Job Description P15067 Confidence 98.11% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 129 Aligned Residues 318 % Identity 22% Template d1tz7a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.15

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		174	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	T	Y	.	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.				.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	L	G	K	E	A	.	.	Y	R	F	L	D	F	L	K	E	C	G	F	S	L	W	Q	V	L	P	L	N	P	T	S	L	E	A	G	N	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	S	N	S	L	F	A	G	N	Y	V	L	I	D	.	.	.	.	.	P	E	E	L	L	E	E	D	L	I	K	E
Template Known Secondary structure				S	S				.	.											T										S				G	G	G	T	T		T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		S		S	S	S			G	G	G	S		.	.	.	.	.	T						T	T	S	S		G
Template Predicted Secondary structure									.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.			.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.									.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.						.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	D	L	K	R	F	P	L	G	E	A	L	Y	E	V	V	Y	E	Y	K	K	E	L	L	E	K	A	F	K	N	F	R	R	F	E	L	L	E	D	F	L	K	E	H	S	Y	W	L	R	D	Y	A	L	Y	M	A	I	K	E	E	E	G	K	E	W	Y	E	W	D	E	E	L	K	R	R	E	K	E	A	L
Template Known Secondary structure		G	G						S		S																				T														T																			S		G	G	G	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
																										244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	V	L	N	K	L	K	G	R	F	Y	F	H	V	F	V	Q	F	V	F	F	K	Q	W	E	K	L	R	R	Y	A	R	E	R	G	I	S	I	V	G	D	L	P	M	Y	P	S	Y	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	V	W	T	N	P	E	L	F	K	L	D	G	D	L	K	P	L	F	V
Template Known Secondary structure								T																												T	T									S	S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G	B		B		T	T	S		B	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.									.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.											.	.	.	.	310	.	.	.	.						.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	C	G	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	L	S	H	P	A	V	V	.	.	.	.	.	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.													.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.
Template Sequence		A	G	V	P	P	D	F	F	S	K	T	G	Q	L	W	G	N	P	V	Y	N	W	E	E	H	E	K	E	G	F	R	W	W	I	R	R	V	L	H	N	L	K	.	.	L	F	D	F	L	R	L	D	H	F	R	G	F	E	A	Y	W	E	V	P	Y	G	E	E	T	A	V	N	G	R	W	V	K	A	P	G
Template Known Secondary structure								S	S	S	S	S									B								T	T	T												T	.	.	T		S					T	T	G	G	G	G	T							T	T		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.
Query SS confidence																																																																							.
Query Sequence		A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	.	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G
Query Conservation																																																																							.
Alig confidence													.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.				.
Template Conservation													.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	L	F	K	K	L	L	S	Y	F	.	.	P	K	N	P	F	I	A	E	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	I	T	D	E	V	R	Y	L	R	E	T	F	K	I	P	G	S	R	V	I	.	.	.	.	.	E	F	A	F	Y	D	K	E	S	E	H	L	P	H
Template Known Secondary structure												S	.	.	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S												T	T							G	.	.	.	.	.	G	G	T	T	S	S	T	T		T	T	S	G	G
Template Predicted Secondary structure													.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.			.	.	.	.	330	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.						.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	E	E	N	N	V	Y	Y	T	S	T	H	D	L	P	P	I	R	G	W	F	E	N	L	G	E	E	S	R	K	R	L	F	E	Y	L	G	R	E	I	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	V	N	E	E	L	I	R	L	V	L	I	S	R	A	K
Template Known Secondary structure		G			S	S					S			T	T	S									T														T	S				G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G												S			S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		510	.	.	.	.	.	.	.				.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure										.	.	.
Query SS confidence										.	.	.
Query Sequence		P	M	L	L	A	G	D	E	.	.	.	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I
Query Conservation										.	.	.
Alig confidence										.	.	.																														.	.
Template Conservation																																										.	.
Template Sequence		F	A	I	I	Q	M	Q	D	L	L	N	L	G	N	E	A	R	M	N	Y	P	G	R	P	F	G	N	W	R	W	R	I	K	E	D	Y	T	Q	K	K	.	.	E	F	I	K	K	L	L	G	I	Y	G	R	E
Template Known Secondary structure											T	T			G	G	G					T	T			S	S		S						S		G	G	G	G		.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.			.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.