Job Description P37355 Confidence 98.73% Date Thu Jan 5 11:55:32 GMT 2012 Rank 218 Aligned Residues 248 % Identity 15% Template d1wpxa1 SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.70

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.				.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Query Sequence		H	A	Q	A	K	H	G	K	P	G	L	P	W	L	V	F	L	H	G	F	S	G	D	C	H	E	W	Q	E	V	G	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	D	Y	S	R	L	Y	V	D	L	P	.	.	.	G	H	G	G	S	A	A	I	S	V	D	G	F	D
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	E	S	R	N	D	P	A	K	D	P	V	I	L	W	L	N	G	G	P	G	C	S	S	L	T	G	L	F	F	E	L	G	P	S	S	I	G	P	D	L	K	P	I	G	N	P	Y	S	W	N	S	N	A	T	V	I	F	L	D	Q	P	V	N	V	G	F	S	Y	S	G	S	S	G	V	S	N	T	V
Template Known Secondary structure						S	S		T	T	T	S									T	T	T	B		T							T	T	S	S					T	T	S						T	T		G	G	G	S	S								S	T	T	S	T	T		B		S	S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.										.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.							100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	T	D	L	L	R	K	T	L	V	S	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	D	F	W	L	V	G	Y	S	L	G	G	R	V	A	M	M	A	A	C	Q	G	.	.	.	.	.	.	L	A	G	L	C	G	V	I	V	E	G	G	H	P	G	L	Q	N	A	E	Q	R	A	E	R	Q	R	S
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	G	K	D	V	Y	N	F	L	E	L	F	F	D	Q	F	P	E	Y	V	N	K	G	Q	D	F	H	I	A	G	E	S	Y	A	G	H	Y	I	P	V	F	A	S	E	I	L	S	H	K	D	R	N	F	N	L	T	S	V	L	I	G	N	G	L	T	D	P	L	T	Q	Y	N	Y	Y	E	P	M	A	C
Template Known Secondary structure																			T					T										T	T																S	S		S	S									S									G	G	G						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	R	Q	W	V	Q	R	F	L	T	E	P	L	T	A	V	F	A	D	W	Y	Q	Q	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	G	G	E	P	S	V	L	P	S	E	E	C	S	A	M	E	D	S	L	E	R	C	L	G	L	I	E	S	C	Y	D	S	Q	S	V	W	S	C	V	P	A	T	I	Y	C	N	N	A	Q	L	A	P	Y	Q	R	T	G	R	N	V	Y	D	I	R	K	D	C	E	G	G	N	L	C	Y	P	T	L	Q
Template Known Secondary structure		T		S	S	S				S																																											T						T	T	B		S	S		T	T	S	B			S	S	T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
					153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.					.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure		.	.	.																																.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	F	A	S	L	N	D	D	Q	R	R	E	L	V	A	L	R	S	N	N	N	G	A	T	L	A	A	M	L	E	A	T	.	.	.	.	S	L	A	V	Q	P	D	L	R	A	N	L	S	A	R	T	F	A	F	Y	Y	L	C	G	E	R	D	S	K	F	R	A	L	A	A	E	L	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																																.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	I	D	D	Y	L	N	Q	D	Y	V	K	E	A	V	G	A	E	V	D	H	Y	E	S	C	N	F	D	I	N	R	N	F	L	F	A	G	D	W	M	K	P	Y	H	T	A	V	T	D	L	L	N	Q	D	L	P	I	L	V	Y	A	G	D	K	D	F	I	C	N	W	L	G	N	K	A	W	T	D	V	L
Template Known Secondary structure								T	S								T			S	S	S			S	B										T	T	T		T	T			T	T									T	T									T	T		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
																																		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	C	H	V	I	P	R	A	G	H	N	A	H	R	E	N	P	A	G	V	I	A	S	L	A	Q	I	L	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	W	K	Y	D	E	E	F	A	S	Q	K	V	R	N	W	T	A	S	I	T	D	E	V	A	G	E	V	K	S	Y	K	H	F	T	Y	L	R	V	F	N	G	G	H	M	V	P	F	D	V	P	E	N	A	L	S	M	V	N	E	W	I	H
Template Known Secondary structure			S	T	T							S								T	T	T		S									T	T							T	T			S	S																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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