Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 423 % Identity 34% Template d1bf2a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.				210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.
Query Sequence		A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	.	.	.	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y
Query Conservation																																																																						.	.	.
Alig confidence																																								.	.																													.	.	.
Template Conservation																																								.	.
Template Sequence		T	K	P	T	R	A	Q	K	D	D	V	I	Y	E	V	H	V	R	G	F	T	E	Q	D	T	S	I	P	A	Q	Y	R	G	T	Y	Y	G	A	.	.	G	L	K	A	S	Y	L	A	S	L	G	V	T	A	V	E	F	L	P	V	Q	E	T	Q	N	D	A	N	D	V	V	P	N	S	D	A	N	Q	N	Y
Template Known Secondary structure								G	G	G													T	T		T	T	S		G	G	G	T	T	S					.	.			T								T							S			B		B	S		T	T	T	T	S	S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.			.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.			.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.									.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	.	.	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	Y
Query Conservation																						.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	G	Y	M	T	E	N	Y	F	S	P	D	R	R	Y	A	Y	N	K	A	A	G	G	P	T	A	E	F	Q	A	M	V	Q	A	F	H	N	A	G	I	K	V	Y	M	D	V	V	Y	N	H	T	A	E	G	G	T	W	T	S	S	D	P	T	T	A	T	I	Y	S	W	R	G	L	D	N	A	T	Y	Y	E
Template Known Secondary structure		S				B	S		S	S		B		G	G	G		S			S	T	T																T	T										S	S		T	T		S	B	S	S	S	S		S	S		B			S	S										B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	S	G	N	Q	Y	F	Y	D	N	T	G	I	G	A	N	F	N	T	Y	N	T	V	A	Q	N	L	I	V	D	S	L	A	Y	W	A	N	T	M	G	V	D	G	F	R	F	D	L	A	S	V	L	G	N	S	C	L	N	G	A	Y	T	A	S	A	P	N	C	P	N	G	G	Y	N	F	D	A	A	D
Template Known Secondary structure		B		T	T	S	S	S	B			S	S	S	S	S			B		T	T	S																	T	S								T	T	G	G	G	G	G	B			S	S	S	S			T	T	S	T	T		T	T		S			B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
								352	.	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.				.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.									.	.																																													.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.									.	.																																													.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	.	.	.	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.									.	.																																													.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.									.	.																																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	V	A	I	N	R	I	L	R	E	F	T	V	R	P	A	A	G	G	S	G	L	D	L	F	A	E	P	W	A	I	G	G	N	S	Y	Q	L	G	G	F	P	Q	G	W	S	E	W	N	G	L	F	R	D	S	L	R	Q	A	Q	N	E	L	G	S	M	T	I	Y	V	T	Q	D	A	N	D	F	S	G
Template Known Secondary structure		T	T	S									S		B			T	T			S	S	B									S	S	T	T				T	T		S		T	T																			B	T	T	B												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.			.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.
Query SS confidence																																												.	.
Query Sequence		S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	.	.	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A
Query Conservation																																												.	.
Alig confidence																																												.	.																		.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.
Template Sequence		S	S	N	L	F	Q	S	S	G	R	S	P	W	N	S	I	N	F	I	D	V	H	D	G	M	T	L	K	D	V	Y	S	C	N	G	A	N	N	S	Q	A	W	P	Y	G	P	S	D	G	G	T	S	T	N	Y	S	W	D	Q	G	M	.	.	.	S	A	G	T	G	A	A	V	D	Q	R	R	A	A	R	T
Template Known Secondary structure							G	G	G	T			G	G	G					S			S	S	S							T	T		S	S							T	T	S								S							T	T	T	.	.	.	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.				.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.
Query SS confidence																																													.	.
Query Sequence		L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W
Query Conservation																																													.	.
Alig confidence																																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	M	A	F	E	M	L	S	A	G	T	P	L	M	Q	G	G	D	E	Y	L	R	T	L	Q	C	N	N	N	A	Y	N	L	D	S	S	A	N	W	L	T	Y	S	W	T	T	D	Q	S	N	F	Y	T	F	A	Q	R	L	I	A	F	R	K	A	H	P	A	L	R	P	S	S	W
Template Known Secondary structure									S	S	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T			S	T	T	T	S																											G	G	G	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.