Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 513 % Identity 15% Template c3edeB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: structural base for cyclodextrin hydrolysis Resolution 1.71 Å

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		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E	G	H	R	F	N	P	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H
Query Conservation
Alig confidence																				.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	Q	L	M	V	H	G	R	D	I	G	R	M	E	A	A	L	.	.	D	Y	P	G	V	R	L	V	S	P	T	R	V	P	N	A	N	Y	L	F	V	D	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	P	E	A	Q	P	G	S	F	D	I	V	F	K	G	D	G	R	S	E	R	Y
Template Known Secondary structure									S	T	T	G	G	G						.	.		B	T	T										S		T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			S										T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.			40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.														.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.																.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	R	L	L	A	R	E	Q	G	S	A	Q	R	Q	G	F	G	P	G	D	.	A	I	Y	Q	I	M	P	D	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	M	R	E	Q	A	D	R	R	H	G	G	G	R	H	G	G	D	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T		T	T						T	T		.													S		G	G	G	S	S		T	T		S					T	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template SS confidence
																				87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.		.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I
Query Conservation
Alig confidence					.	.																													.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.																													.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	T	.	.	I	D	H	L	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N	D	A	A	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	R	I	D	P	R	Y	G	S	.	.	.	.	.	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	M
Template Known Secondary structure					.	.			T							T	T															S	S		.	.	.	.	.	.	.	G	G	G			S		S							T	T	T			.	.	.	.	.														T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.																													.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150			.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.								.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.						.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.								.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.												.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	.	.	.	.	.	.	.	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	K	H	H	W	W	M	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G	K	F	V	P	T	Q	H	H	R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	M	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I
Template Known Secondary structure										S	B			T	T		G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	G	G	G	G	S			B					G	G	G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	M	A	E	.	.	.	.	.	.	Y	P	R	L	N	M	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P
Template Known Secondary structure												T		S					S	S	G	G	G	S																.	.	.	.	.	.		T	T										S							T	T	S	T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.							.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T
Query Conservation
Alig confidence																			.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	M	D	F	P	L	V	D	A	M	R	N	A	L	S	K	.	T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	.	.	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	M	A	R	M	F	S	A	A	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				B															.	T	T	S	S		T	T									G	G	G	G	S	S		.	.	G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.																							.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.			.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	R	W	R	M	N	L	V	F	L	M	T	M	P	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I	L	M	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S	S	S						T	T	G	G	G	T						S	S			G	G	G	G					T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
						541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V	I	H	N	G	R	L	M	H	F	G	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	T	W	V	Y	F	R	Y	N	K	D	K	R	I	M	V	A	M	N	N	N	D	K
Template Known Secondary structure			T	T																					T															B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S	S										S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		617	.	.	620	.	.	.	.						.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	E	I	V	L	P	A	.	.	.	.	.	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation										.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	M	T	L	P	T	A	R	F	Q	E	M	L	K	G	A	P	S	G	V	D	F	L	S	G	K	T	V	G	L	G	R	E	L	R	L	A	P	K	S	V	V	V	I	E
Template Known Secondary structure							G	G	G	G					T	T						B	T	T	T							S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.