Job Description P15067 Confidence 98.55% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 119 Aligned Residues 384 % Identity 14% Template c3topA_ PDB info PDB header:hydrolase/hydrolase inhibitor Chain: A: PDB Molecule:maltase-glucoamylase, intestinal; PDBTitle: crystral structure of the c-terminal subunit of human maltase-2 glucoamylase in complex with acarbose Resolution 2.88 Å

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		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.			.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	.	.	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	S	L	Y	D	E	M	V	A	A	Q	I	P	Y	D	V	Q	Y	S	D	I	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	E	R	Q	L	D	F	T	L	S	P	K	F	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	A	L	I	N	R	M	K	A	D	G	M	R	V
Template Known Secondary structure													T										G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T		T	T				G	G	G	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.												T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1259	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.									.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.
Template Sequence		I	L	I	.	L	D	P	A	I	S	G	N	E	T	Q	P	Y	P	A	F	T	R	G	V	E	D	D	V	F	I	K	Y	P	N	D	G	D	I	V	W	G	K	V	W	P	D	F	P	D	V	V	V	N	G	S	L	D	W	D	S	Q	V	E	L	Y	R	A	Y	V	A	F	P	D	F	F	R	N	S	T	A
Template Known Secondary structure					.			S								S												T		B		B		S	S	S			B										S	S					T	T	S									T							B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		1313	.	.		.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.								.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	.	.	.	.	.	.	.	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	W	W	K	R	E	I	E	E	L	Y	N	N	P	Q	N	P	E	R	S	L	K	F	D	G	M	W	I	D	M	N	E	P	S	S	F	V	N	G	A	V	S	P	G	C	R	D	A	S	L	N	H	P	P	Y	M	P	H	L	E	S	R	D	R	G	L	S	S	K	T	L	C	M	E	S	Q	Q	I	L	P
Template Known Secondary structure													S		S	S		G	G	G					S						S	T	T	T			S	S	S	S	S	S	S	S					T	T	T	S	S		S	S			S		T	T	G	G	G	T	T	T	T	T	S			T	T						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1392	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	S	L	V	Q	H	Y	N	V	H	N	L	Y	G	.	.	.	W	S	Q	T	R	P	T	Y	E	A	V	Q	E	V	T	G	Q	R	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	T	R	S	T	F	P	S	S	G	R	W	A	G	H	W	L	G	D	N	T	A	A	W	D	Q	L
Template Known Secondary structure		S	S									G	G	G			.	.	.																S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S			T	T	G	G	G	T									B	S	S	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1472	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.				.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.															.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	S	I	I	G	M	M	E	F	S	L	F	G	I	S	Y	T	.	.	G	A	D	I	C	G	F	F	Q	D	A	E	Y	E	M	C	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T			S		.	.			B	T	T		S	B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template SS confidence
																																													1535	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.			.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
									520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																														.	.	.
Template Sequence		R	W	M	Q	L	G	A	F	Y	P	F	S	R	N	H	N	T	I	G	T	R	R	Q	D	P	V	S	W	.	.	.	D	V	A	F	V	N	I	S	R	T	V	L	Q	T	R	Y	T	L	L	P	Y	L	Y	T	L	M	H	K	A	H	T	E	G	V	T	V	V	R	P	L	L	H	E	F	V	S	D	Q	V
Template Known Secondary structure								T	T	S	S	S							S	S	S				S	G	G	G	S	.	.	.																																				S				G	G	G	T		T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.
Template SS confidence
		1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.				.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610			.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.
Query SS confidence																				.	.
Query Sequence		Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	.	.	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q	R
Query Conservation																				.	.
Alig confidence								.												.	.
Template Conservation								.
Template Sequence		T	W	D	I	D	S	.	Q	F	L	L	G	P	A	F	L	V	S	P	V	L	E	R	N	A	R	N	V	T	A	Y	F	P	R	A	R	W	Y	D	Y	Y	T	G	V	D	I	N	A	R	G	E	W	K	T	L	P	A	P	L	D	H	I	N	L	H	V	R
Template Known Secondary structure		T	T	T			S	.	S				T	T	T								S	S	S										S	S					T	T	T			B				S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		1647	.	.	1650	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.