Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 360 % Identity 19% Template d1uoka2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	E	S	V	V	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	S	N	G	D	G	I	.	.	.	.	G	D	L	R	G	I	.	.	I	S	K	L	D	Y	L	K	E	L	G	I	D	V	I	W	L	S	P	V	Y	E	S	P	N	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Y	D	I	S	D	Y	C
Template Known Secondary structure												G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.							.	.		T	T								T															T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.					.	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60											.	.	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	.	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																			.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																					.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	M	N	E	F	G	T	.	.	.	.	.	M	E	D	W	D	E	L	L	H	E	M	H	E	R	N	M	K	L	M	M	D	L	V	V	N	H	T	S	D	E	H	N	W	F	I	E	S	R	K	S	K	D	N	K	Y	R	D	Y	Y	I	W	R	P	G	K	E	G	K	E	P	N	N	W	G	A	A	F
Template Known Secondary structure					G	G	G			.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S							T	T		T	T		T	T	G	G	G	B						S	S	S	S		S	S		B	B		T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.						.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
																	296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		S	G	S	A	W	Q	Y	D	E	M	T	D	E	Y	Y	L	H	L	F	S	K	K	Q	P	D	L	N	W	D	N	E	K	V	R	Q	D	V	Y	E	M	M	K	F	W	L	.	E	K	G	I	D	G	F	R	M	D	V	I	N	F	I	S	K	E	E	G	L	P	T	V	E	T	E	E	E	G	Y	V	S	G
Template Known Secondary structure		S	S	B	S					T	T	T	T						S	S		T	T	S		B	B		T	T	S																.		T	T							T	T	G	G	G	S				T	T									S	S		B
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
													352	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																					.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																					.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	.	.	.	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																					.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																					.	.	.																																			.
Template Conservation																																																																															.
Template Sequence		H	K	H	F	M	N	G	P	N	I	H	K	Y	L	H	E	M	N	E	E	V	L	S	H	Y	D	I	M	T	V	G	E	M	P	G	V	T	T	E	E	A	K	L	Y	T	G	E	E	R	K	E	L	Q	M	V	F	Q	F	E	H	M	D	L	D	S	G	E	G	G	K	W	D	V	K	P	C	S	.	L	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	T		T	T												T	G	G	G	S									T	T												G	G	G		S		S						G	G	G	S	T	T			T	T										.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300		.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	K	E	N	L	T	K	W	Q	K	A	L	E	H	T	G	W	N	S	L	Y	W	N	N	H	D	Q	P	R	V	V	S	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	D	G	M	Y	R	I	E	S	A
Template Known Secondary structure														T	S	S	S	S						S			T	T	S							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	M	L	A	T	V	L	H	M	M	K	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	V	R	F	E	S	I	D	E	Y	R	D	I	E	T	L	N	M	Y	K	E	K	V	M	E	R	G	E	D	I	E	K	V	M	Q	S	I	Y	I	K	G	R	D	N	A	R	T	P	M	Q	W	D	D	Q	N
Template Known Secondary structure										T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G																T	S																G	G	G	G	T	S						S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		545	.																														.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	A	G	F	T	T	G	E	P	W	I	T	V	N	P	N	Y	K	E	I	N	V	K	Q	A	I	Q	N	K	D	S	I	F	Y	Y	Y	K	K	L	I	E	L	R	K	N	N	E	I	V
Template Known Secondary structure		T	T	T	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.