Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 429 % Identity 19% Template c3bmwA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cyclomaltodextrin glucanotransferase; PDBTitle: cyclodextrin glycosyl transferase from thermoanerobacterium2 thermosulfurigenes em1 mutant s77p complexed with a maltoheptaose3 inhibitor Resolution 1.60 Å

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		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.															.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	.	.	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.						.	.
Template Conservation																																																			.	.
Template Sequence		V	V	N	Y	S	T	D	V	I	Y	Q	I	V	T	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	T	G	D	L	Y	D	P	T	H	T	S	L	K	K	Y	F	G	G	D	W	Q	G	I	.	.	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	G	M	G	V	T	A	I	W	I	P	Q	P	V	E	N	I	Y	A	V
Template Known Secondary structure		T	T			T	T								G	G	G	T					G	G	G	S			G	G	G	B		T	T	S		S	T	T	S	B									.	.						T	S	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.			.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		209	210	.	.	.	.			.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure								.	.																																																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.																																																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	Q	R	M	G	.	.	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.																																																																				.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.																						.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	D	S	T	F	G	G	S	T	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	R	T	N	P	Y	F	G	S	.	.	.	.	.	F	T	D	F	Q	N	L	I	N	T	A	H	A	H	N	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	D	P	T	Y	A	E	N	G	R	L	Y	D	N
Template Known Secondary structure					T	T	T					S	T	T	S		S									T	T	T			.	.	.	.	.														T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T					T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.						.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
										282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.								.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	.	.	.	.	.	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	T	N	G	Y	F	H	H	Y	G	G	T	D	F	S	S	Y	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	Q	Q	N	S	T	I	D	S	Y	L	K	S	A	I	K	V	W	L	.	D	M	G	I	D	G	I	R	L	D	A	V	K	H	M	P	F	G	W	Q
Template Known Secondary structure		T						S	T	T		T	T			B			S		B			S	S	S							S	B	S	T	T				B		T	T	S																.	T	T	T							T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.				.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.
Query Sequence		F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	.	.	.	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D
Query Conservation																																		.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	F	M	D	S	I	L	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	R	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	G	T	N	E	I	D	V	N	N	T	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	S	Q	K	V	R	Q	V	F	R	D	N	T	D	T	M	Y	G	L	D	S	M	I	Q	S	T	A	S
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	S												T	T													S	S	S			B													T	S			S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250								.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	N	F	.	.	.	.	I	N	D	M	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	Y	N	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	P	V	E	Q	A	L	A	F	T
Template Known Secondary structure				T	T	.	.	.	.	G	G	G					S			T	T	S			S			S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.					.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	S	R	G	V	P	A	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G	D	.	.	.	.	.	.	P	Y	N	R	A	M	M	T	S	F	N	T	S	T	T	A	Y	N	V	I	K	K	L	A	P	L	R	K	S	N	P	A	I	A	Y	G	T	T	Q	Q	R	W	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G								T	T	S										T	T																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.							.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
		584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.							.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.							.	.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	.	.	.	.	.	.	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	.	.	.	.	.	.	A	V	W	Q	G	P	A	H	G
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	V	Y	I	Y	E	R	K	F	G	N	N	V	A	L	V	A	I	N	R	N	L	S	T	S	Y	N	I	T	G	L	Y	T	A	L	P	A	G	T	Y	T	D	V	L	G	G	L	L	N	G	N	S	I	S	V	A	S	D	G	S	V	T	P	F	T	L	S	A	G	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S									T	T											S	S							S		B		S	S		S						T	T	T	T	T	T	S								T	T	S	B	B							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		652	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	V	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	A	V	W
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		487	.	.	490