Job Description P24228 Confidence 98.82% Date Thu Jan 5 11:41:22 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 247 % Identity 21% Template d1vqqa3 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 1.80

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	D	E	Y	I	T	Q	L	P	A	G	A	N	L	A	L	M	V	Q	K	V	G	A	S	A	P	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	H	S	Q	Q	M	A	L	P	A	S	T	Q	K	V	I	T	A
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	Q	K	S	I	Y	N	N	M	K	N	D	Y	G	S	G	T	A	I	H	P	Q	T	G	E	L	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	V	Y	P	F	M	Y	G	M	S	N	E	E	Y	N	K	L	T	E	D	K	K	E	P	L	L	N	K	F	Q	I	T	T	S	P	G	S	T	Q	K	I	L	T	A
Template Known Secondary structure												T	T	S	S								T	T	T	T									S				S																	T		T	T		T	T	S		T	T	T	S		B			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.
Query SS confidence							.	.
Query Sequence		L	A	A	L	I	.	.	Q	L	G	P	D	F	R	F	T	T	T	L	E	T	K	G	N	V	E	N	G	V	L	K	G	D	L	V	A	R	F	G	A	D	P	T	L	K	R	Q	D	I	R	N	M	V	A	T	L	K	K	S	G	V	N	Q	I	D	G	N	V	L	I	D	T	S	I	F	A	S	H	D	K
Query Conservation							.	.
Alig confidence							.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	I	G	L	N	N	K	T	L	D	D	K	T	S	Y	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	K	G	W	Q	K	D	K	S
Template Known Secondary structure							T	T	S	S		T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S				S	S	G	G
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	G	W	P	W	N	D	M	T	Q	C	F	S	A	P	P	A	A	A	I	V	D	R	N	C	F	S	V	S	L	Y	S	A	P	K	P	G	D	M	A	F	I	R	V	A	S	Y	Y	P	V	T	M	F	S	Q	V	R	T	L	P	R	G	S	A	E	A	Q	Y	C	E	L	D	V	V	P	G	D	L	N
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	G	G	Y	N	V	T	R	Y	E	V	V	N	G	N	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	T	T						S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	T	L	T	G	C	L	P	Q	R	S	E	P	L	P	L	A	F	A	V	Q	D	G	A	S	Y	A	G	A	I	L	K	D	E	L	K	Q	A	G	I	T	W	S	G	T	L	L	R	Q	T	Q	V	N	E	P	G	T	V	V	A	S	K	Q	S	A	P	L	H	D	L	L	K	I	M	L	K	K	S	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	Q	A	I	E	S	S	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																									455	.	.	.	.	460	.	.	.
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.																				.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	M	I	A	D	T	V	F	R	M	I	G	H	A	R	F	N	V	P	G	T	W	R	A	G	S	D	A	V	R	Q	I	L	R	Q	Q	A	G	V	D	I	G	N	T	I	I	A	D	G	S	G	L	S	R	H	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	P	A
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		N	I	F	F	A	R	V	A	L	E	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	K	F	E	K	G	M	K	K	.	L	G	V	G	E	D	I	P	S	D	Y	P	F	Y	N	A	Q	I	S	N	K	N	L	D	N	E	I	L	L	A	D	S	G	Y	G	Q	G	E	I	L	I	N	P	V
Template Known Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	T	T	T	T	S					S	S						B	S		S	S				S									T	T		S	S		B	B
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.														.	.	.	.	480	.	.	.	.	.		.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420					.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Query Sequence		T	M	M	Q	V	L	Q	Y	I	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	N	E	L	N	F	I	S	M	L	P	L	A	G	Y	D	G	S	L	Q	Y	R	A	G	L	H	Q	A	G	V	D	G	K	V	S	A	K	T	G	S	.	.	.	.	L	Q	G	V	Y
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	L	S	I	Y	S	A	L	E	N	N	G	N	I	N	A	P	H	L	L	K	D	T	K	N	K	V	W	K	K	N	I	I	S	K	E	N	I	N	L	L	T	D	G	M	Q	Q	V	V	N	K	T	H	K	E	D	I	Y	R	S	Y	A	N	L	I	G	K	S	G	T	A	E	L	K	G	R	Q	I	G
Template Known Secondary structure									G	G	G	T	T	T						B			T	T	S										S																		T	T	T	T	T	T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	A	G	F	I	T	T	A	S	G	Q	R	M	A	F	V	Q	Y	L	S	G	Y	A	V	E	P	A	D	Q	R	N	R	R	I	P	L	V	R	F	E	S	R	L	Y	K	D	I	Y	Q	N
Query Conservation
Alig confidence							.	.																													.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.																													.	.	.	.	.
Template Sequence		W	F	I	S	Y	.	.	D	K	D	N	P	N	M	M	M	A	I	N	V	K	D	V	Q	D	K	G	M	A	S	Y	N	A	K	I	.	.	.	.	.	S	G	K	V	Y	D	E	L	Y	E	N
Template Known Secondary structure							.	.		T	T	S		S											T	T	T	T	T								.	.	.	.	.									T	G	G
Template Predicted Secondary structure							.	.																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		616	.	.	.	620			.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.						.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.