Job Description P64426 Confidence 97.54% Date Thu Jan 5 12:08:13 GMT 2012 Rank 209 Aligned Residues 184 % Identity 18% Template c3aquD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:at4g19810; PDBTitle: crystal structure of a class v chitinase from arabidopsis thaliana Resolution 2.01 Å

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		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		G	I	P	E	V	Q	D	W	I	T	S	I	V	A	E	V	V	S	R	Y	P	V	D	G	V	Q	F	D	D	Y	F	Y	T	E	S	P	G	S	R	L	N	D	N	E	T	Y	R	K	Y	G	G	A	F	A	S	K	A	D	W	R	R	N	N	T	Q	Q	L	I	A	K	V	S	H	T	I	K	S	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																															.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																		.	.	.
Template Conservation																															.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Sequence		S	N	P	T	S	R	K	S	F	I	D	S	S	I	R	V	A	R	S	Y	G	F	H	G	L	D	L	D	W	.	E	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	A	T	E	.	.	M	T	N	F	G	T	L	L	R	E	W	R	S	A	V	V	A	E	A	S
Template Known Secondary structure		T	S																		T	T		S							.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S				.	.
Template Predicted Secondary structure																															.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.		.	.	.																					.	120	.	.	.			.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
				285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	I	K	P	G	V	E	F	G	V	S	P	A	G	V	W	R	N	R	S	H	D	P	L	G	S	D	T	R	G	A	A	A	Y	D	E	S	Y	A	D	T	R	R	W	V	E	Q	G	L	L	D	Y	I	A	P	Q	I	Y	W	P	F	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.														.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	G	K	P	R	L	L	L	A	A	A	V	F	Y	.	.	.	S	N	N	Y	Y	S	V	L	Y	P	V	S	A	V	A	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	W	V	N	L	M	A	Y	D	F	Y	G	P	G	W	S	R	V	T	G	P	P	A	A	L	F	D	P	S
Template Known Secondary structure		T	T	T	S											S	.	.	.	S	S			T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S												T	T	T		S	B				T	T		S			T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.				.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.																.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
			347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	S	A	A	R	Y	D	V	L	A	K	W	W	A	D	V	V	K	P	T	R	T	R	L	Y	I	G	I	A	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	G	E	P	S	K	I	E	P
Query Conservation		.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		N	A	G	P	S	G	D	A	G	T	R	S	W	I	Q	A	.	G	L	P	A	K	K	A	V	L	G	F	P	Y	Y	G	Y	A	W	R	L	T	N	A	N	S	H	S	Y	Y	A	P	T	T	G	A	A	I	S	P	D	G	S	I	G	Y	G	Q	I	R	K	F	I	V	D	N	G	A	T	T	V	Y	N	S
Template Known Secondary structure		S	S	S													T	.	T			G	G	G							S								S		T	T			S	T	T		B						S	S	T	T																T							T
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		387	.	.	390												.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	W	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	G	V	P	E	L	K	K	Q	L	D	L	N	D	A	V	P	E	I	S	G	T	I	L	F	R	E	D	Y	L	N	K	P	Q	T	Q	Q	A	V	S	Y	L	Q	S	R	W
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.												.	.		.
Template Conservation																																			.												.	.		.
Template Sequence		T	V	V	G	D	Y	C	Y	A	G	T	N	W	I	G	Y	D	D	N	Q	S	I	V	T	K	V	R	Y	A	K	Q	R	G	.	L	L	G	Y	F	S	W	H	V	G	A	.	.	D	.	D	N	S	G	L	S	R	A	A	S	Q	A	W
Template Known Secondary structure		T	T	T							T	T																					T	T	.									G	G	G	.	.	S	.	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.												.	.		.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.		.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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