Job Description P64426 Confidence 98.08% Date Thu Jan 5 12:08:13 GMT 2012 Rank 169 Aligned Residues 187 % Identity 14% Template c1ll4A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:chitinase 1; PDBTitle: structure of c. immitis chitinase 1 complexed with2 allosamidin Resolution 2.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		G	I	P	E	V	Q	D	W	I	T	S	I	V	A	E	V	V	S	R	Y	P	V	D	G	V	Q	F	D	D	Y	F	Y	T	E	S	P	G	S	R	L	N	D	N	E	T	Y	R	K	Y	G	G	A	F	A	S	K	A	D	W	R	R	N	N	T	Q	Q	L	I	A	K	V	S	H	T	I	K	S	I	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	T	E	E	G	R	K	K	F	A	D	T	S	L	K	L	M	K	D	L	G	F	D	G	I	D	I	D	W	.	E	Y	P	E	D	E	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	D	F	V	L	L	L	K	A	C	R	E	A	L	D	A	Y	S	A
Template Known Secondary structure		T	S																			T		S							.	S				S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.																							.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
						286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	K	P	G	V	E	F	G	V	S	P	A	G	V	W	R	N	R	S	H	D	P	L	G	S	D	T	R	G	A	A	A	Y	D	E	S	Y	A	D	T	R	R	W	V	E	Q	G	L	L	D	Y	I	A	P	Q	I	Y	W	P	F	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																						.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	H	P	N	G	K	K	F	L	L	T	I	A	S	P	A	G	P	Q	N	Y	N	K	L	K	.	.	.	.	L	A	E	M	D	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	F	W	N	L	M	A	Y	D	F	S	G	S	W	D	K	V	S	G	H	M	S	N	V	F	P	S	T
Template Known Secondary structure		T		T	T	S												S					T	T	S		.	.	.	.						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S									S	S	S	T	T		S	B				S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.					.	.	.	.	.	.	230																.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
							347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	S	A	A	R	Y	D	V	L	A	K	W	W	A	D	V	V	K	P	T	R	T	R	L	Y	I	G	I	A	F	Y	K	V	G	E	P	S	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.
Template Sequence		T	K	P	E	S	T	P	F	S	S	D	K	A	V	K	D	Y	I	K	A	.	G	V	P	A	N	K	I	V	L	G	M	P	L	Y	G	R	A	F	A	S	T	D	G	I	G	T	S	F	N	G	V	G	G	G	S	W	E	N	G	V	W	D	Y	K	D	M	P	Q	Q	G	A	Q	V	T	E	L	E	D	I
Template Known Secondary structure		S		G	G	G		S														.	T			G	G	G							S						S	S		S	S	T	T	S	B		S						S	S	B	T	T				G	G	G		S		T	T							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
											385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	D	W	M	I	N	G	G	V	P	E	L	K	K	Q	L	D	L	N	D	A	V	P	E	I	S	G	T	I	L	F	R	E	D	Y	L	N	K	P	Q	T	Q	Q	A	V	S	Y	L	Q	S	R	W	G	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.											.
Template Conservation																																			.											.
Template Sequence		A	A	S	Y	S	Y	D	K	N	K	R	Y	L	I	S	Y	D	T	V	K	I	A	G	K	K	A	E	Y	I	T	K	N	G	.	M	G	G	G	M	W	W	E	S	S	.	S	D	K	T	G	N	E	S	L	V	G	T	V	V	N	G	L	G	G
Template Known Secondary structure		T							T	T	T	T																					T	T	.									T	T	.	S				G	G	G										T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																			.											.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.		.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions