	R	E	D	M	A
Template Known Secondary structure								.	.			T	T	S			B																				T	T												S												T
Template Predicted Secondary structure								.	.
Template SS confidence
		39	40	.	.	.	.			.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		G	F	N	I	.	S	Y	D	N	Y	H	S	T	H	S	E	E	N	R	Q	L	S	E	L	I	Y	S	R	L	K	E	N	G	F	I	K	N	R	T	I	S	Q	L	Y	D	P	E	K	G	M	F	L	P	D	R	F	V	K	G	T	C	P	K	C	K	S	P	D	Q	Y	G	D	N	C	E	V	C	G	A	T
Query Conservation						.
Alig confidence						.											.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	R	V	L	P	P	H	D	Y	V	A	A	T	D	.	.	A	I	A	E	V	V	E	M	V	E	K	L	L	A	S	G	A	A	Y	I	V	E	D	A	E	Y	P	D	V	Y	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	A	T	A	Q	F	G	Y	E
Template Known Secondary structure			T	T					S					G	G	G	.	.																T	S					S		S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.			.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
				166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	Y	S	P	T	E	L	I	E	P	K	S	V	V	S	G	A	T	P	V	M	R	D	S	E	H	F	F	F	D	L	P	S	F	S	E	M	L	Q	A	W	T	R	S	G	A	L	Q	E	Q	V	A	N	K	M	Q	E	W	F	E	S	G	L	Q	Q	W	D	I	S	R	D	A	P	Y	F	G	F	E	I
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		S	G	Y	D	R	D	T	M	L	T	L	F	A	E	R	G	G	D	P	D	R	P	G	K	S	D	Q	L	D	A	L	L	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	R	P	G	E	P	S	W	P	S	P	.	F	G	R	G	R
Template Known Secondary structure		T														T	T			T	T		T	T		S	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S			B			T	.	T		S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.			.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		P	N	A	P	G	K	Y	F	Y	V	W	L	D	A	P	I	G	Y	M	G	S	F	K	N	L	C	D	K	R	G	D	S	V	S	F	D	E	Y	W	K	K	D	S	T	A	E	L	Y	H	F	I	G	K	D	I	V	Y	F	H	S	L	F	W	P	A	M	L	E	G	S	.	.	N	F	R	K	P	S	N	L
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	W	H	V	E	C	S	A	I	A	L	T	R	I	G	T	G	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	G	G	G	S	D	L	I	F	P	H	H	E	Y	S	A	A	H	A	E	S	V	T	G	E	R	R	F	A	R	H	Y
Template Known Secondary structure																T		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	T	T	T																S		S		S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	H	G	Y	V	T	V	N	G	A	K	M	S	K	S	R	G	T	F	I	K	A	S	T	W	L	N	H	F	D	A	D	S	L	R	Y	Y	Y	T	A	K	L	S	S	R	I	D	D	I	D	L	N	L	E	D	F	V	Q	R	V	N	A	D	I	V	N	K	V	V	N	L	A	S	R	N	A	G	F	I
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	H	T	G	M	I	G	V	L	V	S	Q	L	R	A	Q	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	A	I	R	L	G	L	F	S	G	H	Y	.	.	R	E	D	R	F	W	S	N	E	V	L	D	E	A	N	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	R	W	R	S	A	T
Template Known Secondary structure							B			B							T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	S		T	.	.	T	S		B														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.													.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.										.	.	.	330	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.		.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		N	K	R	F	D	G	V	L	A	S	E	L	A	D	P	Q	L	Y	K	T	F	T	D	A	A	E	V	I	G	E	A	W	.	E	S	R	E	F	G	K	A	V	R	E	I	M	A	L	A	D	L	A	N	R	Y	V	D	E	Q	A	P	W	V	V	A	K	Q	E	G	R	D	A	D	L	Q	A	I	C	S	M
Query Conservation																																		.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	P	E	A	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	D	V	I	A	R	V	R	Q	Y	L	A	D	D	L	D	T	P	K	A	L	A	A	L	D	G	W	C	T	D	A	L	S	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	D	T	E	S	P	R	L	V	A	T	T
Template Known Secondary structure		T	S	S	S	B	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														B	T																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	B	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.														.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390												.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		481	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	N	L	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	D	A	L	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.