Job Description P24228 Confidence 99.91% Date Thu Jan 5 11:41:22 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 254 % Identity 21% Template d2cc1a1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 2.13

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		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.			.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		A	N	V	D	E	Y	I	T	Q	L	P	A	.	.	G	A	N	L	A	L	M	V	Q	K	V	G	A	S	A	P	A	I	D	Y	H	S	Q	Q	M	A	L	P	A	S	T	Q	K	V	I	T	A	L	A	A	L	I	Q	L	G	P	D	F	R	F	T	T	T	L	E	T	K	G	N	V	E	N	G	V	L	K
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.																		.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		A	P	I	D	D	Q	L	A	E	L	E	R	R	D	N	V	L	I	G	L	Y	A	A	N	L	Q	S	G	R	R	I	.	T	H	R	P	D	E	M	F	A	M	C	S	T	F	K	G	Y	V	A	A	R	V	L	Q	M	A	E	H	G	E	I	S	L	D	N	R	V	F	V	D	A	D	A	L	V	P	N	S
Template Known Secondary structure																T										T	T	T					.			S	T	T	S					G	G	G															T	T	S	S		T	T							G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.		.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	L	V	A	R	F	G	A	D	P	T	L	K	R	Q	D	I	R	N	M	V	A	T	L	K	K	S	G	V	N	Q	I	D	G	N	V	L	I	D	T	S	I	F	A	S	H	D	K	A	P	G	W	P	W	N	D	M	T	Q	C	F	S	A	P	P	A	A	A	I	V	D	R	N	C	F	S	V	S	L
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	T	E	A	R	A	G	A	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	A	P	K	P	G	D	M	A	F	I	R	V	A	S	Y	Y	P	V	T	M	F	S	Q	V	R	T	L	P	R	G	S	A	E	A	Q	Y	C	E	L	D	V	V	P	G	D	L	N	R	F	T	L	T	G	C	L	P	Q	R	S	E	P	L	P	L	A	F	A	V	Q	D	G	A	S	Y	A	G	A	I
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	D	E	L	K	Q	A	G	I	T	W	S	G	T	L	L	R	Q	T	Q	V	N	E	P	G	T	V	V	A	S	K	Q	S	A	P	L	H	D	L	L	K	I	M	L	K	K	S	D	N	M	I	A	D	T	V	F	R	M	I	G	H	A	R	F	N	V	P	G	T	W	R	A	G	S	D	A	V	R	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	A	E	L	C	Q	A	A	L	Q	R	S	D	N	T	A	A	N	L	L	L	K	T	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	A	A	V	T	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S														T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.													.	.	.	.	.	.	150
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.						.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	R	Q	Q	A	G	V	D	I	G	N	T	.	.	.	.	.	I	I	A	D	G	S	G	L	S	R	H	N	L	I	A	P	A	T	M	M	Q	V	L	Q	Y	I	A	Q	H	D	N	E	L	N	F	I	S	M	L	P	L	A	G	Y	D	G	S	L	Q	Y	R	A	G	L	H	Q	A	G	V	D	G	K
Query Conservation															.	.	.	.	.
Alig confidence						.									.	.	.	.	.																																																					.
Template Conservation						.																																																																		.
Template Sequence		F	A	R	S	.	V	G	D	E	R	T	R	L	D	R	W	E	V	E	L	N	S	A	I	P	G	D	P	R	D	T	S	T	P	A	A	L	A	V	G	Y	R	A	I	L	A	G	D	A	L	S	P	P	Q	R	G	L	L	E	D	W	M	R	A	N	Q	T	S	S	M	.	R	A	G	L	P	E	G	W	T
Template Known Secondary structure						.	T	T			S					S		T	T	G	G	G	G			T	T			T	T																	S	S	S	S														T		S			S	G	.	G	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure						.																																																																		.
Template SS confidence
		151	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		V	S	A	K	T	G	S	L	.	Q	G	V	Y	N	L	A	G	F	I	T	T	A	S	G	Q	R	M	A	F	V	Q	Y	L	S	G	Y	A	V	E	P	A	D	Q	R	N	R	R	I	P	L	V	R	F	E	S	R	L	Y	K	D	I	Y
Query Conservation										.
Alig confidence										.																											.
Template Conservation																																					.
Template Sequence		T	A	D	K	T	G	S	G	D	Y	G	S	T	N	D	A	G	I	A	F	G	P	D	G	Q	R	L	L	L	V	M	M	T	R	S	.	Q	A	H	D	P	K	A	E	N	L	R	P	L	I	G	E	L	T	A	L	V	L	P	S	L	L
Template Known Secondary structure										S	T	T											T	T	S												.	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.