Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 351 % Identity 16% Template d1hx0a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.38

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		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.		.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	.	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N
Query Conservation																																												.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																									.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Sequence		P	Q	T	Q	S	G	R	T	S	I	V	H	L	F	E	W	R	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	A	L	E	C	E	R	Y	L	G	P	K	G	F	G	G	V	Q	V	S	P	P	N	E	N	I	V	V	T	N	.	.	.	P	S	R	P	W	W	E	R	Y	Q
Template Known Secondary structure						T	T								T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T	.	.	.	T	T	S		G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.				.	.	.	.	.	.	60	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C
Query Conservation
Alig confidence					.										.	.	.	.	.
Template Conservation					.										.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	S	.	Y	K	L	C	T	R	S	G	N	.	.	.	.	.	E	N	E	F	R	D	M	V	T	R	C	N	N	V	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	C	G	S	G	A	A	A	G	T	G	T	T	C	G	S	Y	C	N	P	G	N	R	E	F	P	A	V	P	Y	S	A	W	D	F	N
Template Known Secondary structure		B	S		.	S		S		B	T	T	B		.	.	.	.	.														T	T										S					T	T				B	S		B	S	S				B	B	G	G	G	T	B	B	T	T	T	T	B		G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure					.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		64	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
																													303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		D	G	K	C	K	T	A	S	G	G	I	E	S	Y	N	D	P	Y	Q	V	R	D	C	Q	L	V	G	L	L	D	L	A	L	E	K	D	Y	V	R	S	M	I	A	D	Y	L	N	K	L	I	.	D	I	G	V	A	G	F	R	I	D	A	S	K	H	M	W	P	G	D	I	K	A	V	L	D	K	L	H	N
Template Known Secondary structure		T	T	T			S	T	T	S	B				T	T								S	B	G	G	G				B		T	T	S																.			T							T	T	G	G	G	S										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		356	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		A	I	Q	N	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A
Query Conservation						.
Alig confidence						.																																																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	T	N	W	F	P	A	G	S	R	P	F	I	F	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	A	I	K	S	S	E	Y	F	G	N	G	R	V	T	E	F	K	Y	G	A	K	L	G	T	V	V	R	K	W	S	G	E	K	M	S	Y	L	K	N	W	G	E	.	.	.	.	.	G	W	G	F	M	P	S	D	R
Template Known Secondary structure				T	T	T	S		T	T													S	S	S	S	S		G	G	G	G	T	T	T	S																T	T		T	T			G	G	G	G	G	G	T	T	G	.	.	.	.	.	G	G	T				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.						.	.	.	.	.	.	.	290	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	.	G	T	P	M	L	L
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	G	H	G	A	G	G	S	S	I	L	T	F	W	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	L	Y	K	I	A	V	G	F	M	L	A	H	P	Y	G	F	T	R	V	M
Template Known Secondary structure						S			T	T	G	G	G	T		S	S		G	G	G				G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S		S	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		514	.	.	.	.	.	520	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	D	E	H	G	H	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		S	S	Y	R	W	A	R	N	F	V	N	G	E	D	V	N	D	W	I	G	P	P	N	N	N	G	V	I	K	E	V	T	I	N	A	D	T	T	C	G	N	D	W	V	C	E	H	R	.	.	W	R	E	I	R	N	M	V	W	F	R	N	V
Template Known Secondary structure				B								T	T			T	T	T	T			S	S			T	T							B		T	T	S		B		T	T	B			G	G	G	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.			.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400