Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 360 % Identity 21% Template d1ji1a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.60

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		142	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	P	R	T	P	W	.	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L
Query Conservation									.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation																																																																									.	.
Template Sequence		N	F	K	T	P	D	W	L	K	N	G	V	M	Y	Q	I	F	P	D	R	F	Y	N	G	D	S	S	N	D	V	Q	T	G	S	Y	T	Y	N	G	T	P	T	E	K	K	A	W	G	S	S	V	Y	A	D	P	G	Y	D	N	S	L	V	F	F	G	G	D	L	A	G	I	.	.	D	Q	K	L	G	Y	I
Template Known Secondary structure																			G	G	G	T			S		G	G	G				T	T	S				T	T								T	T	S			S			T	T	S		G	G	G											.	.			T
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.			.	.	.	.	.	.	200
		189	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.					.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence				.																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	.	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	.	.	.	.	G	I	E	V	I	L	D	I	V
Query Conservation				.																																																																	.	.	.	.
Alig confidence				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	T	L	G	A	N	I	L	Y	L	N	P	I	F	K	A	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	K	Y	D	T	Q	D	Y	M	A	V	D	P	A	F	G	D	.	.	.	.	.	N	S	T	L	Q	T	L	I	N	D	I	H	S	T	A	N	G	P	K	G	Y	L	I	L	D	G	V
Template Known Secondary structure			T	T	T								S						S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			S		S							T	T	T			.	.	.	.	.														S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.												220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.						.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.											.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.			.	.	.	.	.	.	.	310			.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.						.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.													.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.													.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	.	.	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	.	.	.	.	.	Y	W
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.													.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.									.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	N	H	T	G	D	S	H	P	W	F	D	K	Y	N	N	F	S	S	Q	G	A	Y	E	S	Q	S	S	P	W	Y	N	Y	Y	T	F	Y	T	W	P	D	S	Y	A	S	F	L	G	F	N	S	L	P	K	L	N	Y	G	N	S	G	S	A	V	R	G	V	I	Y	N	N	S	N	S	V	A	K	T	Y	L
Template Known Secondary structure			S	B			T	T	S	T	T	T		T	T			S	S	S			T	T	T		T	T		T	T	G	G	G	B					T	T	T						T	T						B	B	B			S	T	T								T	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.						360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	.	.	.	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A
Query Conservation																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation																																																													.	.
Template Sequence		N	P	P	Y	S	V	D	G	W	R	L	D	A	A	Q	Y	V	D	A	N	G	N	N	G	S	D	V	T	N	H	Q	I	W	S	E	F	R	N	A	V	K	G	V	N	S	N	A	A	I	I	G	E	Y	W	G	N	A	N	P	.	.	W	T	A	Q	G	N	Q	W	D	A	A	T	N	F	D	G	F	T	Q
Template Known Secondary structure		S	T	T	T								T	T	G	G	G		B	S	T	T				S	S																			T	T								S	S			G	G	.	.	G	T	T	T	S	S	S		S			B		T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.			.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		400	.	.	.	.									.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	R	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	S	E	W	I	T	G	K	D	Y	Q	N	N	S	A	S	I	S	T	T	Q	F	D	S	W	L	R	G	T	R	A	N	Y	P	T	N	V	.	.	Q	Q	S	M	M	N	F	L	S	N	H	D	I	T	R	F	A	T	R	S	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	S	B		T	T	S		B																	T	T	S					.	.		T	T					S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460			.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	W	K	T	Y	L	A	L	I	F	Q	M	T	Y	V	G	T	P	T	I	Y	Y	G	D	E	Y	G	M	Q	G	G	A	D	.	.	.	.	.	.	P	D	N	R	R	S	F	D	W	S	Q	A	T	P	S	N	S	A	V	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G					T	T	S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.							.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	T	Q	K	L	I	T	I	R	N	Q	Y	P	A	L	R	T	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.