Job Description P15067 Confidence 98.72% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 118 Aligned Residues 321 % Identity 22% Template d1eswa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

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		174	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	T	Y	.	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.				.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	L	G	R	E	A	.	.	R	D	F	L	R	F	L	K	E	A	G	G	R	Y	W	Q	V	L	P	L	G	P	T	G	Y	G	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	Q	S	F	S	A	F	A	G	N	P	Y	L	I	D	.	.	.	.	.	L	R	P	L	A	E	R	G	Y	V	R	L
Template Known Secondary structure				S	S				.	.										T	T										S		B		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	B	S		S	S				G	G	G			.	.	.	.	.	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure									.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.											.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.						.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	D	P	G	F	P	Q	G	R	V	D	Y	G	L	L	Y	A	W	K	W	P	A	L	K	E	A	F	R	G	F	K	E	K	A	S	P	E	E	R	E	A	F	A	A	F	R	E	R	E	A	W	W	L	E	D	Y	A	L	F	M	A	L	K	G	A	H	G	G	L	P	W	N	R	W	P	L	P	L	R	K
Template Known Secondary structure								S	S	B																																																									T	T	T			G	G	G	S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
																																244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	E	E	K	A	L	R	E	A	K	S	A	L	A	E	E	V	A	F	H	A	F	T	Q	W	L	F	F	R	Q	W	G	A	L	K	A	E	A	E	A	L	G	I	R	I	I	G	D	M	P	I	F	V	A	E	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	V	W	A	H	P	E	W	F	H	L	D	E	E
Template Known Secondary structure		T												T																												T	T									S	S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G	B		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.									.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.							.	.	.	310	.	.	.	.										.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	.	.	.	.	.	.	N	L	S	H	P	A	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.
Template Sequence		G	R	P	T	V	V	A	G	V	P	P	D	Y	F	S	E	T	G	Q	R	W	G	N	P	L	Y	R	W	D	V	L	E	R	E	G	F	S	F	W	I	R	R	L	E	K	A	L	E	L	.	.	F	H	L	V	R	I	D	H	F	R	G	F	E	A	Y	W	E	I	P	A	S	C	P	T	A	V	E	G	R
Template Known Secondary structure		S		B	S									S	S		S	S									B								T	T	T														.	.		S						T	G	G	G	G	T							T	T		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.			.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
								351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.												.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	V	K	A	P	G	E	K	L	F	Q	K	I	Q	E	V	F	.	.	G	E	V	P	V	L	A	E	D	L	G	V	I	T	P	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	R	D	R	F	G	L	P	G	M	K	V	L	Q	F	A	F	D	D	G	M	E	N	P	F
Template Known Secondary structure																			.	.	S	S								T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T							G	G	G	S	S	S	S		T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	H	N	Y	P	A	H	G	R	V	V	V	Y	T	G	T	H	D	N	D	T	T	L	G	W	Y	R	T	A	T	P	H	E	K	A	F	M	A	R	Y	L	A	D	W	G	I	T	F	R	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	V	P	W	A	L	M	H	L	G	M
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	S		T	T							S			T	T	S										S															T	T				S	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.				.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	.	.	.	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	V	A	R	L	A	V	Y	P	V	Q	D	V	L	A	L	G	S	E	A	R	M	N	Y	P	G	R	P	S	G	N	W	A	W	R	L	L	P	G	E	L	S	P	E	H	G	A	R	L	R	A	M	A	E
Template Known Secondary structure			S	S		S										T	T			G	G	G		S			T	T		S	S	S	T	T		B				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.