Job Description P15067 Confidence 98.77% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 116 Aligned Residues 353 % Identity 11% Template c3cc1B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:putative alpha-n-acetylgalactosaminidase; PDBTitle: crystal structure of a putative alpha-n-acetylgalactosaminidase2 (bh1870) from bacillus halodurans c-125 at 2.00 a resolution Resolution 2.00 Å

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		181	.	.	.	.	.	.					.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.
Query Sequence		H	P	V	M	I	N	Y	.	.	.	.	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I
Query Conservation									.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	G	N	A	E	Y	X	A	N	H	L	K	K	Y	G	W	E	Y	I	V	V	D	I	Q	W	Y	E	P	T	A	N	N	P	F	A	P	L	C	X	D	E	Y	G	R	L	L	P	A	T	N	R	F	P	S	A	K	N	G	.	.	.	.	.	.	A	G	F	K	P	L	S	D	A	I	H	D	L	G	L
Template Known Secondary structure													T	G	G	G	T								S		T	T		T	T				T	T					B		T	T	S		B				T	T	T		G	G	G	T	T	T	.	.	.	.	.	.	T	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.							.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.															.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	V	I	L	D	I	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	G	I	H	I	X	R	G	I	P	R	Q	A	V	Y	E	N	S	P	V	L	G	S	T	K	T	A	R	E	I	A	H	T	N	S	I	C	P	W	N	T	D	X	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	P	T	K	E	G	A	Q	S	Y	Y	N	S	L	F	E
Template Known Secondary structure									S	S									T		B		T	T	S	S		B							T	T			B	T	T	B		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R
Query Conservation
Alig confidence						.
Template Conservation						.
Template Sequence		L	Y	A	Q	.	W	G	V	D	F	V	K	V	D	D	I	A	A	S	R	L	Y	D	T	H	L	E	E	I	K	X	I	Q	R	A	I	Q	A	C	G	R	P	X	V	L	S	L	S	P	G	P	A	P	I	K	W	R	I	T	D	D	F	W	D	D	W	S	L	L	Y	Q	X	F	E	R	C	E	V	W	E
Template Known Secondary structure						.	T	T								S		S		B	T	T	B																T	S	S	S										S						T	T	S		S			S
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		171	.	.	.		.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	H	I	G	T	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	D	C	G	X	L	P	L	G	H	I	G	I	R	S	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure		T	S	S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							B			S				S	S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.																	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.																																							.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.			.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Query SS confidence																																																																							.	.
Query Sequence		G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	.	.	A	A	L	I	H	L	R	K	R
Query Conservation																																																																							.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	G	D	R	W	T	R	F	T	K	D	E	Q	L	T	X	X	N	L	W	A	I	C	H	S	P	L	X	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	D	N	D	E	W	T	L	S	L	L	T	N	E	G	I	L	S	I	N	Q	K
Template Known Secondary structure		S	S	S	S					S																T							S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.							.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	.	.	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	V	L	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	Y	R	E	E	D	K	V	A	W	A	A	N	G	R	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	Y	V	A	L	F	N	L	H	D	Q	Q	K	T	L	Q	F	R	L	D	X	V	G	I	X	E	T	V	Q	L	F	N	V	W	D
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T									S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S	S								G	G	G	T	T			S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		343	.	.	.	.													.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.										.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		635	.	.					.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.
Query Sequence		G	E	D	.	.	.	.	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation					.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	S	F	L	Q	S	L	A	P	S	E	S	F	Q	I	E	L	K	P	H	Q	S	X	X	L	K
Template Known Secondary structure										T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.