Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 580 % Identity 24% Template c3faxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:reticulocyte binding protein; PDBTitle: the crystal structure of gbs pullulanase sap in complex with2 maltotetraose Resolution 2.40 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20			.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.				.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.						.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure												.	.																										.	.	.																		.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.																										.	.	.																		.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	.	.	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	.	.	.	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	.	.	.	.	.	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P
Query Conservation												.	.																										.	.	.																		.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.																										.	.	.																		.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		N	L	G	A	V	L	N	Q	D	G	S	K	V	E	A	S	L	W	S	P	S	A	D	S	V	T	M	I	I	Y	D	K	D	N	Q	N	R	V	V	A	T	T	P	L	V	K	N	N	K	G	V	W	Q	T	I	L	D	T	K	L	G	I	K	N	Y	T	G	Y	Y	Y	L	Y	E	I	K	R	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T	S	S									T	T		S									T	T															T	T	S								G	G	G	T		S			T	T										.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140					.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.
Query Sequence		A	E	G	H	R	F	N	P	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	.	.	.	.	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A
Query Conservation																																																														.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	D	K	V	K	I	L	D	P	Y	A	K	S	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	D	S	N	T	V	N	D	D	I	K	T	A	K	A	A	F	V	N	P	S	Q	L	G	P	Q	N	L	S	F	A	K	I	A	N	F	K	G	R	Q	D	A	V	I	Y	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.									T	T		S		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			B	G	G	G			S	S			S								G	G	G	S	S		T	T							T	T			S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.												570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.									.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.
Template Sequence		H	V	R	D	F	T	S	D	Q	S	L	D	G	K	N	Q	L	G	T	F	A	A	F	.	.	S	E	K	L	D	Y	L	Q	K	L	G	V	T	H	I	Q	L	L	P	V	L	S	Y	F	Y	V	N	E	M	D	K	S	R	S	T	A	Y	T	S	S	D	N	N	Y	N	W	G	Y	D	P	Q	S	Y	F	A
Template Known Secondary structure										G	G	G						T	T	S					.	.			T								T		S					S			B		B	S	S		B	T	T							S			S	S	S		S				S		S	B	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.
Template SS confidence
		619	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.			.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.				240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.
Query SS confidence													.	.	.
Query Sequence		L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	.	.	.	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T
Query Conservation													.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																		.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		L	S	G	M	Y	S	E	K	P	K	D	P	S	A	R	I	A	E	L	K	Q	L	I	H	D	I	H	K	R	G	M	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	T	A	K	T	Y	L	.	.	.	.	.	.	F	E	D	I	E	P	N	Y	Y	H	F	M	N	E	D	G	S	P	R	E	S	F	G	.	G	G	R
Template Known Secondary structure		B		G	G	G		S		T	T	S																		T	T										S			S		T			.	.	.	.	.	.			T	T	S	T	T	T	S	B		B		T	T	S		B		B	S	S	S	.	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.							.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.		.	770	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	T	T	H	A	M	S	R	R	V	L	V	D	S	I	K	Y	L	T	S	E	F	K	V	D	G	F	R	F	D	M	M	G	D	H	D	A	A	A	I	E	L	A	Y	K	E	A	K	A	.	.	.	.	.	.	I	N	P	N	M	I	M	I	G	E	G	W	R	T	F	Q	G	D	Q	G	K	P	V	K
Template Known Secondary structure		B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	B														.	.	.	.	.	.			T	T									S					B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		772	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.							.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.
		386	.										.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.										.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																																																.	.
Template Sequence		P	A	D	Q	D	W	M	K	S	T	D	T	V	G	V	F	S	D	D	I	R	N	S	L	K	S	G	F	P	N	E	G	T	P	A	F	I	T	G	G	P	Q	S	L	Q	G	I	F	K	N	I	K	A	Q	P	G	N	F	E	A	D	S	.	.	P	G	D	V	V	Q	Y	I	A	A	H	D	N	L	T	L
Template Known Secondary structure		B	S	S	G	G	G	G	G	G		S	S																T	T	S	T	T				T	T	T	T													T	T			T	T	S			S	S	.	.	G	G	G					S			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.
Template SS confidence
		846	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.			.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	D	V	I	A	K	S	I	N	K	D	P	K	V	A	E	E	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	R	R	L	R	L	G	N	V	M	I	L	T	S	Q	G	T	A	F	I	H	S	G	Q	E	Y	G	R	T	K	R	L	L	N	P
Template Known Secondary structure										T			T	T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	S	S	S						T	T	T	T	T	T				B				G
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		924	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.
																														527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540									.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		D	Y	M	T	K	V	S	D	K	L	P	N	K	A	T	L	I	E	A	V	K	E	Y	P	Y	F	I	H	D	S	Y	D	S	S	D	A	I	N	H	F	D	W	A	A	A	T	D	N	N	K	H	P	I	S	T	K	T	Q	A	Y	T	A	G	L	I	T	L	R	R	S	T	D	A	F	R	K	L	S	.	K
Template Known Secondary structure		G	G	S	S								T	T					S	S			S	S					S		G	G	G																T	T	T																				T		T	T	S	S				.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		978	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.		.
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.						.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	.	.	.	.	.	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.																																	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.
Template Sequence		A	E	I	D	R	E	V	S	L	I	T	E	V	G	Q	G	D	I	K	E	K	.	D	L	V	I	A	Y	Q	T	I	D	S	G	D	I	Y	A	V	F	V	N	A	D	S	K	A	R	N	V	L	L	G	E	K	Y	K	H	L	L	K	G	Q	V	I	V	D	A	D	Q	A	G	I	K	P	I	S	T	P	R
Template Known Secondary structure											S	S		T	T	S	T	T			S		.		S																				S	S	S											G	G	G	G	G	S						S	S		B	S	S	S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure																							.
Template SS confidence
		1058	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.
						641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	H	F	E	K	D	S	L	L	I	D	P	L	T	A	I	V	I	K
Template Known Secondary structure		S					S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1138	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.