Job Description P64426 Confidence 27.06% Date Thu Jan 5 12:08:13 GMT 2012 Rank 391 Aligned Residues 205 % Identity 16% Template d1qvba_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Family 1 of glycosyl hydrolase Resolution 2.40

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		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130																																.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	M	I	D	K	L	D	H	L	Q	R	L	G	I	N	T	V	F	F	Q	V	K	P	D	G	T	A	L	W	P	S	K	I	L	P	W	S	D	L	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	I	G	E	N	P
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	N	Q	N	D	H	D	L	A	E	K	L	G	V	N	T	I	R	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	W	S	R	I	F	P	K	P	T	F	N	V	K	V	P	V	E	R	D	E	N	G	S	I	V	H	V	D	V	D	D	K	A	V	E	R	L	D	E	L	A	N	K	E
Template Known Secondary structure														T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S			T	T	S								T	T	S																			S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80														.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.												.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	D	P	L	Q	F	M	L	D	E	A	H	K	R	G	M	K	V	H	A	W	F	N	P	Y	R	V	S	V	N	T	K	P	G	T	I	R	E	L	N	S	T	L	S	Q	Q	P	A	S	V	Y	V	Q	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	W	I	R	T	S	G	D	R	F	V	L	D
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	N	H	Y	V	E	M	Y	K	D	W	V	E	R	G	R	K	L	I	L	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	W	P	L	P	L	W	L	H	N	P	I	M	V	R	R	M	G	P	D	R	A	P	S	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	T	T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S			B	T	T	T	B										G	G	G	S		B	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.		.	.	.	.	250	.	.	.					.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.									.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																																									.									.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		P	G	I	P	E	V	Q	D	W	I	T	S	I	V	A	E	V	V	S	R	Y	P	V	D	G	V	Q	F	D	D	Y	F	Y	T	E	S	P	G	S	.	R	L	N	D	N	E	T	Y	.	.	.	.	R	K	Y	G	G	A	F	A	S	K	A	D	W	R	R	N	N	T	Q	Q	L	I	.	.	A	K	V	S
Query Conservation																																									.									.	.	.	.																							.	.
Alig confidence		.																						.	.	.	.	.	.												.									.	.	.	.																							.	.
Template Conservation		.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	L	N	E	E	S	V	V	E	F	A	K	Y	A	A	Y	I	A	W	K	M	G	.	.	.	.	.	.	E	L	P	V	M	W	S	T	M	N	E	P	N	V	V	Y	E	Q	G	Y	M	F	V	K	G	G	F	P	P	G	Y	L	S	L	E	A	A	D	K	A	R	R	N	M	I	Q	A	H	A	R	A	Y
Template Known Secondary structure		.	G	S	T																		T	.	.	.	.	.	.	T	S		S																	T		G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure		.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.							.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.												.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	T	I	K	S	I	K	P	G	V	E	F	G	V	S	P	A	G	V	W	R	N	R	S	H	D	P	L	G	S	D	T	R	G	A	A	A	Y	D	E	S	Y	A	D	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	W	V	E	Q	G	L	L	D	Y	I	A	P	Q	I	Y	W	P	F
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.
Template Sequence		D	N	I	K	R	F	S	K	K	.	P	V	G	L	I	Y	A	F	Q	W	F	E	L	L	E	G	P	A	E	V	F	D	K	F	K	S	S	K	L	Y	Y	F	T	D	I	V	S	K	G	S	S	I	I	N	V	E	Y	R	R	D	L	A	N	R	L	D	W	L	G	V	N	Y	Y	S	R	L
Template Known Secondary structure										S	.														S	S	S			S										T	S	T	T	T	T					S			S	S						T	T	T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure											.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.		.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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