Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 103 Aligned Residues 396 % Identity 20% Template c3hjeA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:704aa long hypothetical glycosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of sulfolobus tokodaii hypothetical2 maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

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		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A
Query Conservation
Alig confidence							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	S	E	I	.	.	R	N	R	L	D	Y	F	V	E	L	G	V	T	H	L	Y	L	S	P	V	L	K	A	R	P	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	Y	D	V	V	D	Y	N	T	I	N	D	E	L	G	G	.	.	.	.	.	E	E	E	Y	I	R	L	I	D	E	A	K	S	K
Template Known Secondary structure							.	.		T	T								T		S											S	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		S									G	G	G	T		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.			.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.										.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.						.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	G	I	I	Q	D	I	V	P	N	H	M	A	V	H	H	T	N	W	R	L	M	D	V	L	K	K	G	R	H	S	R	Y	Y	N	Y	F	D	F	Y	E	E	E	E	K	I	R	I	P	I	L	G	D	R	N	F	K	I	T	Y	V	N	D	E	P	Y	L	D	Y	Y	G	N	L	F	P	I	N	D	E
Template Known Secondary structure		T										S					S	T	T											G	G	G	S	G	G	G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S									T	T							T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
																286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.						.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																																								.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																																								.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	.	.	.	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	.	.	G	R	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																		.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.
Template Sequence		G	R	N	Y	L	N	D	I	E	K	L	L	K	V	Q	Y	Y	E	L	V	D	W	R	D	Y	P	S	Y	R	R	F	F	A	V	N	E	L	I	A	V	R	Q	E	L	E	W	V	F	E	D	S	H	S	.	.	.	.	K	I	L	S	F	E	V	D	G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	F	K	P	E	E
Template Known Secondary structure		G	G	G		T	T								T	S	S						T	T	S			S	B				T	T							B		T	T	S									T	.	.	.	.	T	G	G	G	S			S					T	T	G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.					210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Sequence		Y	L	R	R	L	K	N	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	K	H	I	F	V	E	K	I	L	S	I	G	E	K	L	R	W	D	F	.	.	.	I	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L	L	F	T	D	N	E	D	K	M	T	E	I	Y	K	N	I	L	D	I	D	L	D
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T	T				S		T	T	.	.	.	S				S	S									T	T	S													T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.											.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.				.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	V	K	E	T	K	K	K	I	I	D	T	L	F	K	H	D	I	E	R	I	S	M	M	L	G	V	N	Y	E	E	I	K	E	F	L	S	C	L	K	V	Y	R	T	Y	I	T	E	N	D	F	R	D	E	E	I	I	R	N	C	S	Q	K	V	Y	E	S	M	K	K	N	V	T	A	F	M	K	L	Q
Template Known Secondary structure																S												T	S														S	S					B	T	T	B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																														425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		Q	Y	M	P	A	V	F	A	K	A	Y	E	D	T	V	L	F	I	Y	N	R	L	I	S	L	N	E	V	G	S	D	L	H	Y	Y	S	I	S	C	D	K	F	H	E	F	N	L	K	R	V	G	T	L	.	S	F	N	A	T	S	T	H	D	T	K	F	S	E	D	V	R	M	R	I	S	A	I	S	E	I
Template Known Secondary structure		T	T									T	T	T	T	G	G	G	T			S		G	G	G		S	T	T			T	T		S													T	T	T	T			.					S			T	T		S	S												T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.		.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
		461											.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	E	W	A	K	K	V	N	E	W	H	N	I	L	N	P	N	I	D	K	N	D	E	Y	R	L	Y	Q	T	I	V	G	S	F	D	G	F	N	N	E	Y	K	E	R	L	K	A	H	M	I	K	A	L	R	E	A	K	V	H	T	D	W	V	N	V	N	T	E	Y	E	K	K	M	T	Y	L	I	D	K
Template Known Secondary structure																				S																			S	S																			T	S	S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
																																501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	F	N	N	E	K	F	M	E	S	F	L	E	F	E	S	K	I	D	K	M	G	K	V	K	S	L	S	L	V	A	L	K	I	T	S	P	G	V	A	D	F	Y	Q	G	L	E	N	F	.	.	.	.	.	.	R	Y	L	L	T	D	P	D	N	R	R	P	V	V	F	S	E	L	P	K	R	Y	E	E	G
Template Known Secondary structure			T	T																																	S	S	S						T	T	T	T	S		.	.	.	.	.	.					S	T	T	G	G	G	S										S			G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.							.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
												550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.		.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	.	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	N	N	G	R	I	K	A	Y	V	T	K	V	L	L	N	L	R	K	S	M	K	D	F	F	I	N	S	E	Y	K	P	L	K	L	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	C	G	F	M	R	G	D	K	V	L	V	I	V	K	T	L	N	R	D	Y
Template Known Secondary structure		G	T	T	T	S	T																T	T	T					S									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T	T							S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
		619	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	V	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P
Query Conservation
Alig confidence							.
Template Conservation							.
Template Sequence		D	I	E	I	D	.	G	E	Y	T	D	V	I
Template Known Secondary structure							.						T	T
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		673	.	.	.	.		.	.	680	.	.	.	.