Job Description P32171 Confidence 97.95% Date Thu Jan 5 11:49:51 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 275 % Identity 13% Template c3en9B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:o-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase; PDBTitle: structure of the methanococcus jannaschii kae1-bud32 fusion2 protein Resolution 2.67 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	C	V	A	V	D	L	G	A	S	S	G	R	V	M	L	A	R	Y	E	R	E	C	R	S	L	T	L	R	E	I	H	R	F	N	N	G	L	H	S	Q	N	G	Y	V	T	W	D	V	D	S	L	E	S	A	I	R	L	G	L	N	K	V	C	E	E	G	I	R	I	D	S	I	G	I	D	T	W	G	V
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.
Template Sequence		I	C	L	G	L	E	G	T	A	E	K	T	G	V	G	I	V	T	S	D	G	E	V	L	F	N	K	T	I	M	Y	K	.	.	.	.	P	G	I	N	P	R	E	A	A	D	H	H	A	E	T	F	P	K	L	I	K	E	A	F	E	V	.	.	V	D	K	N	E	I	D	L	I	A	F	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	S	S									T	T	S												.	.	.	.																									T	T	.	.	S		G	G	G								.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.																											.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.					.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.			60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	V	L	L	D	Q	Q	G	Q	R	V	G	L	P	V	A	Y	R	D	S	R	T	N	G	L	M	A	Q	A	Q	Q	Q	L	G	K	R	D	I	Y	Q	R	S	G	I	Q	F	L	P	F	N	T	L	Y	Q	L	R	A	L	T	E	Q	Q	P	E	L	I	P	H	I	A	H	A	L	L	M	P	D	Y	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	P	G	L	G	P	S	L	R	V	T	A	T	V	A	R	T	L	S	L	T	L	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S																			T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.			.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		S	Y	R	L	T	G	K	M	N	W	E	Y	T	N	A	T	T	T	Q	L	V	N	I	N	S	D	D	W	D	E	S	L	L	A	W	S	G	A	N	K	A	W	F	G	R	P	T	H	P	G	N	V	I	G	H	W	I	C	P	Q	G	N	E	I	P	V	V	A	V	A	S	H	D	.	.	T	A	S	A	V
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	I	G	V	N	H	C	I	A	H	I	E	I	G	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.			.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Query SS confidence																																																																							.	.
Query Sequence		I	A	S	P	L	N	G	S	R	A	A	Y	L	S	S	G	T	W	S	L	M	G	F	E	S	Q	T	P	F	T	N	D	T	A	L	A	A	N	I	T	N	E	G	G	A	E	G	R	Y	R	V	L	K	N	I	M	G	L	W	L	L	Q	R	V	L	Q	E	Q	Q	.	.	I	N	D	L	P	A	L	I	S
Query Conservation																																																																							.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	T	E	A	E	D	P	L	T	L	Y	V	S	G	G	N	T	Q	V	I	A	Y	V	S	K	K	Y	R	V	F	G	E	T	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	V	G	N	C	L	D	Q	F	A	R	Y	V	N	L	P	H	P	G	G	P	Y	I	E	E
Template Known Secondary structure			S	S	S		S	S							S	S	S									T	T								B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S													T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360									.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	Q	A	L	P	A	C	R	F	I	I	N	P	N	D	D	R	F	I	N	P	E	T	M	C	S	E	I	Q	A	A	C	R	E	T	A	Q	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	S	D	A	E	L	A	R	C	I	F	D	S	L	A	L	L	Y	A	D	V	L	H	E	L	A	Q	L	R	G	E
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.
Template Sequence		L	A	R	K	G	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	D	L	P	Y	T	V	K	G	M	D	I	A	F	S	G	L	L	T	A	A	M	R	A	Y	D	A	G	E	R	L	E	D	I	C	Y	S	L	Q	E	Y	A	F	S	M	L	T	E	I	T	E	R	A	L	A	H	T	N	.
Template Known Secondary structure					T			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T																	T	T																														T	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.														.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.				.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.
Query Sequence		D	F	S	Q	L	H	I	V	G	G	G	C	Q	N	T	L	L	N	Q	L	C	A	D	A	C	.	.	.	G	I	R	V	I	A	G	P	V	E	A	S	T	L	G	N	I	G	I	Q	L	M	T	L
Query Conservation																											.	.	.
Alig confidence		.																									.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	K	G	E	V	M	L	V	G	G	V	A	A	N	N	R	L	R	E	M	L	K	A	M	C	E	G	Q	N	V	D	F	Y	V	P	P	K	E	F	C	G	D	N	G	A	M	I	A	W	L	G	L
Template Known Secondary structure		.		S						S	G	G	G	G														T	T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.