Job Description P24228 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:41:22 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 250 % Identity 16% Template c2v20A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-lactamase tem; PDBTitle: structure of a tem-1 beta-lactamase insertant2 allosterically regulated by kanamycin and anions. complex3 with sulfate. Resolution 1.67 Å

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	Y	I	T	Q	L	P	A	G	A	N	L	A	L	M	V	Q	K	V	G	A	S	A	P	A	I	D	Y	H	S	Q	Q	M	A	L	P	A	S	T	Q	K	V	I	T	A	L	A	A	L	I	Q	L	G	P	D	F	R	F	T	T	T	L	E	T	K	G	N	V	E	N	G	V	L	K	G	D	L	V	A
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	L	C	R	T	S	H	R	P	C	R	V	G	Y	I	E	L	D	L	N	S	G	K	I	L	E	S	F	R	P	E	E	R	F	P	M	M	S	T	F	K	V	L	L	C	G	A	V	L	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T			S											T	T	T								S	T	T	S					G	G	G													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	G	A	D	P	T	L	K	R	Q	D	I	R	N	M	V	A	T	L	K	K	S	G	V	N	Q	I	D	G	N	V	L	I	D	T	S	I	F	A	S	H	D	K	A	P	G	W	P	W	N	D	M	T	Q	C	F	S	A	P	P	A	A	A	I	V	D	R	N	C	F	S	V	S	L	Y	S	A	P	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	A	G	Q	E	Q	L	G	R	R	I	H	Y	S	Q	N	D	L	V	K	Y	S	P	V	T	E	K	H	L	T	D	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S			T	T							G	G	G			S	S		T	T	G	G	G		T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	D	M	A	F	I	R	V	A	S	Y	Y	P	V	T	M	F	S	Q	V	R	T	L	P	R	G	S	A	E	A	Q	Y	C	E	L	D	V	V	P	G	D	L	N	R	F	T	L	T	G	C	L	P	Q	R	S	E	P	L	P	L	A	F	A	V	Q	D	G	A	S	Y	A	G	A	I	L	K	D	E	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Q	A	G	I	T	W	S	G	T	L	L	R	Q	T	Q	V	N	E	P	G	T	V	V	A	S	K	Q	S	A	P	L	H	D	L	L	K	I	M	L	K	K	S	D	N	M	I	A	D	T	V	F	R	M	I	G	H	A	R	F	N	V	P	G	T	W	R	A	G	S	D	A	V	R	Q	I	L	R	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	R	E	L	C	S	A	A	I	T	M	S	D	N	T	A	A	N	L	L	L	T	T	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	K	E	L	T	A	F	L	H	N	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S														T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S											.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template SS confidence
																																98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.													.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.						.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.		.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																																														.
Query SS confidence										.	.	.	.	.																																														.
Query Sequence		A	G	V	D	I	G	N	T	.	.	.	.	.	I	I	A	D	G	S	G	L	S	R	H	N	L	I	A	P	A	T	M	M	Q	V	L	Q	Y	I	A	Q	H	D	N	E	L	N	F	I	S	M	L	P	L	A	G	Y	D	.	G	S	L	Q	Y	R	A	G	L	H	Q	A	G	V	D	G	K	V	S	A	K
Query Conservation										.	.	.	.	.																																														.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																														.
Template Conservation
Template Sequence		M	G	D	H	V	T	R	L	D	R	W	E	P	E	L	N	E	A	I	P	N	D	E	R	D	T	T	M	P	V	A	M	A	T	T	L	R	K	L	L	T	G	E	L	L	T	L	A	S	R	Q	Q	L	I	D	W	M	E	A	D	K	V	A	G	P	L	L	R	S	A	L	P	A	G	W	F	I	A	D	K
Template Known Secondary structure		T	T			S					S		T	T	G	G	G				T	T			T	T																	S	S	S	S														T			S		T	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		418	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		T	G	S	L	Q	.	G	V	Y	N	L	A	G	F	I	T	T	A	S	G	Q	R	M	A	F	V	Q	Y	L	S	G	Y	A	V	E	P	A	D	Q	R	N	R	R	I	P	L	V	R	F	E	S	R	L	Y	K	D	I
Query Conservation							.
Alig confidence							.																										.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		S	G	A	G	R	R	G	S	R	G	I	I	A	A	L	G	P	D	G	K	P	S	R	I	V	V	I	Y	T	T	G	.	.	.	S	R	K	K	T	D	E	R	N	R	Q	I	A	E	I	G	A	S	L	I	K	H	W
Template Known Secondary structure						S	T	T										S	T	T	S											S	.	.	.			S																			T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.				.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.