Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 63 Aligned Residues 359 % Identity 18% Template d1cgta4 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.															.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.			.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query Sequence		P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	.	.	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.					.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		T	N	K	Q	S	F	S	T	D	V	I	Y	Q	V	F	T	D	R	F	L	D	G	N	P	S	N	N	P	T	G	A	A	Y	D	A	T	C	S	N	L	K	L	Y	C	G	G	D	W	Q	G	L	.	.	I	N	K	I	N	D	N	Y	F	S	D	L	G	V	T	A	L	W	I	S	Q	P	V	E	N	I	F
Template Known Secondary structure		T		T	T			T	T														S		G	G	G				G	G	G	B		T	T			S	T	T	S	B									.	.						T	T						T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.		.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		E	P	R	L	Q	R	M	.	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R
Query Conservation									.
Alig confidence									.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	I	N	Y	S	G	V	T	N	T	A	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	K	T	N	P	Y	F	G	T	.	.	.	.	.	M	A	D	F	Q	N	L	I	T	T	A	H	A	K	G	I	K	I	V	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	M	E	T	D	T	S	F	A	E	N	G	R	L	Y	D
Template Known Secondary structure		S					T	T						T	T	S		S									T	T	T			.	.	.	.	.														T	T									T	T							T	T		T	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.						.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		N	G	T	L	V	G	G	Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	N	G	G	S	D	F	S	S	L	E	N	G	I	Y	K	N	L	Y	D	L	A	D	F	N	H	N	N	A	T	I	D	K	Y	F	K	D	A	I	K	L	W	L	.	D	M	G	V	D	G	I	R	V	D	A	V	K	H	M	P	L	G	W
Template Known Secondary structure		T	T						S	T	T		T	T			B			S		B				S	S							S	B	B	T	T				B		T	T	S																.		T	T							S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.				.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.
Query Sequence		E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	.	.	.	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S
Query Conservation																																								.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	S	W	M	S	S	I	Y	A	H	.	.	.	.	.	.	.	K	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	S	A	A	S	D	A	D	N	T	D	F	A	N	K	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	N	S	A	V	R	N	V	F	R	D	N	T	S	N	M	Y	A	L	D	S	M	I	N	S	T	A
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	S											S	S	S	S												S	S	S			B													T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.								250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	Y	N	Q	.	.	.	.	V	N	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	R	F	K	T	S	A	V	N	N	R	R	L	E	Q	A	L	A	F
Template Known Secondary structure					T	T	.	.	.	.	G	G	G	S				S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.					.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	T	S	R	G	V	P	A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	L	T	G	N	G	D	.	.	.	.	.	.	P	D	N	R	A	K	M	P	S	F	S	K	S	T	T	A	F	N	V	I	S	K	L	A	P	L	R	K	S	N	P	A	I	A
Template Known Secondary structure					S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G								S		S										T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.							.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.