Job Description P52126 Confidence 99.89% Date Wed Jan 25 15:20:57 GMT 2012 Rank 77 Aligned Residues 324 % Identity 14% Template c2w00B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:hsdr; PDBTitle: crystal structure of the hsdr subunit of the ecor124i2 restriction enzyme in complex with atp Resolution 2.6 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.															.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.					.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Query Sequence		V	F	H	S	M	Q	F	H	I	F	D	L	L	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	N	V	V	L	S	A	P	T	S	M	G	K	S	A	I	V	D	S	L	L	G	M	.	.	.	.	G	T	L	K	R	L	V	L	V	V	P	T	V	A	L	A	D	E	T	R	R	R	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	X	R	P	Y	Q	I	A	A	T	E	R	I	L	W	K	I	K	S	S	F	T	A	K	N	W	S	K	P	E	S	G	G	Y	I	W	H	T	T	G	S	G	K	T	L	T	S	F	K	A	A	R	L	A	T	E	L	D	F	I	D	K	V	F	F	V	V	D	R	K	D	L	D	Y	Q	T	X	K	E	Y
Template Known Secondary structure																								T	T			S	S	G	G	G	S							T	T	S	S													T	T		T	T										G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.					180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.								.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	E	R	F	G	D	R	Y	Q	I	I	H	H	S	S	Q	V	C	.	.	.	.	H	S	D	Q	A	V	Y	V	L	T	Q	E	R	V	N	E	R	D	D	.	.	.	.	.	.	.	I	V	D	I	D	L	F	V	I	D	E	F	Y	K	L	A	F	R	Q	L	K	S	G	D	I	D	H	Q	D	E	R	V
Query Conservation																				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	R	F	S	P	D	S	V	N	G	S	E	N	T	A	G	L	K	R	N	L	D	K	D	D	N	K	I	I	V	T	T	I	Q	K	L	N	N	L	X	K	A	E	S	D	L	P	V	Y	N	Q	Q	V	V	F	I	F	D	E	C	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	Q	F
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T		S	S	S	S													S	S																						G	G	G	G	S								S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																.	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.						.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.								.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	E	L	N	I	A	L	S	K	L	L	K	V	S	R	Q	F	Y	L	T	G	P	F	V	.	.	.	.	.	N	S	I	R	G	L	E	K	L	G	Y	P	H	T	F	V	S	T	D	F	N	.	.	.	.	.	.	.	T	V	A	L	D	V	K	T	F	G	I	K	A	N	D	D	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.											.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.
Template Sequence		G	E	A	Q	K	N	L	K	K	K	F	K	R	.	Y	Y	Q	F	G	F	T	G	T	P	I	F	P	E	N	A	L	G	S	E	T	T	A	S	V	F	G	R	E	L	H	S	Y	V	I	T	D	A	I	R	D	E	K	V	L	K	F	K	V	D	Y	N	D	V	R	P	Q	F	K	S	L	E	T	E	T	D
Template Known Secondary structure													S		.								S	S				S	T	T		T	T	S									S														T	S	S												T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
																					292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.										.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	K	L	K	A	L	G	E	I	A	H	A	C	V	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	I	Y	C	K	S	P	T	V	A	G	L	V	A	R	E	L	I	R	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	K	L	S	A	A	E	N	Q	Q	A	F	L	H	P	X	R	I	Q	E	I	T	Q	Y	I	L	N	N	F	R	Q	K	T	H	R	T	F	P	G	S	K	G	F	N	A	X	L	A	V	S	S	V	D	A	A	K	A	Y	Y	A	T	F	K	R	L	Q	E	E	A	A	N	K	S	A	T	Y	K	P	L
Template Known Secondary structure								T		S	T	T	T	T	T																					T			S	S	S											S	S																						S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
																	331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	T	P	T	E	N	P	H	V	D	W	V	S	E	E	F	D	A	D	W	D	Y	T	V	A	L	R	N	G	I	G	L	H	F	G	A	L	P	R	A	L	Q	Q	Y	T	A	D	Q	F	N	A	G	K	L	R	F	L	L	C	T	S	T	I	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	A	T	I	F	S	F	A	A	I	G	E	I	S	D	E	T	F	D	T	S	A	X	D	S	S	A	K	E	F	L	D	A	A	I	R	E	Y	N	S	H	F	K	T	N	F	S	T	D	S	N	G	F	Q	N	Y	Y	R	D	L	A	Q	R	V	K	N	Q	D	I	D	L	L	I	V	V	G	X	F	L
Template Known Secondary structure																				S		G	G	G	S																				T					S	S																	T	T	S	S	S					S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	V	N	T	I	A	K	N	V	V	I	Y	D	N	R	D	G	T	R	S	I	D	K	F	T	H	G	N	I	K	G	R	A	G	R	M	G	V	H	F	V	G	K	I	F	C	L	E
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	F	D	A	P	T	L	N	T	L	F	V	.	.	.	.	.	D	K	N	L	R	Y	H	G	L	X	Q	A	F	S	R	T	N	R	I	Y	D	A	T	K	T	F	G	N	I	V	T
Template Known Secondary structure		S	S				T	T							.	.	.	.	.		S												G	G	G						T	T			S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.						.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.