Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 65 Aligned Residues 346 % Identity 27% Template d1eh9a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 3.00

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		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	F	E	G	V	.	.	I	R	K	L	D	Y	L	K	D	L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	Y	D	G	V	Y
Template Known Secondary structure				S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					.	.			T								T										B			S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.										.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.										150	.	.	.	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	.	.	.	.	.	P	E	G	F	R	K	L	V	D	E	A	H	K	K	G	L	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	L	.	.	.	.	.	.	G	P	Y	F	S	.	.	.	.	Q	K	Y	K	T	P	W	G	L	T	F	N	F
Template Known Secondary structure		T	T		B		S	T	T			.	.	.	.	.														T	T										S				S	S	S							.	.	.	.	.	.	S			S		.	.	.	.	S	S				S	S	S					S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.						.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.						.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.							.	.	.	.	.					.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.
Template Sequence		D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	V	E	Y	W	I	K	E	Y	N	V	D	G	F	R	L	D	A	V	H	A	I	I	D	T	S	P	K	H	I	L	E	E	I	A	D	V	V	H	K	.	.	.	.	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K
Template Known Secondary structure		S	S	T	T																			S								T	T	G	G	G					S	S	S													.	.	.	.	T	T									S			T	T	T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.					.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		386			.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	.	.	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D
Query Conservation			.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	G	Y	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	F	H	H	S	I	H	A	Y	L	T	G	E	R	Q	G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y	K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N	F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D
Template Known Secondary structure		T					S																S				S	G	G	G	G	G			S										S	S		S		S	S				T	T	T	T									S			G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	V	G	N	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R	E	S	Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y	G	E	E	N	P
Template Known Secondary structure					T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				G	G	G	G	S														S	S	S	S						S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.															.	.	.	.	.	540	.												.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	W	L	D	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	Y	F	F	S	D	F	S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	R	K	K	E	N	G	Q	D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	I	D	E	E	I	F	S	F	Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	S	I
Template Known Secondary structure										S	T	T													T				S		T	T	S						T	T	S																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.