Job Description P24228 Confidence 99.88% Date Thu Jan 5 11:41:22 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 254 % Identity 17% Template c2qpnA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-lactamase ges-1; PDBTitle: ges-1 beta-lactamase Resolution 1.10 Å

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		N	V	D	E	Y	I	T	Q	L	P	A	G	.	.	A	N	L	A	L	M	V	Q	K	V	G	A	S	A	P	A	I	D	Y	H	S	Q	Q	M	A	L	P	A	S	T	Q	K	V	I	T	A	L	A	A	L	I	Q	L	G	P	D	F	R	F	T	T	T	L	E	T	K	G	N	V	E	N	G	V	L	K	G
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.														.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	K	T	D	L	E	K	L	E	R	E	K	A	A	Q	I	G	V	A	I	V	D	P	Q	G	E	.	I	V	A	G	H	R	M	A	Q	R	F	A	M	C	S	T	F	K	F	P	L	A	A	L	V	F	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T										T	T			.						S	T	T	S					G	G	G	G												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	V	A	R	F	G	A	D	P	T	L	K	R	Q	D	I	R	N	M	V	A	T	L	K	K	S	G	V	N	Q	I	D	G	N	V	L	I	D	T	S	I	F	A	S	H	D	K	A	P	G	W	P	W	N	D	M	T	Q	C	F	S	A	P	P	A	A	A	I	V	D	R	N	C	F	S	V	S	L	Y
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	P	K	P	G	D	M	A	F	I	R	V	A	S	Y	Y	P	V	T	M	F	S	Q	V	R	T	L	P	R	G	S	A	E	A	Q	Y	C	E	L	D	V	V	P	G	D	L	N	R	F	T	L	T	G	C	L	P	Q	R	S	E	P	L	P	L	A	F	A	V	Q	D	G	A	S	Y	A	G	A	I	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	S	G	T	E	R	G	D	R	K	L	S	Y	G	P	D	M	I	V	E	W	S	P	A	T	E	R	F	L	A	S	G	H	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	S	S		T	T							G	G	G			S	S								T	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	E	L	K	Q	A	G	I	T	W	S	G	T	L	L	R	Q	T	Q	V	N	E	P	G	T	V	V	A	S	K	Q	S	A	P	L	H	D	L	L	K	I	M	L	K	K	S	D	N	M	I	A	D	T	V	F	R	M	I	G	H	A	R	F	N	V	P	G	T	W	R	A	G	S	D	A	V	R	Q	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	L	E	A	A	Q	A	A	V	Q	L	S	D	N	G	A	T	N	L	L	L	R	E	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	A	A	M	T	Q	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.													.	140	.	.	.	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.						.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.																																																													.
Query SS confidence															.	.	.	.	.																																																													.
Query Sequence		L	R	Q	Q	A	G	V	D	I	G	N	T	I	.	.	.	.	.	I	A	D	G	S	G	L	S	R	H	N	L	I	A	P	A	T	M	M	Q	V	L	Q	Y	I	A	Q	H	D	N	E	L	N	F	I	S	M	L	P	L	A	G	Y	D	G	S	L	Q	Y	R	A	G	L	H	Q	A	G	V	D	G	.	K
Query Conservation															.	.	.	.	.																																																													.
Alig confidence					.										.	.	.	.	.																																																													.
Template Conservation					.
Template Sequence		F	R	K	.	I	G	D	S	V	S	R	L	D	R	K	E	P	E	M	G	D	N	T	P	G	D	L	R	D	T	T	T	P	I	A	M	A	R	T	V	A	K	V	L	Y	G	G	A	L	T	S	T	S	T	H	T	I	E	R	W	L	I	G	N	Q	T	G	D	A	T	L	R	A	G	F	P	K	D	W	V
Template Known Secondary structure					.	T	T		S	S							T	T	G	G	G				T	T			T	T																T	S	S	S	S														T		S	S		T	T	S	G	G	G	G	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		147	.	.		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		V	S	A	K	T	G	S	L	Q	G	.	V	Y	N	L	A	G	F	I	T	T	A	S	G	Q	R	M	A	F	V	Q	Y	L	S	G	Y	A	V	E	P	A	D	Q	R	N	R	R	I	P	L	V	R	F	E	S	R	L	Y	K	D	I	Y	Q	N
Query Conservation												.
Alig confidence												.														.																					.	.	.
Template Conservation																										.																					.	.	.
Template Sequence		V	G	E	K	T	G	T	C	A	N	G	G	R	N	D	I	G	F	F	K	A	Q	E	R	.	D	Y	A	V	A	V	Y	T	T	A	P	K	L	S	A	V	E	R	D	E	.	.	.	L	V	A	S	V	G	Q	V	I	T	Q	L	I	L	S	T
Template Known Secondary structure										T	T	T											T	T		.											T	T	S								.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.																					.	.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.				270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.