Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 55 Aligned Residues 346 % Identity 24% Template d1j0ha3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.																.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	D	T	V	W	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	N	P	S	I	S	P	E	G	S	R	P	W	G	S	E	D	P	T	P	T	S	F	F	G	G	D	L	Q	G	I	.	.	I	D	H	L	D	Y	L	V	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	S	P	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G								G	G	G	T			S		G	G	G	S		T	T				T	T	S	S				S	S											.	.			T								T													S	S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.			.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	V	D	P	H	F	G	D	.	.	.	.	.	K	E	T	L	K	T	L	I	D	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y	E	F	A	P	F	Q	D	V	W	K	N	G	E	S	S	K	Y	K	D	W	F	H	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S	S			S		S							T	T	T			.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T											G	G	G		T	T	G	G	G	B		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
							204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.						.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.												300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	D	Y	H	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	T	F	A	F	V	P	Q	M	P	K	L	N	T	A	N	P	E	V	K	R	Y	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	D	H	E	F	W	R	E	F	R	Q	E	V	K	A	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	S	S				S	S	S		S	B		B	S	T	T		T	T	S	B	B	B		T	T	S																										T	T	G	G	G	S															.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.																																									.	.
Template Conservation																											.	.	.																																									.	.
Template Sequence		L	K	P	D	V	Y	I	L	G	E	I	W	H	D	A	M	P	W	L	R	G	D	Q	F	D	.	.	.	A	V	M	N	Y	P	F	T	D	G	V	L	R	F	F	A	K	E	E	I	S	A	R	Q	F	A	N	Q	M	M	H	V	L	H	S	Y	P	N	N	V	.	.	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S
Template Known Secondary structure				T	T								S	S			G	G	G		S	S	S	S		S	.	.	.			B													T	S			S															T	S					.	.			T		B		B	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.																																									.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.				.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.			.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	D	T	S	R	I	L	T	V	C	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	T
Template Known Secondary structure		T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.
Query SS confidence																						.	.
Query Sequence		Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E
Query Conservation																						.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	N	D	.	.	.	.	.	.	P	E	C	R	K	C	M	V	W	D	P	M	Q	Q	N	K	E	L	H	Q	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q	Y	R	S	L	R	R
Template Known Secondary structure				S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G							T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		465	.	.	.							.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.