Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 358 % Identity 17% Template d3bmva4 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.60

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		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.															.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	.	.	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.						.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		S	N	V	V	N	Y	S	T	D	V	I	Y	Q	I	V	T	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	T	G	D	L	Y	D	P	T	H	T	S	L	K	K	Y	F	G	G	D	W	Q	G	I	.	.	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	P	Q	P	V	E	N	I	Y
Template Known Secondary structure		T		T	T			T	T								G	G	G	T					G	G	G	S			G	G	G	B		T	T	S		S	T	T	S	B									.	.						T	S	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.			.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		E	P	R	L	Q	R	M	.	.	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	L	P	D	S	T	F	G	G	S	T	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	R	T	N	P	Y	F	G	S	.	.	.	.	.	F	T	D	F	Q	N	L	I	N	T	A	H	A	H	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	D	P	T	Y	A	E	N	G	R	L	Y
Template Known Secondary structure							T	T	T					S	T	T	S		S									T	T	T			.	.	.	.	.														T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.						.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation																																																															.
Template Sequence		D	N	G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	Y	G	G	T	D	F	S	S	Y	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	Q	Q	N	S	T	I	D	S	Y	L	K	S	A	I	K	V	W	L	.	D	M	G	I	D	G	I	R	L	D	A	V	K	H	M	P	F	G
Template Known Secondary structure			T	T						S	T	T		T	T			B			S		B				S	S							S	B	S	T	T				B		T	T	S																.		T	T							S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.
Query Sequence		P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	.	.	.	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S
Query Conservation																																		.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	Q	K	N	F	M	D	S	I	L	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	R	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	T	N	E	I	D	V	N	N	T	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	S	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	T	M	Y	G	L	D	S	M	I	Q	S	T
Template Known Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	S												T	T													S	S	S			B													T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250								.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	D	Y	.	.	.	.	N	F	I	N	D	M	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	Y	N	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	P	V	E	Q	A	L	A
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	T	T	G	G	G					S			S	S	S			S			S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.					.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	340	.	.	.	.	.	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	L	T	S	R	G	V	P	A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G	D	.	.	.	.	.	.	P	Y	N	R	A	M	M	T	S	F	N	T	S	T	T	A	Y	N	V	I	K	K	L	A	P	L	R	K	S	N	P	A	I	A
Template Known Secondary structure						S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G								T	T	S										T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.							.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.