Job Description P64426 Confidence 98.72% Date Thu Jan 5 12:08:13 GMT 2012 Rank 119 Aligned Residues 213 % Identity 18% Template c3n12A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:chitinase a; PDBTitle: crystal stricture of chitinase in complex with zinc atoms from2 bacillus cereus nctu2 Resolution 1.20 Å

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	F	M	L	D	E	A	H	K	R	G	M	K	V	H	A	W	F	N	P	Y	R	V	S	V	N	T	K	P	G	T	I	R	E	L	N	S	T	L	S	Q	Q	P	A	S	V	Y	V	Q	H	R	D	W	I	R	T	S	G	D	R	F	V	L	D	P	G	I	P	E	V	Q	D	W	I	T	S	I	V	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	S	D	I	S	Y	L	K	S	K	G	K	K	V	V	L	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	Q	N	G	V	V	L	L	P	D	N	A	A	K	D	R	F	I	N	S	I	Q
Template Known Secondary structure												T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T							S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	V	S	R	Y	P	V	D	G	V	Q	F	D	D	Y	F	Y	T	E	S	P	G	S	R	L	N	D	N	E	T	Y	R	K	Y	G	G	A	F	A	S	K	A	D	W	R	R	N	N	T	Q	Q	L	I	A	K	V	S	H	T	I	K	S	I	K	P	G	V	E	F	G	V	S	P	A	G	V	W	R	N
Query Conservation
Alig confidence																	.											.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation																	.											.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	I	D	K	Y	G	F	D	G	I	D	I	D	L	.	E	S	G	I	Y	L	N	G	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	F	K	N	P	T	T	P	Q	.	.	.	.	.	I	V	N	L	I	S	A	I	R	T	I	S	D	H	Y	G	P	D	F	L	L	S	M	A	P	E	T	A	Y	V	Q
Template Known Secondary structure										S							.		T	T			B		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S						.	.	.	.	.																	T	T								B	G	G	G	T	G
Template Predicted Secondary structure																	.											.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.									.	.	.	.	.	160	.	.	.	.						.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.									.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	H	D	P	L	G	S	D	T	R	G	A	A	A	Y	D	E	S	Y	A	D	T	R	R	W	V	E	Q	G	L	L	D	Y	I	A	P	Q	I	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	F	S	R	S	A	A	R	Y	D	V	L	A	K	W	W	A	D	V	V	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	Y	S	A	Y	G	S	I	W	G	A	Y	L	P	I	I	Y	G	V	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	T	Y	I	H	V	Q	H	Y	N	A	G	S	G	I	G	M	D	G	N	N	Y	N	Q	G	T	A	D	Y	E	V	A	M	A	D	M	L	L	H	G	F	P	V	G	G	N	A	N	N
Template Known Secondary structure		G	G	G	T			B	B	T	B	T	T	T							T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T									S	S							T	T	S					T	T	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.									.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
							365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.																.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	T	R	T	R	L	Y	I	G	I	A	F	Y	K	V	G	E	P	S	K	I	E	P	D	W	M	I	N	G	G	V	P	E	L	K	K	Q	L	D	L	N	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	E	I	S	G	T	I	L	F	R	E	D	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	F	P	A	L	R	S	D	Q	V	M	I	G	L	P	A	A	P	A	A	A	P	S	G	G	.	.	.	.	.	.	Y	I	S	P	T	E	M	K	K	A	L	N	Y	I	I	K	G	V	P	F	G	G	K	Y	K	L	S	N	Q	S	G	Y	P	A	F	R	G	L	M	S	W	S	I	N	W
Template Known Secondary structure								G	G	G							S	S	G	G	G	S	T	T	S		.	.	.	.	.	.																					S		S				S	S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.							.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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