Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 536 % Identity 23% Template c3k1dA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:1,4-alpha-glucan-branching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen branching enzyme synonym: 1,4-alpha-d-2 glucan:1,4-alpha-d-glucan 6-glucosyl-transferase from mycobacterium3 tuberculosis h37rv Resolution 2.33 Å

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		12	.	.	.	.	.	.									.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.		.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		L	G	A	H	Y	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	.	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.																																		.																												.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		L	G	A	H	P	R	S	F	T	T	A	D	G	V	V	S	G	V	S	F	A	V	W	A	P	N	A	K	G	V	S	L	I	G	E	F	N	G	W	N	G	H	E	A	P	M	R	V	L	G	P	S	G	V	W	E	L	F	W	P	D	F	P	C	D	G	L	Y	K	F	R	V	H	G	A	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S										S	S	S												T	T		S							G	G	G	T	T				S		B					G	G	G									T			T	T										T	T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.							.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	R	F	N	P	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	.	.	.	.	.	.	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	V	V	T	D	R	A	D	P	F	A	F	G	T	E	V	P	P	Q	T	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	T	S	S	D	Y	T	W	G	D	D	D	W	M	A	G	R	A	L	R	N	P	V	N	E	A	M	S	T	Y	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S								T	T		S	S	B			T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S									T	T			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.		.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	.	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C
Query Conservation																															.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.					.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	G	S	W	R	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	Q	L	.	.	A	R	E	L	T	D	Y	I	V	D	Q	G	F	T	H	V	E	L	L	P	V	A	E	H	P	F	A	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	Y	Q	V	T	S	Y	Y	A	P	T	S	R	F	G	T
Template Known Secondary structure			T	T	T	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.												T		S					S						S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.										.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.										.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	P	D	D	F	R	A	L	V	D	A	L	H	Q	A	G	I	G	V	I	V	D	W	V	P	A	H	F	P	K	D	A	W	A	.	.	.	.	.	L	G	R	F	D	G	T	P	L	Y	E	H	S	D	P	K	R	G	E	Q	L	D	W	G	T	Y	V	F	D	F	G	R	P	E	V	R	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.														T	T									T	T						T	T	T	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	S	S			S	B						S	S	S	T	T							B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.						.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation																																																																		.	.
Template Sequence		F	L	V	A	N	A	L	Y	W	L	Q	E	F	H	I	D	G	L	R	V	D	A	V	A	S	M	L	Y	L	D	Y	S	R	P	E	G	G	W	T	P	N	V	H	G	G	R	E	N	L	E	A	V	Q	F	L	Q	E	M	N	A	T	A	H	K	.	.	V	A	P	G	I	V	T	I	A	E	E	S	T	P
Template Known Secondary structure														S										T					B							S	S			S				S	S		S	B																		.	.		S	T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.			.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.			.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.
Query SS confidence															.	.
Query Sequence		A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	.	.	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F
Query Conservation															.	.
Alig confidence															.	.																																.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	S	G	V	T	R	P	T	N	I	G	G	L	G	F	S	M	K	W	N	M	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	V	S	R	D	P	V	Y	R	S	Y	H	H	H	E	M	T	.	.	.	.	.	.	F	S	M	L	Y	A	F	S	E	N	Y	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	S		G	G	G	T					S																	S		G	G	G	G	G	G	G						.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	T	T	T	S	S								G	G	G	S	S	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.							.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	G	T	L	W	G	R	M	P	G	N	N	H	V	K	A	A	G	L	R	S	L	L	A	Y	Q	W	A	H	P	G	K	Q	L	L	F	M	G	Q	E	F	G	Q	R	A	E	W	S	E	.	.	.	.	.	Q	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S							S		S	S																		S	S	S						T	T	G	G	G	T			S				T	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.						.	.
		534	.	.	.	.	.	540			.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		Q	L	T	W	L	D	W	.	.	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	D	W	F	Q	L	D	E	N	G	F	S	N	G	I	Q	R	L	V	R	D	I	N	D	I	Y	R	C	H	P	A	L	W	S	L	D	T	T	P	E	G	Y	S	W	I	D	A	N	D	S	A	N	N	V	L	S	F	M	R	Y	G	S	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	L	A	C	V	F
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	G	S	S	S	S																			G	G	G	T	T	T	T	T	S	G	G	G									T	T	T	T									T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.									.	.	.	.	.	.	660
		612	.	.	.	.	.	.	.				620	.	.	.		.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.					.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.					.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	T	L	E	V	T	E	.	.	.	I	V	L	P	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation										.	.	.					.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.					.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	A	G	A	E	H	R	D	Y	R	L	G	L	P	R	A	G	R	W	R	E	V	L	N	T	D	A	T	I	Y	H	G	S	G	I	G	N	L	G	G	V	D	A	T	D	D	P	W	H	G	R	P	A	S	A	V	L	V	L	P	P	T	S	A	L	W	L	T
Template Known Secondary structure				S	S	S										S	S										T	T		G	G	G	T	S				S		T	T						S			B	T	T	B	S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.