Job Description P39383 Confidence 99.48% Date Thu Jan 5 12:00:15 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 246 % Identity 21% Template c3jvpA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:ribulokinase; PDBTitle: crystal structure of ribulokinase from bacillus halodurans Resolution 2.31 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20			.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.		.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence																					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		A	Y	S	I	G	I	D	S	G	S	T	A	T	K	G	I	L	L	A	.	.	D	G	V	I	T	R	R	F	L	V	P	T	P	F	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	A	I	T	E	A	W	E	T	L	R	E	G	L	.	E	T	T
Query Conservation																					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence																					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	T	I	G	V	D	Y	G	T	E	S	G	R	A	V	L	I	D	L	S	N	G	Q	E	L	A	D	H	V	T	P	Y	R	H	G	V	I	D	Q	Y	L	P	N	T	N	I	K	L	G	H	E	W	A	L	Q	H	P	L	D	Y	V	E	V	L	T	T	S	V	P	A	V	M	K	E	D	A	D	D	V
Template Known Secondary structure											S	S									T	T	T												T	T			B	S	S	B	S	T	T	S			B			T	T														T	T											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		55	.	.	.	.	60	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	L	T	L	T	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	Q	L	V	D	F	A	D	K	Q	V	T	E	I	S	C	H	G	L	G	A
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	I	G	V	D	F	T	A	C	T	M	L	P	V	D	E	E	G	Q	P	L	C	L	L	A	Q	Y	K	D	N	P	H	S	W	V	K	L	W	K	H	H	A	A	Q	D	K	A	N	A	I	N	E	M	A	E	K	R	G	E	A	F	L	P	R	Y	G	G	K	I	S	S	E	W	M	I	A	K	V	W
Template Known Secondary structure										S	S							T	T	S		B	G	G	G	S	S	S	T	T	S	S	G	G	G	S				T	T			T	T															T		T	T	G	G	G	G	T	T				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	L	A	P	A	T	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	L	D	E	A	E	D	V	Y	N	R	T	D	Q	F	L	E	A	T	D	W	I	V	S	Q	M	T	G	K	I	V	K	N	S	C	T	A	G	Y	K	A	I	W	H	K	R	E	G	Y	P	S	N	E	F	F	K	A	L	D	P	R	L	E	H	L	T	T	T	K	L	R	G	D	I	V	P	L	G	E
Template Known Secondary structure															S															S	S												S			B	T	T	T	B	S								T	T		G	G	G	T	T	S	T	T	T	T	T		S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
																																												94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110														.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	D	I	G	G	Q	D	S	K	V	I	Q	L	D	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	L	C	D	F	L	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	G	G	L	L	P	E	M	A	E	K	M	G	L	N	P	G	I	A	V	A	V	G	N	V	D	A	H	A	A	V	P	A	V	G	V	T	T	P	G	K	L	V	M	A	M	G	T	S	I	C	H	M	L	L	G	E	K	E	Q	E	V	E	G	M	C	G	V	V	E	D	G	I	I	P	G	Y	L	G
Template Known Secondary structure															T	S		T	T									T	T	T	T					T	T			S	S								S	S	S								S	S					T	T		S					T	S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140														.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.												.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	K	C	A	A	G	T	G	R	F	L	E	V	I	S	R	T	L	G	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	Q	L	D	S	I	T	E	N	V	T	P	H	A	I	T	S	M	C	T	V	F	A	E	S	E	A	I	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	A
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	A	G	Q	S	A	V	G	D	I	F	A	W	F	V	K	H	G	V	S	A	A	T	F	D	E	A	Q	E	K	G	V	N	V	H	A	L	L	E	E	K	A	S	Q	L	R	P	G	E	S	G	L	L	A	L	D	W	W	N	G	N	R	S	I	L	V	D	T	E	L	S	G	M	L	L	G	Y	T	L
Template Known Secondary structure							S		S											T	S											T	T												T	S	S		T	T	S	S								T	T				T	T	T			S	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.					.	.	.	.	.	.	210	.		.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.									.
Query SS confidence																															.	.	.	.									.
Query Sequence		G	V	A	P	E	A	I	L	A	G	V	I	N	A	M	A	R	R	S	A	N	F	I	A	R	L	S	C	E	.	.	.	.	A	P	I	L	F	T	G	G	.	V	S	H	C	Q	K	F	A	R	M	L	E	S	H	L	R	M	P	V	N	T	H	P	D	A	Q	F	A	G	A	I	G	A	A	V	I	G
Query Conservation																															.	.	.	.									.
Alig confidence																															.	.	.	.									.																											.
Template Conservation																																																																						.
Template Sequence		Q	T	K	P	E	E	I	Y	R	A	L	L	E	A	T	A	F	G	T	R	A	I	V	D	A	F	H	G	R	G	V	E	V	H	E	L	Y	A	C	G	G	L	P	Q	K	N	H	L	L	M	Q	I	F	A	D	V	T	N	R	E	I	K	V	A	A	S	K	Q	.	T	P	A	L	G	A	A	M	F	A
Template Known Secondary structure		T																											T	T	T										S	S																	T	S					B			S	S	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.		.	.	.	.	480	.	.	.	.	.